SEPX1 - SEPX1

MSRB1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3MAO
Идентификаторы
Псевдонимы	MSRB1, SELR, SELX, SEPX1, SepR, HSPC270, метионинсульфоксидредуктаза B1
Внешние идентификаторы	OMIM: 606216 MGI: 1351642 ГомолоГен: 8455 Генные карты: MSRB1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16p13.3 Начинать 1,938,210 бп[1] Конец 1,943,326 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 A3.3 | 17 12,53 см Начинать 24,736,642 бп[2] Конец 24,742,778 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • оксидоредуктазная активность, действующая на серную группу доноров, дисульфид в качестве акцептора • оксидоредуктазная активность • связывание актина • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • активность метионин-R-сульфоксидредуктазы • пептид-метионин (R) -S-оксидредуктазная активность • L-метионин- (R) -S-оксидредуктазная активность • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • цитоскелет • ядро клетки • актиновый цитоскелет • клеточный компонент Биологический процесс • иммунная система • полимеризация актиновых филаментов • врожденная иммунная система • окислительно-восстановительный процесс • ответ на окислительный стресс • восстановление белков Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51734	27361
Ансамбль	ENSG00000198736	ENSMUSG00000075705
UniProt	Q9NZV6	Q9JLC3
RefSeq (мРНК)	NM_016332 NM_001382264 NM_001382265	NM_013759 NM_001346668
RefSeq (белок)	NP_057416 NP_001369193 NP_001369194	NP_001333597 NP_038787
Расположение (UCSC)	Chr 16: 1.94 - 1.94 Мб	Chr 17: 24,74 - 24,74 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Метионин-R-сульфоксидредуктаза B1 является фермент что у людей кодируется SEPX1 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует селенопротеин, который содержит остаток селеноцистеина (Sec) на своем активном сайте. Селеноцистеин кодируется кодоном UGA, который обычно сигнализирует о завершении трансляции. 3 'UTR генов селенопротеинов имеют общую структуру стебель-петля, последовательность вставки sec (SECIS), которая необходима для распознавания UGA как кодона Sec, а не как стоп-сигнал. Этот белок относится к сульфоксид метионина редуктазы B (MsrB), и она экспрессируется во множестве тканей взрослого человека и плода.^[6]

Смотрите также

• MSRA (ген)
• MSRB2
• Окисление метионина

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198736 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000075705 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Lescure A, Gautheret D, Carbon P, Krol A (февраль 2000 г.). «Новые селенопротеины, идентифицированные in silico и in vivo с использованием консервативного структурного мотива РНК». J Biol Chem. 274 (53): 38147–54. Дои:10.1074 / jbc.274.53.38147. PMID  10608886.
6. «Энтрез Ген: селенопротеин X SEPX1, 1».

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Крюков Г.В., Крюков В.М., Гладышев В.Н. (1999). «Новые белки, содержащие селеноцистеин млекопитающих, идентифицированные с помощью алгоритма, который ищет элементы последовательности вставки селеноцистеина». J. Biol. Chem. 274 (48): 33888–97. Дои:10.1074 / jbc.274.48.33888. PMID  10567350.
• Чжан К.Х., Е М., Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Дэниэлс Р. Дж., Педен Дж. Ф., Ллойд С. и др. (2001). «Последовательность, структура и патология полностью аннотированного терминала 2 Mb короткого плеча хромосомы 16 человека». Гм. Мол. Genet. 10 (4): 339–52. Дои:10.1093 / hmg / 10.4.339. PMID  11157797.
• Московиц Дж., Сингх В.К., Рекена Дж. И др. (2002). «Очистка и характеристика метионинсульфоксидредуктаз от мышей и Staphylococcus aureus и их стереоспецифичность к субстрату». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 290 (1): 62–5. Дои:10.1006 / bbrc.2001.6171. PMID  11779133.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ким Х.Ю., Гладышев В.Н. (2004). «Восстановление метионин сульфоксида у млекопитающих: характеристика метионин-R-сульфоксидредуктазы». Мол. Биол. Клетка. 15 (3): 1055–64. Дои:10.1091 / mbc.E03-08-0629. ЧВК  363075. PMID  14699060.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.