Репликационный белок A2 - Replication protein A2

RPA2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1ДПУ, 1L1O, 1QUQ, 1Z1D, 2PI2, 2PQA, 2Z6K, 3КДФ, 4MQV, 4OU0
Идентификаторы
Псевдонимы	RPA2, REPA2, RP-A p32, RP-A p34, RPA32, белок репликации A2
Внешние идентификаторы	OMIM: 179836 MGI: 1339939 ГомолоГен: 37712 Генные карты: RPA2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п35.3 Начинать 27,891,524 бп[1] Конец 27,914,746 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 D2.3 Начинать 132,768,332 бп[2] Конец 132,778,752 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание с N-концом белка • связывание одноцепочечной ДНК • повреждение связывания ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ферментов • связывание протеинфосфатазы • связывание убиквитин-протеин-лигазы • Связывание G-богатой цепи теломерной ДНК • связывание двухцепочечной ДНК • последовательное связывание ДНК Сотовый компонент • место двухцепочечного разрыва • Тело PML • нуклеоплазма • хромосома, теломерная область • Комплекс фактора репликации ДНК А • хроматин • ядро клетки • ядерная хромосома, теломерная область • ядерное тело • конденсированная ядерная хромосома Биологический процесс • эксцизионная репарация нуклеотидов, заполнение пробелов в ДНК • Рекомбинация ДНК • ремонт межнитевых сшивок • регуляция репарации двухцепочечных разрывов посредством гомологичной рекомбинации • безошибочный транслезионный синтез • Фаза G1 • склонный к ошибкам транслезионный синтез • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • Репликация ДНК • контрольная точка митотического повреждения ДНК G1 • регулирование контрольной точки повреждения ДНК • регуляция клеточного ответа на тепло • ремонт несоответствия • транслезионный синтез • транскрипционно-связанная эксцизионная репарация нуклеотидов • эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК • Ответ на повреждение ДНК, обнаружение повреждения ДНК • базовая эксцизионная пластика • эксцизионная репарация нуклеотидов • нуклеотидно-эксцизионная репарация, стабилизация предразрезного комплекса • регуляция передачи сигнала медиатором класса p53 • Ремонт ДНК • репарация двухцепочечных разрывов посредством гомологичной рекомбинации • нуклеотидно-эксцизионная репарация, сборка комплекса до разреза • эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК, 5'-очаг поражения • нуклеотидно-эксцизионная репарация, разрез ДНК, поражение 3'-к • локализация белка в хромосоме • поддержание теломер • поддержание теломер посредством полуконсервативной репликации • G1 / S переход митотического клеточного цикла • поддержание теломер посредством рекомбинации • Топологическое изменение ДНК • Раскручивание ДНК участвует в репликации ДНК • митотическая рекомбинация • поддержание теломер через теломеразу • реципрокная мейотическая рекомбинация • образование гетеродуплекса • положительная регуляция активности геликазы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6118	19891
Ансамбль	ENSG00000117748	ENSMUSG00000028884
UniProt	P15927	Q62193
RefSeq (мРНК)	NM_001286076 NM_001297558 NM_002946 NM_001355128 NM_001355129	NM_011284
RefSeq (белок)	NP_001273005 NP_001284487 NP_002937 NP_001342057 NP_001342058	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 1: 27,89 - 27,91 Мб	Chr 4: 132,77 - 132,78 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Репликационный белок A субъединица 32 кДа это белок что у людей кодируется RPA2 ген.^[5][6]

Взаимодействия

RPA2 был показан взаимодействовать с:

• Циклин О,^[7]
• ДНК-PKcs,^[8]
• Ku70,^[8]
• MEN1,^[9]
• RPA3,^[10][11]
• Белок репликации A1,^[8][10]
• STAT3,^[12]
• TP53BP1^[13] и
• Урацил-ДНК гликозилаза.^[14]

Смотрите также

• Одноцепочечный связывающий белок
• Репликационный белок А
• Белок репликации A1
• Репликационный белок A3

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000117748 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028884 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Umbricht CB, Erdile LF, Jabs EW, Kelly TJ (март 1993 г.). «Клонирование, сверхэкспрессия и геномное картирование 14-кДа субъединицы человеческого белка репликации А». Журнал биологической химии. 268 (9): 6131–8. PMID  8454588.
6. «Ген Entrez: репликационный белок А2 RPA2, 32 кДа».
7. Оттерлей М., Варбрик Э., Нагельхус Т.А., Хауг Т., Слуппхауг Г., Акбари М., Аас П.А., Стейнсбек К., Бакке О., Крокан Х.Э. (июль 1999 г.). «Пострепликативная эксцизионная репарация оснований в очагах репликации». Журнал EMBO. 18 (13): 3834–44. Дои:10.1093 / emboj / 18.13.3834. ЧВК  1171460. PMID  10393198.
8. Шао Р.Г., Цао С.Х., Чжан Х., Кон К.В., Уолд М.С., Помье Й. (март 1999 г.). «Опосредованное репликацией повреждение ДНК камптотецином вызывает фосфорилирование RPA ДНК-зависимой протеинкиназой и диссоциирует комплексы RPA: ДНК-PK». Журнал EMBO. 18 (5): 1397–406. Дои:10.1093 / emboj / 18.5.1397. ЧВК  1171229. PMID  10064605.
9. Суходолец К.Е., Хикман А.Б., Агарвал С.К., Суходолец М.В., Обунгу В.Х., Новотный Э.А., Крабтри Дж. С., Чандрасекхараппа С. К., Коллинз Ф. С., Шпигель А. М., Бернс А. Л., Маркс С. Дж. (Январь 2003 г.). «32-килодальтонная субъединица репликационного белка А взаимодействует с менином, продуктом гена-супрессора опухоли MEN1». Молекулярная и клеточная биология. 23 (2): 493–509. Дои:10.1128 / mcb.23.2.493-509.2003. ЧВК  151531. PMID  12509449.
10. Бочкарева Е., Королев С., Лис-Миллер С.П., Бочкарев А. (апрель 2002 г.). «Структура ядра тримеризации RPA и его роль в многоступенчатом ДНК-связывающем механизме RPA». Журнал EMBO. 21 (7): 1855–63. Дои:10.1093 / emboj / 21.7.1855. ЧВК  125950. PMID  11927569.
11. Бочкарева Е., Фраппье Л., Эдвардс А.М., Бочкарев А. (февраль 1998 г.). «Субъединица RPA32 репликационного белка А человека содержит одноцепочечный ДНК-связывающий домен». Журнал биологической химии. 273 (7): 3932–6. Дои:10.1074 / jbc.273.7.3932. PMID  9461578.
12. Ким Дж., Ким Д., Чанг Дж. (2000). «Репликационный белок субъединицы 32 кДа (RPA p32) связывает SH2-домен STAT3 и регулирует его транскрипционную активность». Cell Biology International. 24 (7): 467–73. Дои:10.1006 / cbir.2000.0525. PMID  10875894.
13. Ю И, Ким БУ, Ли Си, Чо Ч, Чунг Дж. Х., Ли Ч. (август 2005 г.). «53BP1 связан с репликационным белком А и необходим для гиперфосфорилирования RPA2 после повреждения ДНК». Онкоген. 24 (35): 5423–30. Дои:10.1038 / sj.onc.1208710. PMID  15856006.
14. Нагельхус Т.А., Хауг Т., Сингх К.К., Кешав К.Ф., Скорпен Ф., Оттерлей М., Бхарати С., Линдмо Т., Бенишоу С., Бенарус Р., Крокан Х.Э. (март 1997 г.). «Последовательность в N-концевой области урацил-ДНК-гликозилазы человека, гомологичная XPA, взаимодействует с C-концевой частью субъединицы 34 кДа репликационного белка A». Журнал биологической химии. 272 (10): 6561–6. Дои:10.1074 / jbc.272.10.6561. PMID  9045683.

дальнейшее чтение

• Датта А., Стиллман Б. (июнь 1992 г.). «Киназы семейства cdc2 фосфорилируют фактор репликации ДНК клетки человека, RPA, и активируют репликацию ДНК». Журнал EMBO. 11 (6): 2189–99. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05278.x. ЧВК  556686. PMID  1318195.
• Эрдайл Л.Ф., Уолд М.С., Келли Т.Дж. (февраль 1990 г.). «Первичная структура субъединицы 32 кДа репликационного белка А человека». Журнал биологической химии. 265 (6): 3177–82. PMID  2406247.
• Ли Л., Лу Х, Петерсон, Калифорния, Легерски Р.Дж. (октябрь 1995 г.). «Взаимодействие между фактором репарации ДНК XPA и репликационным белком А, по-видимому, необходимо для эксцизионной репарации нуклеотидов». Молекулярная и клеточная биология. 15 (10): 5396–402. Дои:10.1128 / mcb.15.10.5396. ЧВК  230789. PMID  7565690.
• Umbricht CB, Griffin CA, Hawkins AL, Grzeschik KH, O'Connell P, Leach R, Green ED, Kelly TJ (март 1994). «Геномное картирование с высоким разрешением трех генов человеческого белка репликации А (RPA1, RPA2 и RPA3)». Геномика. 20 (2): 249–57. Дои:10.1006 / geno.1994.1161. PMID  8020972.
• Нагельхус Т.А., Хауг Т., Сингх К.К., Кешав К.Ф., Скорпен Ф., Оттерлей М., Бхарати С., Линдмо Т., Бенишоу С., Бенарус Р., Крокан Х.Э. (март 1997 г.). «Последовательность в N-концевой области урацил-ДНК гликозилазы человека с гомологией XPA взаимодействует с C-концевой частью субъединицы 34 кДа репликационного белка A». Журнал биологической химии. 272 (10): 6561–6. Дои:10.1074 / jbc.272.10.6561. PMID  9045683.
• Amacker M, Hottiger M, Mossi R, Hübscher U (март 1997 г.). «Белок нуклеокапсида ВИЧ-1 и белок репликации А влияют на синтез ДНК смещения цепи лентивирусной обратной транскриптазы». СПИД. 11 (4): 534–6. PMID  9084803.
• Niu H, Erdjument-Bromage H, Pan ZQ, Lee SH, Tempst P, Hurwitz J (май 1997 г.). «Картирование аминокислотных остатков в субъединице p34 одноцепочечного ДНК-связывающего белка человека, фосфорилированного ДНК-зависимой протеинкиназой и киназой Cdc2 in vitro». Журнал биологической химии. 272 (19): 12634–41. Дои:10.1074 / jbc.272.19.12634. PMID  9139719.
• Зерник-Кобак М., Васуниа К., Коннелли М., Андерсон К.В., Диксон К. (сентябрь 1997 г.). «Сайты УФ-индуцированного фосфорилирования субъединицы p34 репликационного белка А из клеток HeLa». Журнал биологической химии. 272 (38): 23896–904. Дои:10.1074 / jbc.272.38.23896. PMID  9295339.
• Бочкарева Е., Фраппье Л., Эдвардс А.М., Бочкарев А. (февраль 1998 г.). «Субъединица RPA32 репликационного белка А человека содержит одноцепочечный ДНК-связывающий домен». Журнал биологической химии. 273 (7): 3932–6. Дои:10.1074 / jbc.273.7.3932. PMID  9461578.
• Шао Р.Г., Цао С.Х., Чжан Х., Кон К.В., Уолд М.С., Помье Й. (март 1999 г.). «Опосредованное репликацией повреждение ДНК камптотецином вызывает фосфорилирование RPA ДНК-зависимой протеинкиназой и диссоциирует комплексы RPA: ДНК-PK». Журнал EMBO. 18 (5): 1397–406. Дои:10.1093 / emboj / 18.5.1397. ЧВК  1171229. PMID  10064605.
• Оттерлей М., Варбрик Э., Нагельхус Т.А., Хауг Т., Слуппхауг Г., Акбари М., Аас П.А., Стейнсбек К., Бакке О., Крокан Х.Э. (июль 1999 г.). «Пострепликативная эксцизионная репарация оснований в очагах репликации». Журнал EMBO. 18 (13): 3834–44. Дои:10.1093 / emboj / 18.13.3834. ЧВК  1171460. PMID  10393198.
• Бочкарев A, Бочкарева E, Frappier L, Edwards AM (август 1999 г.). «Кристаллическая структура комплекса субъединиц репликационного белка А RPA32 и RPA14 раскрывает механизм связывания одноцепочечной ДНК». Журнал EMBO. 18 (16): 4498–504. Дои:10.1093 / emboj / 18.16.4498. ЧВК  1171524. PMID  10449415.
• Лао Й, Гомес XV, Рен Й, Тейлор Дж. С., Уолд М.С. (февраль 2000 г.). «Взаимодействие белка репликации А с ДНК. III. Молекулярные основы распознавания поврежденной ДНК». Биохимия. 39 (5): 850–9. Дои:10.1021 / bi991704s. PMID  10653628.
• Костелло Дж. Ф., Фрювальд МС, Смираглия Д. Дж., Раш Л. Дж., Робертсон Г. П., Гао Х, Райт Ф. А., Ферамиско Д. Д., Пелтомяки П., Ланг Дж. К., Шуллер Д. Е., Ю. Л., Bloomfield CD, Калиджури М. А., Йетс А., Нишикава Р., Су Хуанг H, Петрелли, штат Нью-Джерси, Чжан X, О'Дорисио, М.С., Хелд, Вашингтон, Кавени, В.К., Пласс С. (февраль 2000 г.). «Аберрантное метилирование CpG-островков имеет неслучайные и специфичные для опухолевого типа паттерны». Природа Генетика. 24 (2): 132–8. Дои:10.1038/72785. PMID  10655057.
• Ким Дж, Ким Д., Чанг Дж (2000). «Репликационный белок субъединицы 32 кДа (RPA p32) связывает SH2-домен STAT3 и регулирует его транскрипционную активность». Cell Biology International. 24 (7): 467–73. Дои:10.1006 / cbir.2000.0525. PMID  10875894.
• Cho JM, Song DJ, Bergeron J, Benlimame N, Wold MS, Alaoui-Jamali MA (сентябрь 2000 г.). «RBT1, новый коактиватор транскрипции, связывает вторую субъединицу белка репликации А». Исследования нуклеиновых кислот. 28 (18): 3478–85. Дои:10.1093 / nar / 28.18.3478. ЧВК  110737. PMID  10982866.
• Brush GS, Kelly TJ (октябрь 2000 г.). «Фосфорилирование белка репликации большой субъединицы в ответе контрольной точки Saccharomyces cerevisiae». Исследования нуклеиновых кислот. 28 (19): 3725–32. Дои:10.1093 / nar / 28.19.3725. ЧВК  110765. PMID  11000264.
• Мер Г., Бочкарев А., Гупта Р., Бочкарева Е., Фраппье Л., Инглес С.Дж., Эдвардс А.М., Чазин В.Дж. (октябрь 2000 г.). «Структурная основа распознавания белков репарации ДНК UNG2, XPA и RAD52 фактором репликации RPA». Клетка. 103 (3): 449–56. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 00136-7. PMID  11081631.
• Habel JE, Ohren JF, Borgstahl GE (февраль 2001 г.). «Динамический светорассеивающий анализ полноразмерного димера RPA14 / 32 человека: очистка, кристаллизация и самоассоциация». Acta Crystallographica Раздел D. 57 (Pt 2): 254–9. Дои:10.1107 / S0907444900015225. PMID  11173472.