RAB18 - RAB18

RAB18
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1X3S
Идентификаторы
Псевдонимы	RAB18, RAB18LI1, WARBM3, член семейства онкогенов RAS
Внешние идентификаторы	OMIM: 602207 MGI: 102790 ГомолоГен: 40765 Генные карты: RAB18
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10п12.1 Начните 27,504,174 бп[1] Конец 27,542,237 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • Связывание GTP • GO: 0001948 связывание с белками • Привязка к ВВП • ГТФазная активность Сотовый компонент • внутриклеточный • мембрана • трубчатая сеть эндоплазматического ретикулума • цитозоль • мембрана эндоплазматического ретикулума • клеточная мембрана • секреторная мембрана гранул • аппарат Гольджи • синапс Биологический процесс • развитие глаз • транспорт белка • развитие многоклеточного организма • организация трубчатой ​​сети эндоплазматического ретикулума • развитие мозга • организация липидных частиц • дегрануляция нейтрофилов • передача сигнала, опосредованная малой GTPase • ядерный импорт • внутриклеточный транспорт белка • Передача сигнала белка Rab Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	22931	19330
Ансамбль	ENSG00000099246	ENSMUSG00000073639
UniProt	Q9NP72	P35293
RefSeq (мРНК)	NM_001256410 NM_001256411 NM_001256412 NM_001256415 NM_021252	NM_001278447 NM_181070
RefSeq (белок)	NP_001243339 NP_001243340 NP_001243341 NP_001243344 NP_067075	NP_001265376 NP_851415
Расположение (UCSC)	Chr 10: 27,5 - 27,54 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Связанный с Ras белок Rab-18 это белок что у людей кодируется RAB18 ген.^[4][5]

Rab18 - это повсеместно экспрессируемый белок с особенно высокой экспрессией в мозг.^[6] Rab18 впервые был охарактеризован как эндосомный белок в эпителиальный клетки почек и кишечника мыши.^[6] Последующие исследования показали, что Rab18 имеет широкое внутриклеточное распределение; локализация на аппарат Гольджи, эндоплазматический ретикулум, липидные капли и цитозоль различных типов клеток.^[7][8][9] В головном мозге Rab18 был изолирован вместе с синаптические везикулы^[10][11] и обнаружено, что он локализуется в секреторных гранулах нейроэндокринных клеток.^[12]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000099246 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Schafer U, Seibold S, Schneider A, Neugebauer E (февраль 2000 г.). «Выделение и характеристика человеческого гена rab18 после стимуляции эндотелиальных клеток гистамином». FEBS Lett. 466 (1): 148–54. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01778-0. PMID  10648831. S2CID  31093183.
5. «Ген Entrez: RAB18 RAB18, член семейства онкогенов RAS».
6. Лютке А., Партон Р., Мерфи К., Олкконен В. М., Дюпри П., Валенсия А., Симонс К., Зериал М. (декабрь 1994 г.). «Клонирование и субклеточная локализация новых кроличьих белков выявляет поляризованную и специфичную для клеточного типа экспрессию». J. Cell Sci. 107 (12): 3437–48. PMID  7706395.
7. Дейгаард С.Ю., Муршид А., Эрман А., Кизилай О., Вербич Д., Лодж Р., Дейгаард К., Ли-Хартиг Т. Б., Пепперкок Р., Симпсон Дж. С., Пресли Дж. Ф. (август 2008 г.). «Rab18 и Rab43 играют ключевую роль в торговле людьми ER-Golgi». J. Cell Sci. 121 (Pt 16): 2768–81. Дои:10.1242 / jcs.021808. PMID  18664496.
8. Мартин С., Дриссен К., Никсон С.Дж., Зериал М., Партон Р.Г. (декабрь 2005 г.). «Регулируемая локализация Rab18 в липидных каплях: эффекты липолитической стимуляции и ингибирования катаболизма липидных капель» (PDF). J. Biol. Chem. 280 (51): 42325–35. Дои:10.1074 / jbc.M506651200. PMID  16207721. S2CID  30398568.
9. Озэки С., Ченг Дж., Таучи-Сато К., Хатано Н., Танигучи Х., Фудзимото Т. (июнь 2005 г.). «Rab18 локализуется в липидных каплях и вызывает их близкое прилегание к мембране, происходящей из эндоплазматического ретикулума». J. Cell Sci. 118 (Pt 12): 2601–11. Дои:10.1242 / jcs.02401. PMID  15914536.
10. Бурре Дж., Бекхаус Т., Корви С., Карас М., Циммерманн Х., Волкнандт В. (сентябрь 2006 г.). «Белки синаптических везикул в условиях покоя и активации: анализ методом 2-D разностного гель-электрофореза». Электрофорез. 27 (17): 3488–96. Дои:10.1002 / elps.200500864. PMID  16944461. S2CID  43618245.
11. Takamori S, Holt M, Stenius K, Lemke EA, Grønborg M, Riedel D, Urlaub H, Schenck S, Brügger B, Ringler P, Müller SA, Rammner B, Gräter F, Hub JS, De Groot BL, Mieskes G, Moriyama Y, Klingauf J, Grubmüller H, Heuser J, Wieland F, Jahn R (ноябрь 2006 г.). «Молекулярная анатомия органелл трафика». Ячейка. 127 (4): 831–46. Дои:10.1016 / j.cell.2006.10.030. HDL:11858 / 00-001M-0000-0012-E357-D. PMID  17110340. S2CID  6703431.
12. Васкес-Мартинес Р., Крус-Гарсия Д., Дюран-Прадо М., Пейнадо Дж. Р., Кастаньо Дж. П., Малагон М. М. (июль 2007 г.). «Rab18 подавляет секреторную активность нейроэндокринных клеток, взаимодействуя с секреторными гранулами». Движение. 8 (7): 867–82. Дои:10.1111 / j.1600-0854.2007.00570.x. PMID  17488286. S2CID  9987968.

дальнейшее чтение

• Адамс, доктор медицины, Керлаваж А.Р., Флейшманн, Р.Д. и др. (1995). «Первоначальная оценка разнообразия генов человека и паттернов экспрессии на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК» (PDF). Природа. 377 (6547 Прил.): 3–174. PMID  7566098.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Хиллер Л.Д., Леннон Г., Беккер М. и др. (1997). «Создание и анализ 280 000 тегов последовательности, экспрессируемых человеком». Genome Res. 6 (9): 807–28. Дои:10.1101 / гр.6.9.807. PMID  8889549.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Ху RM, Хан ZG, Song HD и др. (2000). «Профили экспрессии генов в оси гипоталамус-гипофиз-надпочечники человека и клонирование полноразмерной кДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (17): 9543–8. Дои:10.1073 / pnas.160270997. ЧВК  16901. PMID  10931946.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Берендс Ю., Шнайдер И., Рёсслер С. и др. (2003). «Новые опухолевые антигены, идентифицированные путем скрининга аутологичных антител в библиотеках кДНК медуллобластомы детского возраста». Int. J. Рак. 106 (2): 244–51. Дои:10.1002 / ijc.11208. PMID  12800201. S2CID  36836051.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Делукас П., Earthrowl ME, Grafham DV, et al. (2004). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 10 человека». Природа. 429 (6990): 375–81. Дои:10.1038 / природа02462. PMID  15164054.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Dou T, Ji C, Gu S и др. (2006). «Клонирование и характеристика нового варианта сплайсинга человеческого гена Rab18 (RAB18)». ДНК Seq. 16 (3): 230–4. Дои:10.1080/10425170500061681. PMID  16147880. S2CID  45143893.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.