Транспептидаза для сортировки белков - Protein-sorting transpeptidase
А протеин-сортирующая транспептидаза является фермент, такой как сортировка SrtA[1] из Золотистый стафилококк, который расщепляет один или несколько белков-мишеней, продуцируемых одной и той же клеткой, как часть специализированного пути нацеливание на белок. Типичная прокариотическая транспептидаза, сортирующая белок, характеризуется как протеаза, но не просто гидролизует пептидную связь. Вместо этого более крупная N-концевая часть расщепленного полипептида переносится на другую молекулу, такую как предшественник пептидогликан клеточная стенка в Грамположительные бактерии.
Период, термин сортировка правильно зарезервирован для набора цистеиновая протеаза ферменты sortase A, sortase B, и члены дополнительных классов, все из которых имеют гомологию. Однако у прокариот описывается все большее количество дополнительных систем сортировки белков, включающих ферменты сортировки, которые не обладают какой-либо гомологией с сортировкой и которые, по-видимому, возникли отдельно благодаря конвергентная эволюция. Хотя сортазы являются наиболее хорошо описанными членами транспептидаз, сортирующих белок, работают над аналогичными ферментами. археосортаза[2], ромбосортаза[3], а фермент PorU типа IX системы секреции (T9SS)[4] накапливается.
| сортирующий фермент | механизм | родственный сигнал сортировки |
|---|---|---|
| sortase A | цистеиновая протеаза | LPXTG |
| sortase B | цистеиновая протеаза | NPQTN |
| археосортаза А | цистеиновая протеаза | PGF-CTERM |
| экзосортаза А | цистеиновая протеаза | PEP-CTERM |
| ромбосортаза | сериновая протеаза | GlyGly-CTERM |
| PorU как в Porphyromonas gingivalis | сериновая протеаза | T9SS C-терминальный бета-сэндвич-домен |
Рекомендации
- ^ Zong Y, Bice TW, Ton-That H, Schneewind O, Narayana SV (2004). «Кристаллические структуры сортазы A Staphylococcus aureus и его субстратного комплекса». J Biol Chem. 279 (30): 31383–9. Дои:10.1074 / jbc.M401374200. PMID 15117963.
- ^ Абдул Халим М.Ф., Родригес Р., Штольцфус Д.Д., Дуггин И.Г., Полшредер М. (2018). «Сохраненные остатки имеют решающее значение для каталитической активности археосортазы Haloferax volcanii: последствия для конвергентной эволюции каталитических механизмов негомологичных сортаз из архей и бактерий». Мол Микробиол. 108 (3): 276–287. Дои:10,1111 / мми.13935. PMID 29465796.
- ^ Гадвал С., Джонсон Т.Л., Реммер Х., Сандквист М. (2018). «С-концевой процессинг GlyGly-CTERM-содержащих белков ромбосортазой в Vibrio cholerae». PLoS Pathog. 14 (10): e1007341. Дои:10.1371 / journal.ppat.1007341. ЧВК 6219818. PMID 30352106.
- ^ de Diego I, Ksiazek M, Mizgalska D, Koneru L, Golik P, Szmigielski B, et al. (2016). «Сигнал экспорта внешней мембраны системы секреции Porphyromonas gingivalis типа IX (T9SS) представляет собой консервативный С-концевой β-сэндвич-домен». Научный представитель. 6: 23123. Дои:10.1038 / srep23123. ЧВК 4804311. PMID 27005013.