Пикромицин - Pikromycin

Пикромицин

Имена
Название ИЮПАК (3р,5р,6S,7S,9р,11E,13S,14р) -14-этил-13-гидрокси-3,5,7,9,13-пентаметил-2,4,10-триоксооксациклотетрадек-11-ен-6-ил 3,4,6-тридеокси-3- (диметиламино) -β-D-ксил-гексопиранозид
Другие имена Пикромицин
Идентификаторы
Количество CAS	19721-56-3 Y
3D модель (JSmol )	Интерактивное изображение
ЧЭБИ	ЧЕБИ: 29665 N
ChemSpider	4445267 Y
PubChem CID	5282037
UNII	FBM8G3Z439 Y
ИнЧИ InChI = 1S / C28H47NO8 / c1-10-22-28 (7,34) 12-11-21 (30) 15 (2) 13-16 (3) 25 (18 (5) 23 (31) 19 (6) 26 (33) 36-22) 37-27-24 (32) 20 (29 (8) 9) 14-17 (4) 35-27 / ч 11-12,15-20,22,24-25,27, 32,34H, 10,13-14H2,1-9H3 / b12-11 + / t15-, 16 +, 17-, 18 +, 19-, 20 +, 22-, 24-, 25 +, 27 +, 28 + / м1 / с1 Y Ключ: UZQBOFAUUTZOQE-VSLWXVDYSA-N Y InChI = 1S / C28H47NO8 / c1-10-22-28 (7,34) 12-11-21 (30) 15 (2) 13-16 (3) 25 (18 (5) 23 (31) 19 (6) 26 (33) 36-22) 37-27-24 (32) 20 (29 (8) 9) 14-17 (4) 35-27 / ч 11-12,15-20,22,24-25,27, 32,34H, 10,13-14H2,1-9H3 / b12-11 + / t15-, 16 +, 17-, 18 +, 19-, 20 +, 22-, 24-, 25 +, 27 +, 28 + / м1 / с1
Улыбки O = C2 [C @@ H] ([C @@ H] (O [C @@ H] 1O [C @@ H] (C [C @ H] (N (C) C) [C @ H] 1O) C) [C @@ H] (C) C [C @ H] (C (= O) / C = C / [C @@] (O) (C) [C @ H] (OC (= O) [C @@ H] 2C) CC) C) C
Характеристики
Химическая формула	C28ЧАС47NО8
Молярная масса	525.683 г · моль^−1
Если не указано иное, данные для материалов приведены в их стандартное состояние (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
N проверять (что YN ?)
Ссылки на инфобоксы

Пикромицин был изучен Брокманном и Хекелем в 1951 году и был первым антибиотиком. макролид быть изолированным.^[1]Пикромицин синтезируется через тип I поликетидсинтаза система в Streptomyces venezuelae, разновидность Грамположительный бактерия рода Streptomyces.^[2]Пикромицин получают из нарбонолид, 14-членный кольцевой макролид.^[3]Помимо нарбонолидного остова, пикромицин включает десозаминовый сахар и гидроксильную группу. Хотя пикромицин не является клинически полезным антибиотиком, его можно использовать в качестве сырья для синтеза кетолидных соединений антибиотиков, таких как эритромицины и новые эпотилоны.^[4]

Биосинтез

Пикромицин поликетидсинтаза Streptomyces venezuelae содержит четыре полипептида: PikAI, PikAII, PikAIII и PikAIV. Эти полипептиды содержат загрузочный модуль, шесть удлинительных молекул и тиоэстераза домен, который завершил процедуру биосинтеза.^[5]Недавно электронная криомикроскопия была использована для определения трехмерных реконструкций с субнанометровым разрешением полноразмерного модуля PKS из бактерии Streptomyces venezuelae, которая обнаружила неожиданно другую архитектуру.^[6]На рисунке 1 каждый кружок соответствует мутилифукционному белку PKS, где ACP - это белок-носитель ацила, KS представляет собой кето-ACP-синтазу, KSQ представляет собой домен, подобный кето-ACP-синтазе, AT представляет собой ацилтрансферазу, KR представляет собой кето-ACP-редуктазу, KR с перекрестным неактивным KR, DH представляет собой гидроксилтиоэфирдегидратазу, ER представляет собой еноилредуктазу, TEI представляет собой тиоэстеразу домен I, TEII - тиоэстераза II типа. ^[7]Des соответствует ферментам, используемым в биосинтезе и переносе дезозамина, включая DesI-DesVIII.

На рис. 2 представлен путь биосинтеза дезоксаминосахара дезозамина. DesI-DesVI (место расположения пикромицина PKS) кодирует все ферменты, необходимые для получения TDP-дезоамина из TDP-глюкозы. Активности DesVII и DesVIII переводят дезоамин в нарбонолид и получают нарбомицин. Гидролаза цитохрома P450 PikC катализирует гидроксилирование нарбомицина с получением пикромицина.^[8]

Рисунок 1: Доменная организация ПКС для нарбонолида, предшественника пикромицина

Рисунок 2: Образование пикромицина посредством пути биосинтеза дезозамин-дезоксиаминосахара

Смотрите также

• Поликетидсинтаза

Рекомендации

1. Брокманн, Х. и Хенкель, В. (1951). «Пикромицин, ein bitter schmeckendes Antibioticum aus Actinomyceten». ntibiotica aus Actinomyceten. 84: 184–288. Дои:10.1002 / cber.19510840306.
2. Ю. Сюэ и Д. Шерман (2001). «Биосинтез и комбинаторный биосинтез макролидов, связанных с пикромицином в Streptomyces venezuelae». Метаболическая инженерия. 3: 15–26. Дои:10.1006 / мбн.2000.0167.
3. Маэдзава, Т. Хори, А. Кинумаки и М. Судзуки (1973). «Биологическое превращение нарбонолида в пикромицин». Журнал антибиотиков. 26: 771–775. Дои:10.7164 / антибиотики. 26.771. PMID  4792390.
4. Дж. Д. Киттендорф и Д. Х. Шерман (2009). «Путь биосинтеза метимицина / пикромицина: модель метаболического разнообразия в натуральном продукте». Биоорг Мед Хим. 17: 2137–2146. Дои:10.1016 / j.bmc.2008.10.082. ЧВК  2843759. PMID  19027305.
5. С. Гуптаа; В. Лакшманан; Б.С. Кима; Р. Фесик и К. А. Рейнольдс (2008). «Создание новых антибиотиков пикромицина посредством мутасинтеза». ChemBioChem. 10: 1609–1616. Дои:10.1002 / cbic.200700635. ЧВК  2614871. PMID  18512859.
6. С. Дутта; Дж. Р. Уичер; Д. А. Хансен; В. А. Хейл; Дж. А. Хемлер; Г. Р. Конгдон; А. Р. Х. Нараян; К. Хоканссон; Д. Х. Шерман; Дж. Л. Смит; Г. Скиниотис (2014). «Структура амодулярной поликетидсинтазы». Природа. 510: 512–517. Дои:10.1038 / природа13423. ЧВК  4278352. PMID  24965652.
7. D.L. Ключ; J.D. Киттендорф; J.W. Жиральдес; Р.А. Fecik; Д. Х. Шерман и Дж. Л. Смит (2006). «Структурная основа макролактонизации пикромицинтиоэстеразой». Природа Химическая Биология. 2: 537–542. Дои:10.1038 / nchembio824. PMID  16969372.
8. Ю. Сюэ и Д. Шерман (2001). «Биосинтез и комбинаторный биосинтез макролидов, связанных с пикромицином в Streptomyces venezuelae». Метаболическая инженерия. 3: 15–26. Дои:10.1006 / мбн.2000.0167.