Перфорин - Perforin

Не путать с Порфирин.

PRF1
Идентификаторы
Псевдонимы	PRF1, FLH2, HPLH2, P1, PFN1, PFP, перфорин 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 170280 MGI: 97551 ГомолоГен: 3698 Генные карты: PRF1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q22.1 Начинать 70,597,348 бп[1] Конец 70,602,759 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 B4 | 10 32,18 см Начинать 61,297,833 бп[2] Конец 61,304,680 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • связывание ионов кальция • активность широкопорового канала • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • внеклеточная область • эндосома • клеточная мембрана • просвет эндосомы • мембрана • цитозоль • цитоплазматический пузырек • цитолитическая гранула Биологический процесс • ответ клеточной защиты • формирование иммунологического синапса • цитолиз • апоптотический процесс • трансмембранный транспорт • положительная регуляция убийства клеток другого организма • защитный ответ на опухолевую клетку • иммунный ответ на опухолевую клетку • гомоолигомеризация белков • защитный ответ на вирус • Цитотоксичность, опосредованная Т-клетками Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5551	18646
Ансамбль	ENSG00000180644	ENSMUSG00000037202
UniProt	P14222	P10820
RefSeq (мРНК)	NM_005041 NM_001083116	NM_011073
RefSeq (белок)	NP_001076585 NP_005032	NP_035203
Расположение (UCSC)	Chr 10: 70,6 - 70,6 Мб	Chr 10: 61,3 - 61,3 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Перфорин-1 это белок что у людей кодируется PRF1 ген и Прф1 ген у мышей.^[5][6][7]

Функция

Перфорин - порообразующий цитолитический белок содержится в гранулах цитотоксические Т-лимфоциты (CTL) и естественные клетки-киллеры (NK-клетки). На дегрануляция перфорин связывается с клетками-мишенями плазматическая мембрана, и олигомеризуется Ca2 + -зависимым образом с образованием пор на клетке-мишени. Образовавшаяся пора делает возможным пассивную диффузию семейства проапоптотических протеаз, известных как гранзимы, в целевую ячейку.^[8] Литическая часть перфорина, внедряющая мембрану, является MACPF домен.^[9] Этот регион имеет гомологию с холестерин-зависимым цитолизины от грамположительных бактерий.^[10]

Перфорин имеет структурное и функциональное сходство с дополнительный компонент 9 (С9). Как и C9, этот белок создает трансмембранный трубочки и способен неспецифически лизировать множество клеток-мишеней. Этот белок является одним из основных цитолитических белков цитолитических гранул и, как известно, является ключевой эффекторной молекулой для цитолиза, опосредованного Т-клетками и естественными клетками-киллерами.^[7] Считается, что перфорин действует путем создания отверстий в плазматической мембране, что вызывает приток кальция и запускает механизмы восстановления мембраны. Эти механизмы восстановления переносят перфорин и гранзимы в ранние эндосомы.^[11]

Клиническое значение

Гомозиготное наследование дефектных PRF1 аллели приводят к развитию семейный гемофагоцитарный лимфогистиоцитоз тип 2 (FHL2), редкое и летальное аутосомно-рецессивное заболевание младенчества.^[7]

Взаимодействия

Перфорин был показан взаимодействовать с кальретикулин.^[12]

Смотрите также

• Гранзимы
• Дефенсин
• Комплекс атаки комплемента мембраны

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000180644 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037202 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Fink TM, Zimmer M, Weitz S, Tschopp J, Jenne DE, Lichter P (сентябрь 1992 г.). «Человеческий перфорин (PRF1) отображается на 10q22, область, которая является синтеничной с хромосомой 10 мыши». Геномика. 13 (4): 1300–2. Дои:10.1016/0888-7543(92)90050-3. PMID  1505959.
6. Синкай Й., Йошида М.С., Маэда К., Кобата Т., Маруяма К., Йодой Дж., Ягита Х., Окумура К. (январь 1990 г.). «Молекулярное клонирование и хромосомное отнесение гена перфорина человека (PFP)». Иммуногенетика. 30 (6): 452–7. Дои:10.1007 / BF02421177. PMID  2592021. S2CID  35292868.
7. «Ген Entrez: перфорин 1 PRF1 (порообразующий белок)».
8. Трапани Дж. А. (1996). «Апоптоз клеток-мишеней, индуцированный цитотоксическими Т-клетками и естественными клетками-киллерами, включает синергию между порообразующим белком, перфорином, и сериновой протеазой, гранзимом В». Австралийский и новозеландский медицинский журнал. 25 (6): 793–9. Дои:10.1111 / j.1445-5994.1995.tb02883.x. PMID  8770355.
9. Чопп Дж, Массон Д., Стэнли К.К. (1986). «Структурное / функциональное сходство между белками, участвующими в цитолизе, опосредованном комплементом и цитотоксическими Т-лимфоцитами». Природа. 322 (6082): 831–4. Bibcode:1986Натура.322..831Т. Дои:10.1038 / 322831a0. PMID  2427956. S2CID  4330219.
10. Rosado CJ, Buckle AM, Law RH, Butcher RE, Kan WT, Bird CH, Ung K, Browne KA, Baran K, Bashtannyk-Puhalovich TA, Faux NG, Wong W, Porter CJ, Pike RN, Ellisdon AM, Pearce MC, Боттомли С.П., Эмсли Дж., Смит А.И., Россджон Дж., Хартланд Э.Л., Воскобойник И., Трапани Дж. А., Берд П.И., Данстон М.А., Уиссток Дж.С. (2007). «Общая складка опосредует защиту позвоночных и бактериальную атаку». Наука. 317 (5844): 1548–51. Bibcode:2007Научный ... 317.1548R. Дои:10.1126 / science.1144706. PMID  17717151. S2CID  20372720.
11. Тиери Дж., Киф Д., Булан С., Букро Э., Уолч М., Мартинвалет Д., Гопинг И.С., Блекли Р.С., Кирххаузен Т., Либерман Дж. (2011). «Поры перфорина в эндосомной мембране запускают высвобождение эндоцитированного гранзима B в цитозоль клеток-мишеней». Nat. Иммунол. 12 (8): 770–7. Дои:10.1038 / ni.2050. ЧВК  3140544. PMID  21685908.
12. Андрин С., Пинкоски М.Дж., Бернс К. и др. (Июль 1998 г.). «Взаимодействие между Ca2 +-связывающим белком кальретикулином и перфорином, компонентом цитотоксических Т-клеточных гранул». Биохимия. 37 (29): 10386–94. Дои:10.1021 / bi980595z. PMID  9671507.

дальнейшее чтение

• Трапани Дж. А. (1996). «Апоптоз клеток-мишеней, индуцированный цитотоксическими Т-клетками и естественными клетками-киллерами, включает синергию между порообразующим белком, перфорином, и сериновой протеазой, гранзимом В». Австралийский и новозеландский медицинский журнал. 25 (6): 793–9. Дои:10.1111 / j.1445-5994.1995.tb02883.x. PMID  8770355.
• Peitsch MC, Amiguet P, Guy R et al. (1990). «Локализация и молекулярное моделирование встроенного в мембрану домена девятого компонента человеческого комплемента и перфорина». Мол. Иммунол. 27 (7): 589–602. Дои:10.1016 / 0161-5890 (90) 90001-Г. PMID  2395434.
• Молодой JD, Хенгартнер H, Podack ER, Cohn ZA (1986). «Очистка и характеристика цитолитического порообразующего белка из гранул клонированных лимфоцитов с природной киллерной активностью». Клетка. 44 (6): 849–59. Дои:10.1016/0092-8674(86)90007-3. PMID  2420467. S2CID  30182487.
• Янг JD, Кон З.А., Podack ER (1986). «Девятый компонент комплемента и порообразующий белок (перфорин 1) из цитотоксических Т-клеток: структурное, иммунологическое и функциональное сходство». Наука. 233 (4760): 184–90. Дои:10.1126 / science.2425429. PMID  2425429.
• Лихтенхельд MG, Podack ER (1990). «Структура гена перфорина человека. Простая организация гена с интересными потенциальными регуляторными последовательностями». J. Immunol. 143 (12): 4267–74. PMID  2480391.
• Синкай Ю., Такио К., Окумура К. (1988). «Гомология перфорина девятому компоненту комплемента (C9)». Природа. 334 (6182): 525–7. Bibcode:1988Натура.334..525С. Дои:10.1038 / 334525a0. PMID  3261391. S2CID  4348928.
• Лихтенхельд М.Г., Олсен К.Дж., Лу П. и др. (1988). «Структура и функции перфорина человека». Природа. 335 (6189): 448–51. Bibcode:1988Натура.335..448л. Дои:10.1038 / 335448a0. PMID  3419519. S2CID  4359028.
• Goebel WS, Schloemer RH, Brahmi Z (1996). «Индуцированный клеткой-мишенью оборот мРНК перфорина в клетках NK3.3 опосредуется множеством элементов в кодирующей области мРНК». Мол. Иммунол. 33 (4–5): 341–9. Дои:10.1016/0161-5890(95)00155-7. PMID  8676885.
• Нёске К., Билзер Т., Планц О, Штиц Л. (1998). "Вирус-специфические CD4 + Т-клетки устраняют вирус болезни Борна из мозга посредством индукции цитотоксических CD8 + Т-клеток". Дж. Вирол. 72 (5): 4387–95. Дои:10.1128 / JVI.72.5.4387-4395.1998. ЧВК  109669. PMID  9557729.
• Андрин С., Пинкоски М.Дж., Бернс К. и др. (1998). «Взаимодействие между Ca2 +-связывающим белком кальретикулином и перфорином, компонентом цитотоксических Т-клеточных гранул». Биохимия. 37 (29): 10386–94. Дои:10.1021 / bi980595z. PMID  9671507.
• Ю. ЧР, Ортальдо Дж. Р., Куриэль Р. Э. и др. (1999). «Роль сайта связывания STAT в регуляции промотора перфорина человека». J. Immunol. 162 (5): 2785–90. PMID  10072525.
• Степп С.Е., Дюфурк-Лагелуз Р., Ле Деист Ф. и др. (1999). «Дефекты гена перфорина в семейном гемофагоцитарном лимфогистиоцитозе». Наука. 286 (5446): 1957–9. Дои:10.1126 / science.286.5446.1957. PMID  10583959.
• Такахаши Т., Ниеда М., Коэдзука Ю. и др. (2000). «Анализ человеческих V-альфа 24+ CD4 + NKT-клеток, активированных дендритными клетками, полученными из моноцитов с импульсным воздействием альфа-гликозилцерамида». J. Immunol. 164 (9): 4458–64. Дои:10.4049 / jimmunol.164.9.4458. PMID  10779745.
• Бадовинац В.П., Твиннереим А.Р., Харти Дж. Т. (2000). «Регулирование антиген-специфического гомеостаза CD8 + Т-клеток перфорином и интерфероном-гамма». Наука. 290 (5495): 1354–8. Bibcode:2000Sci ... 290.1354B. Дои:10.1126 / science.290.5495.1354. PMID  11082062.
• Горансдоттер Эриксон К., Фадил Б., Нильссон-Арднор С. и др. (2001). «Спектр мутаций гена перфорина при семейном гемофагоцитарном лимфогистиоцитозе». Являюсь. J. Hum. Genet. 68 (3): 590–7. Дои:10.1086/318796. ЧВК  1274472. PMID  11179007.
• Клементи Р., Цур Штадт Ю., Савольди Г. и др. (2002). «Шесть новых мутаций в гене PRF1 у детей с гемофагоцитарным лимфогистиоцитозом». J. Med. Genet. 38 (9): 643–6. Дои:10.1136 / jmg.38.9.643. ЧВК  1734943. PMID  11565555.
• Амбах А, Боннекох Б., Голльник Х (2001). «Высвобождение гранул перфорина из цитотоксических лимфоцитов ex vivo ингибируется циклоспорином, но не метотрексатом». Skin Pharmacol. Appl. Skin Physiol. 14 (5): 249–60. Дои:10.1159/000056355. PMID  11586066. S2CID  30142804.

внешняя ссылка

• перфорин в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Перфорин в NLM Домашний справочник по генетике