PPP5C - PPP5C

PPP5C
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1A17, 1С95, 1WAO, 2BUG, 3H60, 3H61, 3H62, 3H63, 3H64, 3H66, 3H67, 3H68, 3H69, 4ZX2, 4ЗВЗ
Идентификаторы
Псевдонимы	PPP5C, PP5, PPP5, PPT, каталитическая субъединица протеинфосфатазы 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 600658 MGI: 102666 ГомолоГен: 4550 Генные карты: PPP5C
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.32 Начинать 46,347,087 бп[1] Конец 46,392,981 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 A2 | 7 9,15 см Начинать 17,004,640 бп[2] Конец 17,027,924 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • фосфопротеинфосфатазная активность • связывание с белками теплового шока • связывание микротрубочек • Связывание ADP • активность протеин-серин / треонинфосфатазы • активность преобразователя сигнала • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • идентичное связывание с белками • Связывание альфа-субъединицы G-белка • гидролазная активность • Связывание АТФ • связывание липидов • Связывание с белком Hsp90 Сотовый компонент • перикарион • мембрана • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • клеточная мембрана • тело нейрональной клетки • проксимальный дендрит • проекция нейрона • ядро клетки • периферия клетки • нуклеоплазма • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • отрицательная регуляция фосфорилирования белков • положительная регуляция сигнального пути глюкокортикоидных рецепторов • гетероолигомеризация белков • дефосфорилирование белков • отрицательная регуляция гибели клеток • клеточный ответ на ион кадмия • транскрипция, ДНК-шаблон • Каскад MAPK • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • дефосфорилирование гистонов • ответ на морфин • реакция на ион свинца • олигомеризация белков • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • клеточный ответ на перекись водорода • отрицательная регуляция гибели нейронов • Ремонт ДНК • GO: 0007067 митотический клеточный цикл Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5536	19060
Ансамбль	ENSG00000011485	ENSMUSG00000003099
UniProt	P53041	Q60676
RefSeq (мРНК)	NM_006247 NM_001204284	NM_011155
RefSeq (белок)	NP_001191213 NP_006238	NP_035285
Расположение (UCSC)	Chr 19: 46.35 - 46.39 Мб	Chr 7: 17 - 17,03 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Серин / треонин-протеинфосфатаза 5 является фермент что у людей кодируется PPP5C ген.^[5][6]

Модельные организмы

Ppp5c нокаутный фенотип мыши

Характеристика	Фенотип
Гомозигота жизнеспособность	Нормальный
Гомозиготная фертильность	Нормальный
Масса тела	Аномальный[7]
Беспокойство	Нормальный
Неврологический осмотр	Нормальный
Сила захвата	Нормальный
Горячая тарелка	Нормальный
Дисморфология	Нормальный[8]
Косвенная калориметрия	Аномальный[9]
Тест толерантности к глюкозе	Нормальный
Слуховой ответ ствола мозга	Нормальный
DEXA	Аномальный[10]
Рентгенография	Аномальный[11]
Температура тела	Нормальный
Морфология глаза	Нормальный
Клиническая химия	Нормальный
Плазма иммуноглобулины	Нормальный
Гематология	Нормальный
Лимфоциты периферической крови	Аномальный[12]
Микроядерный тест	Нормальный
Вес сердца	Нормальный
Эпидермис хвоста цельный	Нормальный
Гистопатология кожи	Нормальный
Гистопатология головного мозга	Нормальный
МикроКТ и количественный факситрон	Нормальный
Citrobacter инфекционное заболевание	Нормальный[13]
Все тесты и анализы от[14][15]

Модельные организмы были использованы при изучении функции PPP5C. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Ppp5c^{tm1a (EUCOMM) Wtsi[16][17]} был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.^[18][19][20]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.^[14][21] Было проведено двадцать пять испытаний мутант мышей и пять значительных аномалий.^[14] Гомозиготный самцы-мутанты имели уменьшенную массу тела, длину тела и респираторный коэффициент. У обоих полов увеличилось Т-клетка числа и ряд скелетных аномалий, идентифицированных рентгенография.^[14]

Взаимодействия

PPP5C показал себя взаимодействовать с ASK1,^[22] CRY2^[23] GNA12.^[24] и Rac1,^[25]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000011485 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000003099 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Yong WH, Ueki K, Chou D., Reeves SA, von Deimling A, Gusella JF, Mohrenweiser HW, Buckler AJ, Louis DN (сентябрь 1995 г.). «Клонирование высококонсервативного гена серин-треонинфосфатазы человека из кандидатной области глиомы на хромосоме 19q13.3». Геномика. 29 (2): 533–6. Дои:10.1006 / geno.1995.9972. PMID  8666404.
6. «Ген Entrez: протеинфосфатаза 5 PPP5C, каталитическая субъединица».
7. «Данные о массе тела для Ppp5c». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
8. «Данные дисморфологии для Ppp5c». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
9. «Данные косвенной калориметрии для Ppp5c». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
10. «Данные DEXA для Ppp5c». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
11. «Данные рентгенографии для Ppp5c». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
12. «Данные лимфоцитов периферической крови для Ppp5c». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
13. "Citrobacter данные о заражении Ppp5c ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
14. Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
15. Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
16. «Международный консорциум нокаут-мышей».
17. "Информатика генома мыши".
18. Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
19. Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
20. Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
21. ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геномная биология. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.
22. Морита К., Сайто М., Тобиуме К., Мацуура Х., Эномото С., Нишито Х., Итиджо Х. (ноябрь 2001 г.). «Регулирование отрицательной обратной связи ASK1 протеинфосфатазой 5 (PP5) в ответ на окислительный стресс». Журнал EMBO. 20 (21): 6028–36. Дои:10.1093 / emboj / 20.21.6028. ЧВК  125685. PMID  11689443.
23. Чжао С., Санкар А. (ноябрь 1997 г.). «Человеческий фоторецептор синего света hCRY2 специфически взаимодействует с протеином серин / треонинфосфатазой 5 и модулирует его активность». Фотохимия и фотобиология. 66 (5): 727–31. Дои:10.1111 / j.1751-1097.1997.tb03214.x. PMID  9383998. S2CID  32804361.
24. Ямагути Ю., Като Х, Мори К., Негиси М. (август 2002 г.). «Galpha (12) и Galpha (13) взаимодействуют с протеинфосфатазой Ser / Thr типа 5 и стимулируют ее фосфатазную активность». Текущая биология. 12 (15): 1353–8. Дои:10.1016 / S0960-9822 (02) 01034-5. PMID  12176367. S2CID  11485795.
25. Чаттерджи А., Ван Л., Армстронг Д. Л., Росси С. (февраль 2010 г.). «Активированная ГТФаза Rac1 перемещает протеинфосфатазу 5 на клеточную мембрану и стимулирует активность фосфатазы in vitro». Журнал биологической химии. 285 (6): 3872–82. Дои:10.1074 / jbc.M109.088427. ЧВК  2823530. PMID  19948726.

дальнейшее чтение

• Чен М.Х., Макпартлин А.Э., Браун Л., Чен Ю.Х., Баркер Н.М., Коэн П.Т. (сентябрь 1994 г.). «Новая человеческая протеин-серин / треонинфосфатаза, которая имеет четыре мотива тетратрикопептидных повторов и локализуется в ядре». Журнал EMBO. 13 (18): 4278–90. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06748.x. ЧВК  395355. PMID  7925273.
• Скиннер Дж., Синклер С., Ромео С., Армстронг Д., Шарбонно Х., Росси С. (сентябрь 1997 г.). «Очистка протеин-серин / треонинфосфатазы, стимулированной жирными кислотами, из головного мозга крупного рогатого скота и ее идентификация в качестве гомолога протеинфосфатазы 5». Журнал биологической химии. 272 (36): 22464–71. Дои:10.1074 / jbc.272.36.22464. PMID  9278397.
• Shah BH, Catt KJ (декабрь 2006 г.). «Протеиновая фосфатаза 5 как негативный ключевой регулятор активации Raf-1». Тенденции в эндокринологии и метаболизме. 17 (10): 382–4. Дои:10.1016 / j.tem.2006.10.013. PMID  17084641. S2CID  45060016.
• Годерт М., Коэн Э.С., Джейкс Р., Коэн П. (ноябрь 1992 г.). «Сайты фосфорилирования киназы p42 MAP в ассоциированном с микротрубочками белке тау дефосфорилируются протеинфосфатазой 2A1. Последствия для болезни Альцгеймера [исправлено]». Письма FEBS. 312 (1): 95–9. Дои:10.1016 / 0014-5793 (92) 81418-Л. PMID  1330687. S2CID  34940651.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Xu X, Lagercrantz J, Zickert P, Bajalica-Lagercrantz S, Zetterberg A (январь 1996 г.). «Хромосомная локализация и 5'-последовательность гена 5 'человеческого белка серин / треонинфосфатазы». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 218 (2): 514–7. Дои:10.1006 / bbrc.1996.0092. PMID  8561788.
• Сильверштейн А.М., Галигниана М.С., Чен М.С., Оуэнс-Грилло Дж.К., Чинкерс М., Пратт В.Б. (июнь 1997 г.). «Протеиновая фосфатаза 5 является основным компонентом рецептора глюкокортикоидов. Hsp90 комплексы со свойствами иммунофилина, связывающего FK506». Журнал биологической химии. 272 (26): 16224–30. Дои:10.1074 / jbc.272.26.16224. PMID  9195923.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Чжао С., Санкар А. (ноябрь 1997 г.). «Человеческий фоторецептор синего света hCRY2 специфически взаимодействует с протеином серин / треонинфосфатазой 5 и модулирует его активность». Фотохимия и фотобиология. 66 (5): 727–31. Дои:10.1111 / j.1751-1097.1997.tb03214.x. PMID  9383998. S2CID  32804361.
• Оллендорф В., Донохью ди-джей (декабрь 1997 г.). «Серин / треониновая фосфатаза PP5 взаимодействует с CDC16 и CDC27, двумя субъединицами комплекса, стимулирующего анафазу, содержащими тетратрикопептидные повторы». Журнал биологической химии. 272 (51): 32011–8. Дои:10.1074 / jbc.272.51.32011. PMID  9405394.
• Дас А.К., Коэн П.В., Барфорд Д. (март 1998 г.). «Структура тетратрикопептидных повторов протеинфосфатазы 5: значение для межбелковых взаимодействий, опосредованных TPR». Журнал EMBO. 17 (5): 1192–9. Дои:10.1093 / emboj / 17.5.1192. ЧВК  1170467. PMID  9482716.
• Рассел Л.С., Уитт С.Р., Чен М.С., Чинкерс М. (июль 1999 г.). «Идентификация консервативных остатков, необходимых для связывания повторяющегося домена тетратрикопептида с белком теплового шока 90». Журнал биологической химии. 274 (29): 20060–3. Дои:10.1074 / jbc.274.29.20060. PMID  10400612.
• Люберт EJ, Hong Y, Sarge KD (октябрь 2001 г.). «Взаимодействие между протеинфосфатазой 5 и A-субъединицей протеинфосфатазы 2A: данные о гетеротримерной форме протеинфосфатазы 5». Журнал биологической химии. 276 (42): 38582–7. Дои:10.1074 / jbc.M106906200. PMID  11504734.
• Морита К., Сайто М., Тобиуме К., Мацуура Х., Эномото С., Нишито Х., Итиджо Х. (ноябрь 2001 г.). «Регулирование отрицательной обратной связи ASK1 протеинфосфатазой 5 (PP5) в ответ на окислительный стресс». Журнал EMBO. 20 (21): 6028–36. Дои:10.1093 / emboj / 20.21.6028. ЧВК  125685. PMID  11689443.
• Санчес-Ортис Э., Хам Б.К., Армстронг Д.Л., Росси С. (октябрь 2009 г.). «Протеиновая фосфатаза 5 защищает нейроны от токсичности бета-амилоида». Журнал нейрохимии. 111 (2): 391–402. Дои:10.1111 / j.1471-4159.2009.06337.x. ЧВК  3044491. PMID  19686245.
• Ямагути Ю., Като Х, Мори К., Негиси М. (август 2002 г.). «Galpha (12) и Galpha (13) взаимодействуют с протеинфосфатазой Ser / Thr типа 5 и стимулируют ее фосфатазную активность». Текущая биология. 12 (15): 1353–8. Дои:10.1016 / S0960-9822 (02) 01034-5. PMID  12176367. S2CID  11485795.
• Джентиле С., Дарден Т., Эркслебен С., Ромео С., Руссо А., Мартин Н., Росси С., Армстронг Д.Л. (март 2006 г.). «Передача сигналов Rac GTPase через протеинфосфатазу PP5». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 103 (13): 5202–6. Дои:10.1073 / pnas.0600080103. ЧВК  1458818. PMID  16549782.
• Лю Ф., Зайди Т., Икбал К., Грундке-Икбал И., Гонг С.Х. (2003). «Аберрантное гликозилирование модулирует фосфорилирование тау протеинкиназой А и дефосфорилирование тау протеинфосфатазой 2А и 5». Неврология. 115 (3): 829–37. Дои:10.1016 / S0306-4522 (02) 00510-9. PMID  12435421. S2CID  26118803.
• Urban G, Golden T, Aragon IV, Cowsert L, Cooper SR, Dean NM, Honkanen RE (март 2003 г.). «Идентификация функциональной связи белка-супрессора опухоли p53 в подавлении роста, индуцированном дексаметазоном». Журнал биологической химии. 278 (11): 9747–53. Дои:10.1074 / jbc.M210993200. PMID  12519780.
• Томсиг Дж. Л., Снайдер С. Л., Creutz CE (март 2003 г.). «Идентификация мишеней для передачи сигналов кальция через семейство белков копина. Характеристика спиралевидного копин-связывающего мотива». Журнал биологической химии. 278 (12): 10048–54. Дои:10.1074 / jbc.M212632200. PMID  12522145.
• Мацуда А., Сузуки Ю., Хонда Дж., Мурамацу С., Мацузаки О, Нагано Ю., Дои Т., Шимотохно К., Харада Т., Нисида Е., Хаяси Н., Сугано С. (май 2003 г.). «Крупномасштабная идентификация и характеристика человеческих генов, активирующих сигнальные пути NF-kappaB и MAPK». Онкоген. 22 (21): 3307–18. Дои:10.1038 / sj.onc.1206406. PMID  12761501.