PIP4K2B - PIP4K2B

PIP4K2B
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1BO1, 3WZZ, 3X01, 3X02, 3X03, 3X04, 3X05, 3X06, 3X07, 3X08, 3X09, 3X0A, 3X0B, 3X0C
Идентификаторы
Псевдонимы	PIP4K2B, PI5P4KB, PIP5K2B, PIP5KIIB, PIP5KIIbeta, PIP5P4KB, фосфатидилинозитол-5-фосфат 4-киназа типа 2 бета
Внешние идентификаторы	OMIM: 603261 MGI: 1934234 ГомолоГен: 2634 Генные карты: PIP4K2B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q12 Начинать 38,765,689 бп[1] Конец 38,800,126 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 D | 11 61,07 см Начинать 97,715,157 бп[2] Конец 97,744,704 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • 1-фосфатидилинозитол-4-фосфат-5-киназная активность • киназная активность • активность фосфатидилинозитфосфаткиназы • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ • 1-фосфатидилинозитол-3-фосфат-4-киназная активность • Активность 1-фосфатидилинозитол-5-фосфат-4-киназы • активность гомодимеризации белков Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • клеточная мембрана • аутофагосома • эндоплазматический ретикулум • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • фосфатидилинозит метаболический процесс • положительная регуляция сборки аутофагосом • фосфорилирование • сигнальный путь рецептора клеточной поверхности • регуляция аутофагии • процесс биосинтеза фосфатидилинозита • фосфатидилинозитол фосфорилирование • регуляция передачи сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы • фосфолипидный метаболический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8396	108083
Ансамбль	ENSG00000277292 ENSG00000276293	ENSMUSG00000018547
UniProt	P78356	Q80XI4
RefSeq (мРНК)	NM_003559 NM_138687	NM_054051
RefSeq (белок)	NP_003550	NP_473392
Расположение (UCSC)	Chr 17: 38,77 - 38,8 Мб	Chr 11: 97,72 - 97,74 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фосфатидилинозитол-5-фосфат-4-киназа типа 2 бета является фермент что у людей кодируется PIP4K2B ген.^[5][6][7][8]

Белок, кодируемый этим геном, катализирует фосфорилирование из фосфатидилинозитол 4-фосфат на пятом гидроксил из мио-инозитол кольцо, чтобы сформировать фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфат. Этот ген является членом фосфатидилинозитол-4-фосфат-5-киназа семья. Кодируемая последовательность белка не обнаруживает сходства с другими киназы, но белок действительно проявляет киназную активность. Кроме того, кодируемый белок взаимодействует с p55 рецептор TNF.^[8]

Взаимодействия

PIP4K2B был показан взаимодействовать с TNFRSF1A.^[5] Кроме того, было показано, что PIP4K2B взаимодействует с PIP4K2A и может модулировать клеточную локализацию PIP4K2A.^[9]

Структура

Структура PIP4K2B была определена посредством Рентгеновская кристаллография.^[10]

Рекомендации

1. ENSG00000276293 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000277292, ENSG00000276293 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018547 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Кастеллино AM, Паркер GJ, Вороненков IV, Андерсон Р.А., Чао М.В. (апрель 1997 г.). «Новое взаимодействие между юкстамембранной областью рецептора фактора некроза опухоли p55 и фосфатидилинозитол-4-фосфат-5-киназой». J Biol Chem. 272 (9): 5861–70. Дои:10.1074 / jbc.272.9.5861. PMID  9038203.
6. Луох SW, Венкатесан Н., Трипати Р. (февраль 2004 г.). «Сверхэкспрессия амплифицированного гена Pip4k2beta из 17q11-12 в клетках рака молочной железы дает преимущество в пролиферации». Онкоген. 23 (7): 1354–63. Дои:10.1038 / sj.onc.1207251. PMID  14691457.
7. Рамех Л.Е., Толиас К.Ф., Дакворт, Британская Колумбия, Кэнтли, LC (ноябрь 1997 г.). «Новый путь синтеза фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфата». Природа. 390 (6656): 192–6. Bibcode:1997Натура.390..192р. Дои:10.1038/36621. PMID  9367159. S2CID  4403301.
8. «Ген Entrez: PIP5K2B фосфатидилинозитол-4-фосфат-5-киназа, тип II, бета».
9. Бульцма, Иветт; Кеуне, Виллем-Ян; Дивеча, Нуллин (01.09.2010). «PIP4Kβ взаимодействует с и модулирует ядерную локализацию высокоактивной изоформы PtdIns5P-4-киназы PIP4Kα». Биохимический журнал. 430 (2): 223–235. Дои:10.1042 / bj20100341. ISSN  0264-6021. PMID  20583997.
10. Рао, Вибха Д; Мисра, Саурав; Вороненков, Игорь В; Андерсон, Ричард А; Херли, Джеймс Х (1998). «Структура типа IIβ фосфатидилинозитолфосфаткиназы». Клетка. 94 (6): 829–839. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 81741-9. PMID  9753329. S2CID  18221569.

дальнейшее чтение

• Нииро Х., Кларк Э.А. (2003). «Ветви пути В-клеточного рецептора антигена направляются белковыми каналами Bam32 и Carma1». Иммунитет. 19 (5): 637–40. Дои:10.1016 / S1074-7613 (03) 00303-0. PMID  14614850.
• Карпентер К.Л. (2004). «Btk-зависимая регуляция синтеза фосфоинозитидов». Biochem. Soc. Транс. 32 (Пт 2): 326–9. Дои:10.1042 / BST0320326. PMID  15046600.
• Рао В.Д., Мисра С., Вороненков И.В. и др. (1998). «Структура типа IIbeta-фосфатидилинозитолфосфаткиназы: складка протеинкиназы, уплощенная для межфазного фосфорилирования». Клетка. 94 (6): 829–39. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81741-9. PMID  9753329. S2CID  18221569.
• Вороненков И.В., Лойенс Дж. К., Умеда М., Андерсон Р. А. (1999). «Пути передачи сигналов фосфоинозитидов в ядрах связаны с ядерными спеклами, содержащими факторы процессинга пре-мРНК». Мол. Биол. Клетка. 9 (12): 3547–60. Дои:10.1091 / mbc.9.12.3547. ЧВК  25675. PMID  9843587.
• Куценко А.С., Гизатуллин Р.З., Аль-Амин А.Н. и др. (2002). «Фланкирующие последовательности NotI: инструмент для открытия генов и проверки генома человека». Нуклеиновые кислоты Res. 30 (14): 3163–70. Дои:10.1093 / nar / gkf428. ЧВК  135748. PMID  12136098.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть межбелкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Ричардсон Дж. П., Ван М., Кларк Дж. Х. и др. (2007). «Геномное мечение эндогенной бета-фосфатидилинозитол-5-фосфат-4-киназы типа II в клетках DT40 выявляет ядерную локализацию». Клетка. Сигнал. 19 (6): 1309–14. Дои:10.1016 / j.cellsig.2007.01.010. ЧВК  1868964. PMID  17303380.