Кластер метаболических генов - Metabolic gene cluster

Не путать с кластер генов или же оперон.

Кластеры метаболических генов или же кластеры биосинтетических генов представляют собой тесно связанные наборы в основном негомологичных генов, участвующих в общем дискретном метаболическом пути. Гены находятся в непосредственной близости друг от друга в геноме, и их экспрессия часто регулируется.[1][2][3] Кластеры метаболических генов - общие черты бактериальный[4] и большинство грибковый[5] геномы и реже встречаются в других[6] организмы. Они наиболее широко известны производством вторичные метаболиты, которые являются источником или основой большинства фармацевтический соединения, натуральные токсины, а также химическая связь и химическая война между организмами. Кластеры метаболических генов также участвуют в усвоении питательных веществ, деградации токсинов,[7] устойчивость к противомикробным препаратам и биосинтез витаминов.[5]

Рекомендации

  1. ^ Schläpfer P, Zhang P, Wang C, Kim T., Banf M, Chae L. и др. (Апрель 2017 г.). «Полногеномное прогнозирование метаболических ферментов, путей и кластеров генов в растениях». Физиология растений. 173 (4): 2041–2059. Дои:10.1104 / стр. 16.01942. ЧВК  5373064. PMID  28228535.
  2. ^ Миллер Б.Л., Миллер К.Ю., Роберти К.А., Тимберлейк В.Е. (январь 1987 г.). «Позиционно-зависимые и независимые механизмы регулируют клеточно-специфическую экспрессию кластера генов SpoC1 Aspergillus nidulans». Молекулярная и клеточная биология. 7 (1): 427–34. Дои:10.1128 / MCB.7.1.427. ЧВК  365085. PMID  3550422.
  3. ^ Банф М., Чжао К., Ри С.Ю. (сентябрь 2019 г.). «Пакет METACLUSTER-an R для контекстно-зависимого анализа экспрессии кластеров метаболических генов». Биоинформатика. 35 (17): 3178–3180. Дои:10.1093 / биоинформатика / btz021. ЧВК  6735823. PMID  30657869.
  4. ^ Cimermancic P, Medema MH, Claesen J, Kurita K, Wieland Brown LC, Mavrommatis K и др. (Июль 2014 г.). «Понимание вторичного метаболизма на основе глобального анализа кластеров генов биосинтеза прокариот». Клетка. 158 (2): 412–421. Дои:10.1016 / j.cell.2014.06.034. ЧВК  4123684. PMID  25036635.
  5. ^ а б Слот JC (2017). «Разнообразие и эволюция грибковых кластеров генов». Достижения в генетике. 100: 141–178. Дои:10.1016 / bs.adgen.2017.09.005. ISBN  9780128132616. PMID  29153399.
  6. ^ Wisecaver JH, Borowsky AT, Tzin V, Jander G, Kliebenstein DJ, Rokas A (май 2017 г.). «Подход глобальной сети коэкспрессии для подключения генов к специализированным метаболическим путям у растений». Растительная клетка. 29 (5): 944–959. Дои:10.1105 / tpc.17.00009. ЧВК  5466033. PMID  28408660.
  7. ^ Глюк-Талер Э, Слот JC (июнь 2018 г.). «Специализированная биохимия растений стимулирует кластеризацию генов в грибах». Журнал ISME. 12 (7): 1694–1705. Дои:10.1038 / с41396-018-0075-3. ЧВК  6018750. PMID  29463891.