MCC (ген) - MCC (gene)

MCC
Идентификаторы
Псевдонимы	MCC, MCC1, мутировавший при колоректальном раке, регулятор сигнального пути WNT, регулятор MCC сигнального пути WNT
Внешние идентификаторы	OMIM: 159350 MGI: 96930 ГомолоГен: 20539 Генные карты: MCC
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q22.2 Начните 113,022,099 бп[1] Конец 113,488,823 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 18 (мышь)[2] Группа 18 B3 | 18 23,74 см Начните 44,425,060 бп[2] Конец 44,812,182 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • сигнальная активность рецептора Сотовый компонент • цитоплазма • клеточная мембрана • проекция клетки • мембрана • ядро клетки • ламеллиподиум • нуклеоплазма • цитозоль Биологический процесс • установление локализации белка • отрицательная регуляция пролиферации эпителиальных клеток • отрицательная регуляция миграции эпителиальных клеток • Сигнальный путь Wnt • отрицательная регуляция канонического сигнального пути Wnt • преобразование сигнала Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	4163	328949
Ансамбль	ENSG00000171444	ENSMUSG00000071856
UniProt	P23508	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001085377 NM_002387	NM_001033406 NM_001085373 NM_001085374
RefSeq (белок)	NP_001078846 NP_002378	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 5: 113.02 - 113.49 Мб	Chr 18: 44,43 - 44,81 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Колоректальный мутантный белок рака это белок что у людей кодируется MCC ген.^[5][6]

Этот ген является кандидатом колоректального ген-супрессор опухоли считается, что это отрицательно регулирует развитие клеточного цикла. Ортологичный ген у мышей экспрессирует фосфопротеин связанных с плазматической мембраной и мембранными органеллами, а сверхэкспрессия мышиного белка ингибирует проникновение в Фаза S. Множественные варианты транскрипции, кодирующие разные изоформы были обнаружены для этого гена.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000171444 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000071856 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Kinzler KW, Nilbert MC, Vogelstein B, Bryan TM, Levy DB, Smith KJ, Preisinger AC, Hamilton SR, Hedge P, Markham A, et al. (Апрель 1991 г.). «Идентификация гена, расположенного на хромосоме 5q21, мутировавшего при колоректальном раке». Наука. 251 (4999): 1366–70. Дои:10.1126 / science.1848370. PMID  1848370.
6. «Ген Entrez: MCC, мутировавший при колоректальном раке».

дальнейшее чтение

• Линдгрен В., Брайк С.Р., Озчелик Т. и др. (1992). «Фенотипические, цитогенетические и молекулярные исследования трех пациентов с конституциональными делециями хромосомы 5 в области гена семейного аденоматозного полипоза». Am. J. Hum. Genet. 50 (5): 988–97. ЧВК  1682619. PMID  1315124.
• Нишишо И., Накамура Ю., Миёси Ю. и др. (1991). «Мутации генов хромосомы 5q21 у пациентов с FAP и колоректальным раком». Наука. 253 (5020): 665–9. Дои:10.1126 / science.1651563. PMID  1651563.
• Хосино Ю., Хорикава И., Осимура М., Юаса Ю. (1991). «Нормальная хромосома 5 человека, на которой расположен ген семейного аденоматозного полипоза, обладает опухолевой супрессивной активностью». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 174 (1): 298–304. Дои:10.1016 / 0006-291X (91) 90520-H. PMID  1846539.
• Кертис Л.Дж., Бабб В.Дж., Гледхилл С. и др. (1994). «Утрата гетерозиготности MCC не связана с мутацией сохраненного аллеля при спорадическом колоректальном раке». Гм. Мол. Genet. 3 (3): 443–6. Дои:10.1093 / hmg / 3.3.443. PMID  8012355.
• Мацумин А, Сенда Т., Баег Г.Х. и др. (1996). «MCC, цитоплазматический белок, который блокирует прогрессирование клеточного цикла от G0 / G1 к S-фазе». J. Biol. Chem. 271 (17): 10341–6. Дои:10.1074 / jbc.271.17.10341. PMID  8626604.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Бауместер Т., Баух А., Раффнер Х. и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. Дои:10.1038 / ncb1086. PMID  14743216. S2CID  11683986.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.