Джон В. Тейлор (профессор) - John W. Taylor (professor)

Для других людей по имени Джон Тейлор см. Джон Тейлор (значения).
Для других людей с таким же именем см. Джон В. Тейлор (значения).

Джон Уолдо Тейлор американский ученый, изучающий эволюцию и экологию грибов. Он профессор аспирантуры в Кафедра биологии растений и микробов на Калифорнийский университет в Беркли.

Стандарт аббревиатура автора Дж. В. Тейлор может использоваться для обозначения этого человека в цитируя а биологическое имя.
Джон В. Тейлор
TaylorJohn.jpg
Родившийся1950
Колорадо-Спрингс, Колорадо, Соединенные Штаты
НациональностьСоединенные Штаты Америки
Род занятийМиколог, эволюционный биолог, эколог
Академическое образование
Альма-матерКалифорнийский университет в Беркли

Калифорнийский университет в Дэвисе

Университет Джорджии
ДокторантКеннет Уэллс
Другие научные консультантыМелвин Фуллер
Академическая работа
ДисциплинаМикология
СубдисциплинаЭволюция, Экология
УчрежденияКалифорнийский университет в Беркли

Образование

Джон У. Тейлор вырос в Лос-Анджелесе, штат Калифорния, и окончил среднюю школу при университете в 1968 году. Он получил степень бакалавра экологии в Калифорнийском университете в Беркли в 1972 году. Там он начал свою исследовательскую карьеру, защитив кандидатскую диссертацию по микоризам. растения под наблюдением миколога, профессора Ральф Эмерсон. Он поступил в магистратуру и докторантуру по ботанике в Калифорнийский университет в Дэвисе, в 1972 году. Там он использовал электронную микроскопию для изучения деления ядер в базидиомицет дрожжи, Bullera alba,[1] под наблюдением миколога профессора Кеннета Уэллса. В 1978 году поступил в докторантуру Университет Джорджии под руководством профессора Мелвина Фуллера. Там он изучал ультраструктура из зооспора развитие в хитридиомицет гриб Chytriomyces hyalinus.[2] Находясь в Грузии, он обсуждал молекулярная эволюция с исследователями из отдела генетики, где его жена Делия Барнс Тейлор работала над ДНК-трансформацией растений. В 1980 году Тейлор принял должность доцента в том, что сейчас является кафедрой микробной биологии Калифорнийского университета в Беркли. В первые несколько лет своей работы в Беркли он завершил ультраструктурные исследования, начатые в Джорджии, сосредоточив свое внимание на молекулярной эволюции грибы, начиная с модельного нитчатого гриба, Нейроспора.[3]

Карьера

Тейлор был профессором биологии растений и микробов в Калифорнийском университете в Беркли с 1980 года. Miller Research Профессор в 1999 году. Он был председателем группы аспирантов по микробиологии и ассоциированным председателем кафедры биологии растений и микробов в Калифорнийском университете в Беркли с 2003 по 2009 год. Он был одним из основателей и со-директором лаборатории ресурсов вычислительной геномики в Калифорнийском университете в Беркли (2011- 2017).

Тейлор был избран президентом Микологическое общество Америки на 2002-2003 гг. и президент Международная микологическая ассоциация с 2010-2014 гг. Он состоит или входил в состав редакционных коллегий mBIO, Микология, Микологические исследования, Грибковая генетика и биология, и IMA грибок.

Тейлор был председателем программного комитета Ежегодного собрания микологического общества Америки (1990 г.), председателем программного комитета Международный союз микробиологических обществ Микологический конгресс (2005 г.), сопредседатель, Гордонская исследовательская конференция по клеточной и молекулярной биологии грибов (2006-2008 гг.) и сопредседатель Ежегодного собрания микологического общества Америки (2016 г.). Он служил в Centraalbureau voor Schimmelcultures (теперь Вестердейк Институт биоразнообразия грибов ) в их Научно-консультативный совет (2000-2010) и служил Канадский институт перспективных исследований в своих научных советах по интегрированному микробному разнообразию (2010-2018) и Грибковому царству: угрозы и возможности (2019-2024).

Исследование

В 1990 году группа лаборатории Тейлора опубликовала протоколы ПЦР на грибки.[4] которые были разработаны в Беркли группой, в состав которой входил посетитель в творческом отпуске, доктор Томас Дж. Уайт (который руководил разработкой ПЦР - полимеразная цепная реакция - при Корпорация CETUS[5]), постдок Томас Д. Брунс и студент Стивен Б. Ли. Их подход оказал большое влияние на эволюцию грибов и экологию []. Тейлор и Уайт продолжили свое сотрудничество, сосредоточив внимание на эволюции двух патогенных грибов человека: Coccidioides immitis[6][7] и Histoplasma capsulatum.[8] Тейлор и его коллеги также применили ПЦР к грибковым филогения[9][10] и соответствие филогении геологическому времени.[11][12] Поскольку затраты на секвенирование ДНК снизились, они использовали популяционная генетика распознавать виды грибов[13] и описать их, основываясь исключительно на вариации ДНК.[14][15] Их подход к филогенетическому распознаванию видов грибов стал стандартом для микологии.[16][17] Их работа по распознаванию видов привела к тому, что они показали, что у грибов возникли усиленные барьеры для спаривания, в этом случае это первое свидетельство выбора самки у микроба.[18] Затем данные последовательности ДНК были использованы для обнаружения рекомбинация у грибов, пол которых никогда не наблюдался, несмотря на годы исследований.[19] Сочетание филогении нуклеиновых кислот и определения репродуктивного механизма положило конец многовековой практике классификации грибов, пол которых определялся отдельно от грибов, у которых определялся пол. морфология секса оставался неясным.[20] Затем лаборатория Тейлора обратилась к филогеномика чтобы обнаружить, что патогенные грибы человека эволюционировали от потребления стенок растительных клеток к потреблению животного белка,[21] предполагая, что мелкие млекопитающие представляют собой резервуар для некоторых грибковых заболеваний.[22] Их следующее исследование показало использование популяционная геномика для идентификации генов, находящихся в процессе отбора, с последующим использованием функции гена для формирования гипотез об особенностях окружающей среды, влияющих на адаптацию, и ограниченном проверкой гипотез делеция гена - подход, который они назвали «обратная экология ”.[23] Охарактеризовав популяции с помощью геномики, они сотрудничали с профессорами Луизой Гласс и Рэйчел Брем из Калифорнийского университета в Беркли. полногеномные ассоциации исследований грибковой сигнализации.[24] В последнее десятилетие Тейлор в сотрудничестве с профессором Томом Брунсом и доктором Пегги Лемо из Калифорнийского университета в Беркли использовал ПЦР-идентификацию образцов окружающей среды, чтобы сосредоточиться на грибковых заболеваниях. общественная экология в воздухе помещений,[25] эктомикоризный леса[26] и засухоустойчивые культурные растения, сорго.[27][28]

Почести и отличия

  • Тейлор получил награду за выдающиеся педагогические достижения от Колледжа природных ресурсов Калифорнийского университета в Беркли (2005 г.) и премию Уэстона за преподавание от Микологического общества Америки (1994 г.).
  • Медаль Дебари от Международной микологической ассоциации (2018 г.), Медаль фон Аркса от Института биоразнообразия грибов Вестердейка (2012 г.). Заслуженный миколог Американского микологического общества (2018 г.), медаль Люсиль К. Георг, Международное общество микологии человека и животных (2003 г.), медаль Роды Бенхам, Медицинское микологическое общество Америки (2004 г.), премия Alexopolous от Микологического общества Америка (1986), Тейлор был избран членом: Американская ассоциация развития науки (2000), Американская академия микробиологии (1998), Международная микологическая ассоциация (2018), Микологическое общество Америки (2005) и Калифорнийская академия наук (1993).
  • Тейлора пригласили выступить с основной презентацией на Международном микологическом конгрессе (2010 г.) и лекцией Перкинса-Метценберга на конференции по генетике грибов (2019 г.).
  • В честь Тейлора учреждены две награды: Лекция Тейлора-Уайта в Калифорнийском университете в Беркли (2011 г.)[29] и Премия Джона Тейлора за исследования для аспирантов Американского микологического общества (2019).

Рекомендации

  1. ^ Тейлор, Дж. В .; Уэллс, К. (1979-03-01). «Световое и электронно-микроскопическое исследование митоза в Bullera alba и гистохимии некоторых цитоплазматических веществ». Протоплазма. 98 (1): 31–62. Дои:10.1007 / BF01676661. ISSN  1615-6102. S2CID  29948224.
  2. ^ Тейлор, Джон В .; Фуллер, Мелвин С. (1981-03-01). «Аппарат Гольджи, зооспорогенез и развитие аппарата разряда зооспор Chytridium confervae». Экспериментальная микология. 5 (1): 35–59. Дои:10.1016/0147-5975(81)90005-0. ISSN  0147-5975.
  3. ^ Мэй, Джорджиана; Тейлор, Джон В. (май 1989 г.). «Независимый перенос митохондриальных плазмид в Neurospora crassa». Природа. 339 (6222): 320–322. Дои:10.1038 / 339320a0. ISSN  1476-4687. PMID  2524667. S2CID  19739852.
  4. ^ Уайт, T.J .; Bruns, T .; Lee, S .; Тейлор, Дж. (1990), "Амплификация и прямое секвенирование генов грибковой рибосомной РНК для филогенетики", Протоколы ПЦР, Elsevier, стр. 315–322, Дои:10.1016 / b978-0-12-372180-8.50042-1, ISBN  978-0-12-372180-8
  5. ^ Рабинов, Пол (1996). Проведение ПЦР. Издательство Чикагского университета. Дои:10.7208 / Чикаго / 9780226216874.001.0001. ISBN  978-0-226-70147-9.
  6. ^ Брунс, Т. Д.; Белый, T J; Тейлор, Дж. В (1991-11-01). "Молекулярная систематика грибов". Ежегодный обзор экологии и систематики. 22 (1): 525–564. Дои:10.1146 / annurev.es.22.110191.002521. ISSN  0066-4162.
  7. ^ Bowman, B.H .; Тейлор, Дж. В .; Уайт, Т. Дж. (1992-09-01). «Молекулярная эволюция грибов: патогены человека». Молекулярная биология и эволюция. 9 (5): 893–904. Дои:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a040766. ISSN  0737-4038. PMID  1528111.
  8. ^ Касуга, Такао; Белый, Томас Дж .; Кениг, Джина; Макевен, Хуан; Рестрепо, Анджела; Кастаньеда, Элизабета; Лакас, Карлос да Силва; Heins-Vaccari, Elisabeth M .; Фрейтас, Розели С. Де; Zancopé ‐ Oliveira, Rosely M .; Цинь, Чжэньюй (2003). «Филогеография грибкового возбудителя Histoplasma capsulatum». Молекулярная экология. 12 (12): 3383–3401. Дои:10.1046 / j.1365-294X.2003.01995.x. ISSN  1365–294X. PMID  14629354.
  9. ^ Lee, S. B .; Тейлор, Дж. У. (1 июля 1992 г.). «Филогения пяти грибовидных протоктистанских видов Phytophthora, выведенная из внутренних транскрибированных спейсеров рибосомной ДНК». Молекулярная биология и эволюция. 9 (4): 636–653. Дои:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a040750. ISSN  0737-4038. PMID  1630304.
  10. ^ Берби, Мэри Л .; Тейлор, Джон В. (1992-03-01). «Признаки последовательности гена рибосомной РНК 18S помещают патоген человека Sporothrix schenckii в род Ophiostoma». Экспериментальная микология. 16 (1): 87–91. Дои:10.1016 / 0147-5975 (92) 90044-П. ISSN  0147-5975.
  11. ^ Берби, Мэри Л .; Тейлор, Джон В. (1993-08-01). «Датировка эволюционных излучений истинных грибов». Канадский журнал ботаники. 71 (8): 1114–1127. Дои:10.1139 / b93-131. ISSN  0008-4026.
  12. ^ Тейлор, Джон В .; Берби, Мэри Л. (01.11.2006). «Датировка расхождений в грибном древе жизни: обзор и новый анализ». Микология. 98 (6): 838–849. Дои:10.1080/15572536.2006.11832614. ISSN  0027-5514. PMID  17486961. S2CID  218590230.
  13. ^ Куфопану, Василики; Берт, Остин; Тейлор, Джон В. (13 мая 1997 г.). «Согласование генеалогий показывает репродуктивную изоляцию патогенного гриба Coccidioides immitis». Труды Национальной академии наук. 94 (10): 5478–5482. Дои:10.1073 / пнас.94.10.5478. ISSN  0027-8424. ЧВК  24704. PMID  9144263.
  14. ^ Фишер, Мэтью С .; Koenig, Gina L .; Белый, Томас Дж .; Сан-Блас, Джоконда; Негрони, Рикардо; Альварес, Исидро Гутьеррес; Ванке, Бодо; Тейлор, Джон В. (2001-04-10). «Расширение биогеографического ареала в Южную Америку с помощью Coccidioides immitis отражает модели миграции людей Нового Света». Труды Национальной академии наук. 98 (8): 4558–4562. Дои:10.1073 / pnas.071406098. ISSN  0027-8424. ЧВК  31873. PMID  11287648.
  15. ^ Фишер, М. С .; Koenig, G.L .; White, T.J .; Тейлор, Дж. У. (01.01.2002). «Молекулярное и фенотипическое описание Coccidioides posadasii sp. Nov., Ранее признанного некалифорнийской популяцией Coccidioides immitis». Микология. 94 (1): 73–84. Дои:10.1080/15572536.2003.11833250. HDL:10044/1/4213. ISSN  0027-5514. PMID  21156479. S2CID  28959982.
  16. ^ Тейлор, Джон В .; Джейкобсон, Дэвид Дж .; Крокен, Скотт; Касуга, Такао; Гейзер, Дэвид М .; Hibbett, David S .; Фишер, Мэтью С. (2000-10-01). «Филогенетическое распознавание видов и видовые концепции грибов». Грибковая генетика и биология. 31 (1): 21–32. Дои:10.1006 / fgbi.2000.1228. ISSN  1087-1845. PMID  11118132.
  17. ^ Деттман, Джереми Р .; Джейкобсон, Дэвид Дж .; Тейлор, Джон В. (2003). «Мультилокусный генеалогический подход к распознаванию филогенетических видов в модельной Eukaryote Neurospora». Эволюция. 57 (12): 2703–2720. Дои:10.1111 / j.0014-3820.2003.tb01514.x. ISSN  1558-5646. PMID  14761051.
  18. ^ Тернер, Элизабет; Джейкобсон, Дэвид Дж .; Тейлор, Джон В. (18 августа 2011 г.). «Генетическая архитектура усиленного барьера репродуктивной изоляции между видами Neurospora, усиленного после спаривания, указывает на эволюцию посредством естественного отбора». PLOS Genetics. 7 (8): e1002204. Дои:10.1371 / journal.pgen.1002204. ISSN  1553-7404. ЧВК  3158040. PMID  21876674.
  19. ^ Burt, A .; Картер, Д. А .; Koenig, G.L .; White, T.J .; Тейлор, Дж. У. (1996-01-23). «Молекулярные маркеры выявляют скрытый пол у человеческого патогена Coccidioides immitis». Труды Национальной академии наук. 93 (2): 770–773. Дои:10.1073 / пнас.93.2.770. ISSN  0027-8424. ЧВК  40130. PMID  8570632.
  20. ^ Тейлор, Джон В. (декабрь 2011 г.). «Один гриб = одно имя: ДНК и номенклатура грибов через двадцать лет после ПЦР». IMA грибок. 2 (2): 113–120. Дои:10.5598 / imafungus.2011.02.02.01. ISSN  2210-6359. ЧВК  3359808. PMID  22679595.
  21. ^ Шарптон, Томас Дж .; Stajich, Jason E .; Рунсли, Стивен Д .; Гарднер, Малькольм Дж .; Wortman, Jennifer R .; Jordar, Vinita S .; Маити, Рама; Kodira, Chinnappa D .; Neafsey, Daniel E .; Цзэн, Цяньдун; Хунг, Чиунг-Ю (2009-10-01). «Сравнительный геномный анализ возбудителей грибковых заболеваний человека Coccidioides и их родственников». Геномные исследования. 19 (10): 1722–1731. Дои:10.1101 / гр.087551.108. ISSN  1088-9051. ЧВК  2765278. PMID  19717792.
  22. ^ Тейлор, Джон В .; Баркер, Бриджит М. (01.02.2019). «Гипотеза эндозоя, резервуара мелких млекопитающих и жизненный цикл видов Coccidioides». Медицинская микология. 57 (Приложение_1): S16 – S20. Дои:10.1093 / mmy / myy039. ISSN  1369-3786. ЧВК  6702415. PMID  30690603.
  23. ^ Эллисон, Кристофер Э .; Холл, Чарльз; Ковел, Дэвид; Уэлч, Джульетта; Брем, Рэйчел Б.; Glass, N. L .; Тейлор, Джон В. (15 февраля 2011 г.). «Популяционная геномика и локальная адаптация диких изолятов модельного микробного эукариота». Труды Национальной академии наук. 108 (7): 2831–2836. Дои:10.1073 / pnas.1014971108. ISSN  0027-8424. ЧВК  3041088. PMID  21282627.
  24. ^ Пальма-Герреро, Хавьер; Холл, Чарльз Р .; Ковель, Дэвид; Уэлч, Джульетта; Тейлор, Джон В .; Брем, Рэйчел Б.; Гласс, Н. Луиза (2013-08-01). «Общегеномная ассоциация выявляет новые локусы, участвующие в грибковой коммуникации». PLOS Genetics. 9 (8): e1003669. Дои:10.1371 / journal.pgen.1003669. ISSN  1553-7404. ЧВК  3731230. PMID  23935534.
  25. ^ Адамс, Рэйчел I .; Милетто, Марция; Тейлор, Джон В .; Брунс, Томас Д. (июль 2013 г.). «Распространение в микробах: грибы в воздухе помещений преобладают в наружном воздухе и демонстрируют ограничение распространения на небольших расстояниях». Журнал ISME. 7 (7): 1262–1273. Дои:10.1038 / ismej.2013.28. ISSN  1751-7370. ЧВК  3695294. PMID  23426013.
  26. ^ Talbot, Jennifer M .; Bruns, Thomas D .; Тейлор, Джон В .; Смит, Дилан П .; Бранко, Сара; Глассман, Сидней I .; Эрландсон, Соня; Вилгалис, Ритас; Ляо, Хуэй-Лин; Смит, Мэтью Э .; Пи, Кабир Г. (2014-04-29). «Эндемизм и функциональная конвергенция микобиома почвы в Северной Америке». Труды Национальной академии наук. 111 (17): 6341–6346. Дои:10.1073 / pnas.1402584111. ISSN  0027-8424. ЧВК  4035912. PMID  24733885.
  27. ^ Гао, Чэн; Монтойя, Лилиам; Сюй, Линь; Мадера, Мэри; Холлингсворт, Джой; Пурдом, Элизабет; Синган, Васант; Фогель, Джон; Hutmacher, Роберт Б .; Дальберг, Джеффри А .; Коулман-Дерр, Девин (07.01.2020). «Объединение грибковых сообществ в сорго, подверженном засухе, демонстрирует случайность, селекцию и универсальную экологическую динамику». Nature Communications. 11 (1): 34. Дои:10.1038 / s41467-019-13913-9. ISSN  2041-1723. ЧВК  6946711. PMID  31911594.
  28. ^ Вароко, Нелле; Коул, Бенджамин; Гао, Чэн; Пьероз, Грейди; Бейкер, Кристофер Р .; Патель, Друв; Мадера, Мэри; Джефферс, Тим; Холлингсворт, Джой; Зиверт, Джули; Ёсинага, Юко (26 декабря 2019). «Транскриптомный анализ засушливого сорго от всходов до зрелости выявляет биотические и метаболические реакции». Труды Национальной академии наук. 116 (52): 27124–27132. Дои:10.1073 / пнас.1907500116. ISSN  0027-8424. ЧВК  6936495. PMID  31806758.
  29. ^ "Лекции для жертв: Тейлор-Уайт". Калифорнийский университет в Беркли. 2020 г.. Получено 12 августа, 2020.

внешняя ссылка