HPN (ген) - HPN (gene)

Гепсин-SRCR
внеклеточный домен человеческого гепсина
Идентификаторы
Символ	Гепсин-SRCR
Pfam	PF09272
ИнтерПро	IPR015352
SCOP2	1п57 / Объем / СУПФАМ
Доступные белковые структуры: Pfam   структуры / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum резюме структуры

HPN
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1O5E, 1O5F, 1П57, 1Z8G, 3T2N, 5CE1
Идентификаторы
Псевдонимы	HPN, TMPRSS1, гепсин
Внешние идентификаторы	OMIM: 142440 MGI: 1196620 ГомолоГен: 20498 Генные карты: HPN
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.11 Начните 35,040,506 бп[1] Конец 35,066,571 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 B1 Начните 31,098,725 бп[2] Конец 31,115,290 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность экзопептидазы серинового типа • активность кальциево-активированного калиевого канала • пептидазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • активность пептидазы серинового типа • гидролазная активность • активность эндопептидазы серинового типа Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • не мембрана • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • межклеточное соединение • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • поверхность клетки • тело нейрональной клетки • апикальная плазматическая мембрана • внеклеточная экзосома • клеточная мембрана Биологический процесс • положительная регуляция пролиферации гепатоцитов • положительная регуляция активации плазминогена • ответ на гормон щитовидной железы • отрицательная регуляция апоптотического процесса • протеолиз • обнаружение механических стимулов, участвующих в сенсорном восприятии звука • положительное регулирование выработки гормонов щитовидной железы • положительное регулирование роста клеток • положительная регуляция экспрессии генов • пиломоторный рефлекс • морфогенез улитки • трансмембранный транспорт ионов калия • регулировка формы клеток • отрицательная регуляция пролиферации эпителиальных клеток • демонтаж базальной мембраны • отрицательная регуляция перехода эпителия в мезенхиму • сигнальный путь рецептора фактора роста гепатоцитов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3249	15451
Ансамбль	ENSG00000105707	ENSMUSG00000001249
UniProt	P05981	O35453
RefSeq (мРНК)	NM_002151 NM_182983 NM_001375441 NM_001384133	NM_001110252 NM_001276269 NM_008281
RefSeq (белок)	NP_002142 NP_892028 NP_001362370 NP_001371062	NP_001103722 NP_001263198 NP_032307
Расположение (UCSC)	Chr 19: 35.04 - 35.07 Мб	Chr 7: 31.1 - 31.12 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Сериновая протеаза гепсин является фермент что у людей кодируется HPN ген.^[5][6]

Функция

Гепсин представляет собой сериновую протеазу клеточной поверхности.^[6]

Hepson содержит пептидаза Домен S1 и домен SRCR. Домен SRCR находится в внеклеточный часть белок, он состоит в основном из трех элементов регулярного вторичная структура: 12-остаток альфа-спираль, витая пятиниточная антипараллельный бета-лист, и второй, двухнитевой, антипараллельный лист. Два бета-листы лежат примерно под прямым углом друг к другу, спираль расположенный между ними, приняв SRCR складывать. Точная функция этого домена не была определена, хотя, вероятно, она может служить ориентиром для протеаза домен или разместите его рядом с его субстрат.^[7]

Клиническое значение

Экспрессия гепсина не регулируется в рак простаты и коррелирует с прогрессированием заболевания.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105707 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000001249 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лейтус С.П., Леб К.Р., Хаген Ф.С., Курачи К., Дэви Е.В. (февраль 1988 г.). «Новая трипсиноподобная сериновая протеаза (гепсин) с предполагаемым трансмембранным доменом, экспрессируемым клетками печени и гепатомы человека». Биохимия. 27 (3): 1067–74. Дои:10.1021 / bi00403a032. PMID  2835076.
6. «Ген Entrez: гепсин HPN (трансмембранная протеаза, серин 1)».
7. Сомоса Дж. Р., Хо Дж. Д., Луонг К., Гейт М., Шпренгелер П. А., Мортара К., Шрейдер В. Д., Сперандио Д., Чан Г., МакГрат М. Е., Кац Б. А. (сентябрь 2003 г.). «Структура внеклеточной области человеческого гепсина выявляет домен сериновой протеазы и новый богатый цистеином домен рецептора скавенджера (SRCR)». Структура. 11 (9): 1123–31. Дои:10.1016 / S0969-2126 (03) 00148-5. PMID  12962630.
8. Ву Кью, Парри Джи (2007). «Гепсин и рак простаты». Границы биологических наук. 12 (12): 5052–9. Дои:10.2741/2447. PMID  17569629.

дальнейшее чтение

• Wu Q (февраль 2001 г.). «Ген нацеливания в гемостазе. Гепсин». Границы биологических наук. 6 (3): D192-200. Дои:10.2741 / a604. PMID  11171558.
• Цудзи А., Торрес-Росадо А., Араи Т., Ле Бо М.М., Лимоны Р.С., Чжоу С.Х., Курачи К. (сентябрь 1991 г.). «Гепсин, протеаза, ассоциированная с клеточной мембраной. Характеристика, распределение в тканях и локализация гена». Журнал биологической химии. 266 (25): 16948–53. PMID  1885621.
• Казама Ю., Хамамото Т., Фостер, округ Колумбия, Кисиэль В. (январь 1995 г.). «Гепсин, предполагаемая мембраносвязанная сериновая протеаза, активирует человеческий фактор VII и инициирует путь свертывания крови на поверхности клетки, ведущий к образованию тромбина». Журнал биологической химии. 270 (1): 66–72. Дои:10.1074 / jbc.270.1.66. PMID  7814421.
• Торрес-Росадо А., О'Ши К.С., Цуджи А., Чжоу С.Х., Курачи К. (август 1993 г.). «Гепсин, предполагаемая сериновая протеаза клеточной поверхности, необходим для роста клеток млекопитающих». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 90 (15): 7181–5. Дои:10.1073 / пнас.90.15.7181. ЧВК  47100. PMID  8346233.
• Chen Z, Fan Z, McNeal JE, Nolley R, Caldwell MC, Mahadevappa M, Zhang Z, Warrington JA, Stamey TA (апрель 2003 г.). «Гепсин и маспин обратно пропорционально экспрессируются при микродиссектированном раке простаты с помощью лазерного захвата». Журнал урологии. 169 (4): 1316–9. Дои:10.1097 / 01.ju.0000050648.40164.0d. PMID  12629351.
• Сомоса Дж. Р., Хо Дж. Д., Луонг К., Гейт М., Шпренгелер П. А., Мортара К., Шрейдер В. Д., Сперандио Д., Чан Г., МакГрат М. Е., Кац Б. А. (сентябрь 2003 г.). «Структура внеклеточной области человеческого гепсина выявляет домен сериновой протеазы и новый богатый цистеином (SRCR) домен рецептора скавенджера». Структура. 11 (9): 1123–31. Дои:10.1016 / S0969-2126 (03) 00148-5. PMID  12962630.
• Кирххофер Д., Пик М., Липари М. Т., Биллеци К., Фан Б., Моран П. (март 2005 г.). «Гепсин активирует фактор роста гепатоцитов и ингибируется ингибитором активатора фактора роста гепатоцитов-1B (HAI-1B) и HAI-2». Письма FEBS. 579 (9): 1945–50. Дои:10.1016 / j.febslet.2005.01.085. PMID  15792801. S2CID  46441979.
• Пал П., Си Х., Каушал Р., Сун Джи, Джин СН, Джин Л., Суарес Б.К., Каталония, ВД, Дека Р. (сентябрь 2006 г.). «Варианты гена HEPSIN связаны с раком простаты у мужчин европейского происхождения». Генетика человека. 120 (2): 187–92. Дои:10.1007 / s00439-006-0204-3. PMID  16783571. S2CID  13411333.
• Моран П., Ли В., Фан Б., Видж Р., Эйгенброт С., Кирххофер Д. (октябрь 2006 г.). «Активатор плазминогена проурокиназного типа является субстратом для гепсина». Журнал биологической химии. 281 (41): 30439–46. Дои:10.1074 / jbc.M605440200. PMID  16908524.
• Бецуно Х, Мукаи С., Акияма Й, Фукусима Т, Минамигучи Н., Хасуи Й, Осада Й, Катаока Х (апрель 2007 г.). «Клиническая значимость экспрессии гепсина и активатора фактора роста гепатоцитов типа 2 в почечно-клеточной карциноме». Наука о раке. 98 (4): 491–8. Дои:10.1111 / j.1349-7006.2007.00412.x. PMID  17309599. S2CID  26220332.

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR015352