HAND домен - HAND domain
| РУКА | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 модуль распознавания нуклеосом iswi атпазы | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | РУКА | ||||||||
| Pfam | PF09110 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR015194 | ||||||||
| SCOP2 | 1ofc / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии HAND домен это белковый домен который принимает вторичная структура состоящий из четырех альфа спирали, три из которых (H2, H3, H4) образуют L-образную конфигурацию. Helix H2 работает антипараллельный к спирали H3 и H4 плотно прилегают к спирали H4, в то время как спираль H1 опирается на вогнутую поверхность, образованную этими тремя спиралями, и проходит перпендикулярно им. Этот домен предоставляет ДНК и нуклеосома привязка свойств к белки в котором это происходит.[1] Он назван HAND-доменом, потому что его 4-спиральный структура напоминает открытую ладонь.
Белки, содержащие домен HAND, включают белки, участвующие в нуклеосома ремоделирование, энергозависимый процесс, который изменяет гистон -ДНК взаимодействия внутри нуклеосом, тем самым делая нуклеосомную ДНК доступной для регулирующий факторы. В АТФазы участвующие в ремоделировании нуклеосом, принадлежат к подсемейству SWI2 / SNF2 МЕРТВЫХ /ЧАС-геликасы, которые содержат консервированный АТФазный домен, характеризующийся семью мотивы. Белки внутри этого семейства различаются в отношении организации домена, связанных с ними белки и реконструкция сложный в котором они проживают. ATPase ISWI является членом этого семейства. ISWI можно разделить на два региона: N-концевой область, которая содержит домен АТФазы SWI2 / SNF2 и C-концевую область, которая отвечает за субстрат признание. С-концевой участок содержит 12 альфа-спирали и можно разделить на три домены и спейсерная область: домен HAND, SANT домен (ДНК-связывающий c-Myb), спейсерную спираль и SLIDE домен (Как SANT, но с несколькими прошивками).
Рекомендации
- ^ Грун Т., Бжески Дж., Эберхартер А., Клапье Р. Р., Корона Д. Ф., Беккер П. Б., Мюллер К. В. (август 2003 г.). «Кристаллическая структура и функциональный анализ модуля распознавания нуклеосом фактора ремоделирования ISWI». Мол. Клетка. 12 (2): 449–60. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00273-9. PMID 14536084.