FABP5 - FABP5

FABP5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1B56, 1JJJ, 4AZM, 4AZR, 4ЛКП, 4ЛКТ
Идентификаторы
Псевдонимы	FABP5, E-FABP, EFABP, KFABP, PA-FABP, PAFABP, белок, связывающий жирные кислоты 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 605168 MGI: 101790 ГомолоГен: 108238 Генные карты: FABP5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q21.13 Начните 81,280,536 бп[1] Конец 81,284,777 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 A1 Начните 10,012,548 бп[2] Конец 10,016,607 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • транспортная деятельность • липидное связывание • GO: 0001948 связывание с белками • связывание жирных кислот • связывание ретиноевой кислоты • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • нуклеоплазма • цитозоль • внеклеточная экзосома • внеклеточная область • клеточная мембрана • секреторная мембрана гранул • просвет азурофильных гранул • внеклеточный • ядро клетки • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • мембрана • соединение клеток • синапс • постсинаптическая мембрана Биологический процесс • развитие эпидермиса • катаболический процесс триглицеридов • процесс биосинтеза фосфатидилхолина • метаболический процесс глюкозы • липидный обмен • дегрануляция нейтрофилов • транспорт • отрицательная регуляция транспорта глюкозы • регуляция процесса биосинтеза простагландинов • положительная регуляция сигнального пути рецептора, активируемого пролифератором пероксисом • гомеостаз глюкозы • регуляция сенсорного восприятия боли • регуляция ретроградной транс-синаптической передачи сигналов эндоканабиноидом • положительное регулирование термогенеза, вызванного холодом Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	2171	16592
Ансамбль	ENSG00000164687	ENSMUSG00000027533
UniProt	Q01469	Q05816
RefSeq (мРНК)	NM_001444	NM_001272097 NM_001272098 NM_010634
RefSeq (белок)	NP_001435	NP_001259026 NP_001259027 NP_034764
Расположение (UCSC)	Chr 8: 81.28 - 81.28 Мб	Chr 3: 10.01 - 10.02 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, связывающий жирные кислоты, эпидермальный это белок что у людей кодируется FABP5 ген.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует белок, связывающий жирные кислоты, обнаруженный в эпидермальных клетках, и был впервые идентифицирован как активируемый в псориаз ткань. Белки, связывающие жирные кислоты представляют собой семейство небольших, высококонсервативных цитоплазматических белков, которые связывают длинноцепочечные жирные кислоты и другие гидрофобные лиганды. Считается, что функции FABP включают поглощение, транспорт и метаболизм жирных кислот.^[6]

В фитоканнабиноиды (THC и CBD ) подавлять эндоканнабиноид анандамид (AEA) за счет нацеливания на FABP5 и конкуренции за FABPs может частично или полностью объяснить повышенный уровень эндоканнабиноидов в крови после употребления каннабиноидов.^[7] Результаты показывают, что каннабиноиды подавляют кератиноцит распространение и, следовательно, подтверждают потенциальную роль каннабиноидов в лечении псориаза.^[8]

Взаимодействия

FABP5 был показан взаимодействовать с участием S100A7.^[9][10]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164687 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027533 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Мадсен П., Расмуссен Х. Х., Лефферс Х., Оноре Б., Селис Дж. Э. (сентябрь 1992 г.). «Молекулярное клонирование и экспрессия нового белка кератиноцитов (связанного с псориазом белка, связывающего жирные кислоты [PA-FABP]), который сильно активируется в псориатической коже и имеет сходство со связывающими жирные кислоты белками». Журнал следственной дерматологии. 99 (3): 299–305. Дои:10.1111 / 1523-1747.ep12616641. PMID  1512466.
6. «Ген Entrez: белок 5, связывающий жирные кислоты FABP5 (связанный с псориазом)».
7. Элмс М.В., Качоча М., Бергер В.Т., Люнг К., Ральф Б.П., Ван Л., Суини Дж.М., Мияучи Д.Т., Цирка С.Е., Одзима I, Немецкий генеральный директор (апрель 2015 г.). «Белки, связывающие жирные кислоты (FABP), являются внутриклеточными носителями Δ9-тетрагидроканнабинола (THC) и каннабидиола (CBD)». Журнал биологической химии. 290 (14): 8711–21. Дои:10.1074 / jbc.M114.618447. ЧВК  4423662. PMID  25666611.
8. Уилкинсон Дж. Д., Уильямсон Е. М. (февраль 2007 г.). «Каннабиноиды подавляют пролиферацию кератиноцитов человека посредством механизма, отличного от CB1 / CB2, и имеют потенциальную терапевтическую ценность при лечении псориаза». Журнал дерматологической науки. 45 (2): 87–92. Дои:10.1016 / j.jdermsci.2006.10.009. PMID  17157480.
9. Рус М., Брум А.М., Экерт Р.Л. (июль 2003 г.). «S100A7 (псориазин) взаимодействует с эпидермальным белком, связывающим жирные кислоты, и локализуется в фокальных структурах, подобных адгезии, в культивируемых кератиноцитах». Журнал следственной дерматологии. 121 (1): 132–41. Дои:10.1046 / j.1523-1747.2003.12309.x. PMID  12839573.
10. Hagens G, Roulin K, Hotz R, Saurat JH, Hellman U, Siegenthaler G (февраль 1999 г.). «Вероятное взаимодействие между S100A7 и E-FABP в цитозоле кератиноцитов человека из псориатических чешуек». Молекулярная и клеточная биохимия. 192 (1–2): 123–8. Дои:10.1023 / А: 1006894909694. PMID  10331666. S2CID  24171894.

дальнейшее чтение

• Расмуссен Х. Х., ван Дамм Дж., Пуйпе М., Гессер Б., Селис Дж. Э., Вандекеркхов Дж. (Декабрь 1992 г.). «Микропоследовательности 145 белков, записанные в базе данных двумерных гелевых белков нормальных эпидермальных кератиноцитов человека». Электрофорез. 13 (12): 960–9. Дои:10.1002 / elps.11501301199. PMID  1286667. S2CID  41855774.
• Siegenthaler G, Hotz R, Chatellard-Gruaz D, Didierjean L, Hellman U, Saurat JH (сентябрь 1994 г.). «Очистка и характеристика человеческого эпидермального белка, связывающего жирные кислоты: локализация во время дифференцировки эпидермальных клеток in vivo и in vitro». Биохимический журнал. 302 (Pt 2) (2): 363–71. Дои:10.1042 / bj3020363. ЧВК  1137237. PMID  8092987.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Siegenthaler G, Hotz R, Chatellard-Gruaz D, Jaconi S, Saurat JH (январь 1993 г.). «Характеристика и экспрессия нового белка, связывающего жирные кислоты человека: эпидермального типа (E-FABP)». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 190 (2): 482–7. Дои:10.1006 / bbrc.1993.1073. PMID  8427590.
• Masouyé I, Saurat JH, Siegenthaler G (1996). «Эпидермальный белок, связывающий жирные кислоты при псориазе, базальных и плоскоклеточных карциномах: иммуногистологическое исследование». Дерматология. 192 (3): 208–13. Дои:10.1159/000246367. PMID  8726632.
• Jaworski C, Wistow G (ноябрь 1996 г.). «LP2, липид-связывающий белок, связанный с дифференцировкой, экспрессируемый в хрусталике крупного рогатого скота». Биохимический журнал. 320 (Pt 1) (1): 49–54. Дои:10.1042 / bj3200049. ЧВК  1217896. PMID  8947466.
• Masouyé I, Hagens G, Van Kuppevelt TH, Madsen P, Saurat JH, Veerkamp JH, Pepper MS, Siegenthaler G (сентябрь 1997 г.). «Эндотелиальные клетки микрососудов человека экспрессируют эпидермальный белок, связывающий жирные кислоты». Циркуляционные исследования. 81 (3): 297–303. Дои:10.1161 / 01.res.81.3.297. HDL:2066/25768. PMID  9285630.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Ватанабе Р., Фуджи Х., Ямамото А., Хашимото Т., Камеда К., Ито М., Оно Т. (ноябрь 1997 г.). «Иммуногистохимическое распределение кожного белка, связывающего жирные кислоты, в коже человека». Журнал дерматологической науки. 16 (1): 17–22. Дои:10.1016 / S0923-1811 (97) 00615-4. PMID  9438903.
• Hagens G, Masouyé I, Augsburger E, Hotz R, Saurat JH, Siegenthaler G (апрель 1999 г.). «Кальций-связывающий белок S100A7 и белок, связывающий жирные кислоты эпидермального типа, связаны в цитозоле кератиноцитов человека». Биохимический журнал. 339 (Pt 2) (2): 419–27. Дои:10.1042/0264-6021:3390419. ЧВК  1220173. PMID  10191275.
• Hagens G, Roulin K, Hotz R, Saurat JH, Hellman U, Siegenthaler G (февраль 1999 г.). «Вероятное взаимодействие между S100A7 и E-FABP в цитозоле кератиноцитов человека из псориатических чешуек». Молекулярная и клеточная биохимия. 192 (1–2): 123–8. Дои:10.1023 / А: 1006894909694. PMID  10331666. S2CID  24171894.
• Хохофф К., Бёрхерс Т., Рюстов Б., Спенер Ф., ван Тильберг Х. (сентябрь 1999 г.). «Экспрессия, очистка и определение кристаллической структуры рекомбинантного человеческого белка, связывающего жирные кислоты эпидермального типа». Биохимия. 38 (38): 12229–39. Дои:10.1021 / bi990305u. PMID  10493790.
• O'Shaughnessy RF, Seery JP, Celis JE, Frischauf A, Watt FM (декабрь 2000 г.). «PA-FABP, новый маркер эпидермальных транзитных амплифицирующих клеток человека, выявленный с помощью 2D-электрофореза в белках в геле и гибридизации массива кДНК». Письма FEBS. 486 (2): 149–54. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 02252-3. PMID  11113456. S2CID  23327194.
• Гутьеррес-Гонсалес Л. Х., Людвиг С., Хохофф С., Радемахер М., Ханхофф Т., Рютерьанс Х., Спенер Ф., Люке С. (июнь 2002 г.). «Структура раствора и динамика основной цепи человека, связывающего жирные кислоты эпидермального типа (E-FABP)». Биохимический журнал. 364 (Pt 3): 725–37. Дои:10.1042 / BJ20020039. ЧВК  1222622. PMID  12049637.
• Геваерт К., Гётальс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стаес А., Томас Г. Р., Вандекеркхове Дж. (Май 2003 г.). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Природа Биотехнологии. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
• Русе М., Брум А.М., Эккерт Р.Л. (июль 2003 г.). «S100A7 (псориазин) взаимодействует с эпидермальным белком, связывающим жирные кислоты, и локализуется в фокальных структурах, подобных адгезии, в культивируемых кератиноцитах». Журнал следственной дерматологии. 121 (1): 132–41. Дои:10.1046 / j.1523-1747.2003.12309.x. PMID  12839573.
• Ха МК, Чунг К.Ю., Ли Дж.Х., Банг Д., Пак Ю.К., Ли К.Х. (сентябрь 2004 г.). «Экспрессия связанного с псориазом белка, связывающего жирные кислоты, в стареющих эндотелиальных клетках микрососудов кожи человека». Экспериментальная дерматология. 13 (9): 543–50. Дои:10.1111 / j.0906-6705.2004.00196.x. PMID  15335354. S2CID  22923459.