DHX16 - DHX16

DHX16
Идентификаторы
Псевдонимы	DHX16, DBP2, DDX16, PRO2014, PRP8, PRPF2, Prp2, DEAH-бокс-геликаза 16, NMOAS
Внешние идентификаторы	OMIM: 603405 MGI: 1916442 ГомолоГен: 2658 Генные карты: DHX16
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п21.33 Начинать 30,653,119 бп[1] Конец 30,673,006 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 B1 Начинать 35,879,819 бп[2] Конец 35,892,670 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • РНК-геликазная активность • связывание нуклеотидов • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ • GO: 0008026 геликазная активность • гидролазная активность • связывание нуклеиновой кислоты • АТФазная активность • Связывание РНК • GO: 0034459 3'-5 'РНК-геликазная активность Сотовый компонент • сплайсосомальный комплекс • ядро клетки • цитоплазма • нуклеоплазма • Предкаталитическая сплайсосома типа U2 Биологический процесс • обработка мРНК • Сплайсинг РНК • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • метаболизм Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8449	69192
Ансамбль	ENSG00000233561 ENSG00000206486 ENSG00000233418 ENSG00000231377 ENSG00000227222 ENSG00000204560 ENSG00000233049 ENSG00000226171	ENSMUSG00000024422
UniProt	O60231 Q5SQH5	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001164239 NM_003587 NM_001363515	NM_026987
RefSeq (белок)	NP_001157711 NP_003578 NP_001350444	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 6: 30,65 - 30,67 Мб	Chr 17: 35,88 - 35,89 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Предполагаемый фактор сплайсинга пре-мРНК АТФ-зависимая РНК-геликаза DHX16 является фермент что у людей кодируется DHX16 ген.^[5][6]

Белки DEAD-бокса, характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), являются предполагаемыми РНК геликасы. Они вовлечены в ряд клеточных процессов, включающих изменение вторичной структуры РНК, таких как инициация трансляции, ядерная и митохондриальный сращивание, и рибосома и сплайсосома сборка. Судя по структуре распространения, некоторые члены этой семьи участвуют в эмбриогенез, сперматогенез, а также рост и деление клеток. Этот ген кодирует белок DEAD-бокса, который является функциональным гомолог делящихся дрожжей Prp8 белок, участвующий в развитии клеточного цикла. Этот ген отображается в области MHC на хромосома 6p21.3, область, где много злокачественных, генетических и аутоиммунный гены болезней связаны.^[6]

Рекомендации

1. ENSG00000206486, ENSG00000233418, ENSG00000231377, ENSG00000227222, ENSG00000204560, ENSG00000233049, ENSG00000226171 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000233561, ENSG00000206486, ENSG00000233418, ENSG00000231377, ENSG00000227222, ENSG00000204560, ENSG00000233049, ENSG00000226171 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024422 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Имамура О, Сайки К., Тани Т., Охима Ю., Сугавара М., Фуруичи Ю. (июнь 1998 г.). «Клонирование и характеристика человеческой DEAH-бокса РНК-геликазы, функционального гомолога делящихся дрожжей Cdc28 / Prp8». Нуклеиновые кислоты Res. 26 (9): 2063–8. Дои:10.1093 / nar / 26.9.2063. ЧВК  147520. PMID  9547260.
6. "Ген Entrez: полипептид 16 DHX16 DEAH (Asp-Glu-Ala-His)".

дальнейшее чтение

• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (2003). «Белковые взаимодействия между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК». Genome Res. 12 (11): 1773–84. Дои:10.1101 / гр. 406902. ЧВК  187542. PMID  12421765.
• Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н. и др. (1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (1): 31–9. Дои:10.1093 / днарес / 5.1.31. PMID  9628581.