DDX50 - DDX50

DDX50
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2Э29
Идентификаторы
Псевдонимы	DDX50, GU2, GUB, RH-II / GuB, mcdrh, DEAD-box Helicase 50, DExD-box геликаза 50
Внешние идентификаторы	OMIM: 610373 MGI: 2182303 ГомолоГен: 56986 Генные карты: DDX50
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q22.1 Начинать 68,901,286 бп[1] Конец 68,946,847 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 B4 Начинать 62,615,895 бп[2] Конец 62,651,218 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • гидролазная активность • Связывание АТФ • GO: 0008026 геликазная активность • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК Сотовый компонент • клеточная мембрана • мембрана • ядро клетки • ядрышко • цитоплазма Биологический процесс • Раскрутка вторичной структуры РНК Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	79009	94213
Ансамбль	ENSG00000107625	ENSMUSG00000020076
UniProt	Q9BQ39	Q99MJ9
RefSeq (мРНК)	NM_024045	NM_053183 NM_001358819 NM_001358820
RefSeq (белок)	NP_076950	NP_444413 NP_001345748 NP_001345749
Расположение (UCSC)	Chr 10: 68.9 - 68.95 Мб	Chr 10: 62,62 - 62,65 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX50 является фермент что у людей кодируется DDX50 ген.^[5][6]

МЕРТВАЯ коробка белки, характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), являются предполагаемыми РНК геликасы. Они участвуют в ряде клеточных процессов, связанных с изменением РНК. вторичная структура такие как инициация трансляции, ядерный и митохондриальный сплайсинг и рибосома и сплайсосома сборка. На основании паттернов их распределения некоторые члены этого семейства DEAD-боксов, как полагают, участвуют в эмбриогенез, сперматогенез, и рост клеток и деление. Этот ген кодирует фермент DEAD-бокса, который может участвовать в рибосомная РНК синтез или обработка. Этот ген и DDX21, также называемые RH-II / GuA, имеют схожие геномные структуры и находятся в тандемной ориентации на хромосома 10, предполагая, что два гена возникли дупликация гена в эволюции. Этот ген имеет псевдогены на хромосомах 2, 3 и 4. Альтернативная сварка из этого порождает несколько варианты расшифровки, но полная длина всех остальных вариантов, кроме одного, не определена.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000107625 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000020076 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Вальдес BC, Ян Х, Хонг Э., Секвитин AM (март 2002 г.). «Геномная структура недавно идентифицированного паралога РНК-геликазы II / Gu: обнаружение псевдогенов и множественных альтернативно сплайсированных мРНК». Ген. 284 (1–2): 53–61. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00888-5. PMID  11891046.
6. «Ген Entrez: полипептид 50 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) DDX50».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298. S2CID  14132033.
• Scherl A, Couté Y, Déon C и др. (2003). «Функциональный протеомный анализ ядрышка человека». Мол. Биол. Клетка. 13 (11): 4100–9. Дои:10.1091 / mbc.E02-05-0271. ЧВК  133617. PMID  12429849.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К. и др. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.