Определяющая комплементарность область - Complementarity-determining region

«Верхняя» часть (Fab регион ) антитела. Определяющие комплементарность области тяжелая цепь показаны красным (PDB: 1IGT​).

Определяющие комплементарность регионы (CDR) являются частью цепочек переменных в иммуноглобулины (антитела) и Рецепторы Т-клеток, создано В-клетки и Т-клетки соответственно, где эти молекулы связываются со своим специфическим антигеном. Набор CDR составляет паратоп. Как наиболее вариабельные части молекул, CDR имеют решающее значение для разнообразия антигенных специфичностей, создаваемых лимфоциты.

Расположение и структура

Эскиз антитело с вариабельные домены показаны синим цветом, а CDR (которые являются частью вариабельных доменов) - голубым.

Есть три CDR (CDR1, CDR2 и CDR3), расположенных не последовательно, на аминокислотная последовательность из вариабельный домен рецептора антигена. Поскольку рецепторы антигена обычно состоят из двух вариабельных доменов (на двух разных полипептидных цепях, тяжелый и легкая цепь ) существует шесть CDR для каждого рецептора антигена, которые могут вместе вступать в контакт с антигеном. Одна молекула антитела имеет два рецептора антигена и, следовательно, содержит всего двенадцать CDR. На вариабельный домен в антителах приходится по три петли CDR. Шестьдесят CDR можно найти на пентамерном IgM молекула.

Поскольку большинство вариаций последовательностей, связанных с иммуноглобулинами и рецепторами Т-клеток, обнаруживается в CDR, эти области иногда называют гипервариабельные области.[1] Внутри переменной домен, CDR1 и CDR2 находятся в переменной (V) область, край полипептидной цепи, а CDR3 включает некоторые из V, все разнообразие (D, только тяжелые цепи) и соединяющиеся (J) области.[2] CDR3 - самый изменчивый.

В третичная структура антитела важно анализировать и конструировать новые антитела. Трехмерные структуры не-H3 CDR антител были сгруппированы и классифицированы Chothia et al.[3] и совсем недавно North et al.[4] Гомологическое моделирование представляет собой вычислительный метод построения третичных структур из аминокислотных последовательностей. Так называемые H3-правила - это эмпирические правила для построения моделей CDR3.[5]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Аббас А.К. и Лихтман А.Х. (2003). Клеточная и молекулярная иммунология (5-е изд.). Сондерс, Филадельфия. ISBN  0-7216-0008-5.
  2. ^ Уильям Э. Пол (2008). Фундаментальная иммунология (6-е изд.). Липпинкотт Уильямс и Уилкинс. ISBN  978-0-7817-6519-0.
  3. ^ Аль-Лазикани, Б .; Леск, А. М .; Чотиа, К. (1997). «Стандартные конформации канонических структур иммуноглобулинов». Журнал молекулярной биологии. 273 (4): 927–948. Дои:10.1006 / jmbi.1997.1354. PMID  9367782.
  4. ^ Север, Б .; Lehmann, A .; Данбрак-младший, Р. Л. (2011). «Новая кластеризация конформаций петель CDR антител». Журнал молекулярной биологии. 406 (2): 228–256. Дои:10.1016 / j.jmb.2010.10.030. ЧВК  3065967. PMID  21035459.
  5. ^ Shirai, H; Кидера, А; Накамура, Х (1999). «H3-правила: идентификация структур CDR-H3 в антителах». Письма FEBS. 455 (1–2): 188–97. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00821-2. PMID  10428499.

внешняя ссылка