Подавление CG - CG suppression

Как метилирование сайтов CpG с последующим спонтанным дезаминированием приводит к недостатку сайтов CpG в метилированной ДНК. В результате создаются остаточные островки CpG в областях, где метилирование редкое, и сайты CpG прилипают.

Подавление CG это термин для явления, которое Динуклеотиды CG очень необычны в большинстве частей позвоночное животное геномы.

Во взрослых соматических тканях остатки цитозина могут быть метилированный, и это происходит почти исключительно в симметричном контексте CpG.[1] Метилированные остатки C спонтанно дезаминируют с образованием остатков T; следовательно, динуклеотиды CpG устойчиво мутируют в динуклеотиды TpG, что приводит к недостаточной представленности динуклеотидов CpG в геноме человека (они встречаются только с 21% ожидаемой частоты).[2] (С другой стороны, спонтанное дезаминирование неметилированных остатков C приводит к образованию остатков U - мутации, которая быстро распознается и восстанавливается клеткой).

В человек и мышь, CG - реже всего динуклеотид, составляя менее 1% всех динуклеотидов. ГК занимают второе место по частоте, составляя более 4% от всех динуклеотидов, поэтому ГК более чем в четыре раза реже, чем все другие динуклеотиды.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Закон J, Якобсен С.Е. (2010). «Установление, поддержание и изменение паттернов метилирования ДНК у растений и животных». Nat. Преподобный Жене. 11 (3): 204–220. Дои:10.1038 / nrg2719. ЧВК  3034103. PMID  20142834.
  2. ^ Международный консорциум по секвенированию генома человека; и другие. (Февраль 2001 г.). "Начальная последовательность и анализ человеческого генома" (PDF). Природа. 409 (6822): 860–921. Дои:10.1038/35057062. PMID  11237011.