Бета-дефенсин 1 - Beta defensin 1

DEFB1
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1E4S, 1IJU, 1IJV, 1KJ5, 2NLB, 2NLC, 2NLD, 2NLE, 2NLF, 2NLG, 2NLH, 2NLP, 2NLQ, 2NLS, 2PLZ
Идентификаторы
Псевдонимы	DEFB1, BD1, DEFB-1, DEFB101, HBD1, дефенсин бета 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602056 ГомолоГен: 88476 Генные карты: DEFB1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8p23.1 Начинать 6,870,592 бп[1] Конец 6,877,936 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание с хемокиновым рецептором CCR6 • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • Просвет Гольджи • внеклеточная область • внеклеточная экзосома • середина спермы • внеклеточный • внешний компонент мембраны • микровезикула • мембрана Биологический процесс • хемотаксис • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • ответ защиты • врожденный иммунный ответ слизистой оболочки • острый воспалительный ответ • реакция на бактерии • иммунная реакция • ответ на тестостерон • положительная регуляция подвижности жгутиковых сперматозоидов, участвующая в капситации • защитный ответ на бактерию • кальций-опосредованная передача сигналов с использованием внутриклеточного источника кальция • цАМФ-опосредованная передача сигналов • защитный ответ на грамотрицательные бактерии • антимикробный гуморальный ответ • врожденная иммунная система • антимикробный гуморальный иммунный ответ, опосредованный антимикробным пептидом • защитный ответ на грамположительные бактерии Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1672	н / д
Ансамбль	ENSG00000164825 ENSG00000284881	н / д
UniProt	P60022	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_005218	н / д
RefSeq (белок)	NP_005209	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 8: 6,87 - 6,88 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Бета-дефенсин 1 это белок что у людей кодируется DEFB1 ген.^[3][4]

Дефенсины образуют семейство микробицидных и цитотоксических пептидов, производимых нейтрофилы. Члены семейства дефенсинов очень похожи по последовательности белков. Этот ген кодирует дефенсин, бета-1, антимикробный пептид, участвующий в устойчивости эпителиальные поверхности к микробной колонизации. Этот ген картируется в непосредственной близости от дефенсина, члена семейства дефенсинов, альфа-1, и участвует в патогенезе кистозный фиброз.^[4] Однонуклеотидные полиморфизмы в DEFB1 ген были связаны с плазмой кинуренин концентрации в сильное депрессивное расстройство пациенты в GWAS.^[5]

Рекомендации

1. ENSG00000284881 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000164825, ENSG00000284881 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Бенш К.В., Райда М., Мегерт Х. Дж., Шульц-Кнаппе П., Форссманн В.Г. (июль 1995 г.). «hBD-1: новый бета-дефенсин из плазмы человека». Письма FEBS. 368 (2): 331–5. Дои:10.1016/0014-5793(95)00687-5. PMID  7628632. S2CID  84766207.
4. «Энтрез Ген: дефенсин DEFB1, бета 1».
5. Лю Д., Рэй Б., Невин Д. Р., Чжан Дж., Атрея А. П., Бирнака Дж. М. и др. (Январь 2018). «Бета-дефенсин 1, рецептор арилуглеводородов и кинуренин плазмы при большом депрессивном расстройстве: геномика с учетом метаболомики». Трансляционная психиатрия. 8 (1): 10. Дои:10.1038 / s41398-017-0056-8. ЧВК  5802574. PMID  29317604.

дальнейшее чтение

• Ганц Т., Лерер Р.И. (май 1995 г.). «Дефенсинс». Фармакология и терапия. 66 (2): 191–205. Дои:10.1016 / 0163-7258 (94) 00076-Ф. PMID  7667395.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Гольдман М.Дж., Андерсон Г.М., Штольценберг Э.Д., Кари УП, Заслофф М., Уилсон Дж.М. (февраль 1997 г.). «Человеческий бета-дефенсин-1 - это чувствительный к соли антибиотик в легких, который инактивирован при муковисцидозе». Клетка. 88 (4): 553–60. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81895-4. PMID  9038346. S2CID  6614946.
• McCray PB, Bentley L (март 1997 г.). «Эпителий дыхательных путей человека экспрессирует бета-дефенсин». Американский журнал респираторной клетки и молекулярной биологии. 16 (3): 343–9. Дои:10.1165 / ajrcmb.16.3.9070620. PMID  9070620.
• Лю Л., Чжао С., Хэн Х. Х., Ганз Т. (август 1997 г.). «Человеческие бета-дефенсин-1 и альфа-дефенсины кодируются соседними генами: два семейства пептидов с различающейся дисульфидной топологией имеют общее происхождение». Геномика. 43 (3): 316–20. Дои:10.1006 / geno.1997.4801. PMID  9268634.
• Valore EV, Park CH, Quayle AJ, Wiles KR, McCray PB, Ganz T (апрель 1998 г.). «Человеческий бета-дефенсин-1: антимикробный пептид тканей мочеполовой системы». Журнал клинических исследований. 101 (8): 1633–42. Дои:10.1172 / JCI1861. ЧВК  508744. PMID  9541493.
• Шнапп Д., Рид С.Дж., Харрис А. (сентябрь 1998 г.). «Локализация экспрессии человеческого бета-дефенсина-1 в поджелудочной железе и почках». Журнал патологии. 186 (1): 99–103. Дои:10.1002 / (SICI) 1096-9896 (199809) 186: 1 <99 :: AID-PATH133> 3.0.CO; 2- #. PMID  9875146.
• Хирацука Т., Наказато М., Ашитани Дж., Мацукура С. (февраль 1999 г.). «[Исследование человеческого бета-дефенсина-1 и человеческого бета-дефенсина-2 в защите слизистой оболочки дыхательных путей]». Kansenshogaku Zasshi. Журнал Японской ассоциации инфекционных заболеваний. 73 (2): 156–62. Дои:10.11150 / kansenshogakuzasshi1970.73.156. PMID  10213993.
• Гропп Р., Фрай М., Вагнер Т.О., Баргон Дж. (Апрель 1999 г.). «Эпителиальные дефенсины ухудшают аденовирусную инфекцию: значение для аденовирусной генной терапии». Генная терапия человека. 10 (6): 957–64. Дои:10.1089/10430349950018355. PMID  10223729.
• Мэтьюз М., Джиа Х.П., Гатмиллер Дж. М., Лош Г., Грэм С., Джонсон Г. К. и др. (Июнь 1999 г.). «Производство антимикробных пептидов бета-дефенсина слизистой оболочкой полости рта и слюнными железами». Инфекция и иммунитет. 67 (6): 2740–5. Дои:10.1128 / IAI.67.6.2740-2745.1999. ЧВК  96577. PMID  10338476.
• Бё Р., Сильвола Дж., Янг Дж., Моэнс У., МакКрей П.Б., Стенфорс Л.Е., Сельфелид Р. (сентябрь 1999 г.). «Человеческая мРНК бета-дефенсина-1 транскрибируется в барабанной перепонке и эпителии прилегающего слухового прохода». Инфекция и иммунитет. 67 (9): 4843–6. Дои:10.1128 / IAI.67.9.4843-4846.1999. ЧВК  96817. PMID  10456939.
• Ян Д., Чертов О., Быковская С. Н., Чен К., Буффо М. Дж., Шоган Дж. И др. (Октябрь 1999 г.). «Бета-дефенсины: связь врожденного и адаптивного иммунитета через дендритные и Т-клеточные CCR6». Наука. 286 (5439): 525–8. Дои:10.1126 / science.286.5439.525. PMID  10521347.
• Tunzi CR, Harper PA, Bar-Oz B, Valore EV, Semple JL, Watson-MacDonell J, et al. (Июль 2000 г.). «Экспрессия бета-дефенсина в эпителии молочной железы человека». Педиатрические исследования. 48 (1): 30–5. Дои:10.1203/00006450-200007000-00008. PMID  10879797.
• Сахасрабуде К.С., Кимбалл-младший, Мортон Т.Х., Вайнберг А., Дейл Б.А. (сентябрь 2000 г.). «Экспрессия антимикробного пептида бета-дефенсина 1 человека в протоковых клетках малых слюнных желез и обнаружение в слюне». Журнал стоматологических исследований. 79 (9): 1669–74. Дои:10.1177/00220345000790090601. PMID  11023262. S2CID  2364914.
• Джиа ХП, Старнер Т., Акерманн М., Кирби П., Тэк Б.Ф., МакКрей ПБ (январь 2001 г.). «Обильная экспрессия человеческого бета-дефенсина-1 в молоке и эпителии молочных желез». Журнал педиатрии. 138 (1): 109–12. Дои:10.1067 / mpd.2001.109375. PMID  11148522.
• Али Р.С., Фалконер А., Икрам М., Биссет С.Э., Церио Р., Куинн А.Г. (июль 2001 г.). «Экспрессия пептидных антибиотиков бета-дефенсин-1 человека и бета-дефенсин-2 человека в нормальной коже человека». Журнал следственной дерматологии. 117 (1): 106–11. Дои:10.1046 / j.0022-202x.2001.01401.x. PMID  11442756.
• Carothers DG, Graham SM, Jia HP, Ackermann MR, Tack BF, McCray PB (2001). «Производство антимикробных пептидов бета-дефенсина слизистой оболочкой гайморовой пазухи». Американский журнал ринологии. 15 (3): 175–9. Дои:10.2500/105065801779954238. PMID  11453504. S2CID  31583849.
• Гувер Д.М., Чертов О., Любковски Дж. (Октябрь 2001 г.). «Структура человеческого бета-дефенсина-1: новое понимание структурных свойств бета-дефенсинов». Журнал биологической химии. 276 (42): 39021–6. Дои:10.1074 / jbc.M103830200. PMID  11486002.