B4GALT4 - B4GALT4

B4GALT4
Идентификаторы
Псевдонимы	B4GALT4, B4Gal-T4, beta4Gal-T4, бета-1,4-галактозилтрансфераза 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 604015 MGI: 1928387 ГомолоГен: 37848 Генные карты: B4GALT4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q13.32 Начинать 119,211,732 бп[1] Конец 119,240,946 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 | 16 B4 Начинать 38,742,264 бп[2] Конец 38,769,049 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • галактозилтрансферазная активность • Активность N-ацетиллактозаминсинтазы • трансферазная активность, перенос гликозильных групп • трансферазная активность • бета-N-ацетилглюкозаминилгликопептид бета-1,4-галактозилтрансферазная активность Сотовый компонент • Мембрана Гольджи • мембрана • Мембрана цистерны Гольджи • неотъемлемый компонент мембраны • аппарат Гольджи Биологический процесс • гликозилирование белков • процесс биосинтеза кератансульфата • мембранный липидный метаболический процесс • углеводный обмен Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8702	56375
Ансамбль	ENSG00000121578	ENSMUSG00000022793
UniProt	O60513	Q9JJ04
RefSeq (мРНК)	NM_003778 NM_212543	NM_001285793 NM_019804
RefSeq (белок)	NP_003769 NP_997708	NP_001272722 NP_062778
Расположение (UCSC)	Chr 3: 119.21 - 119.24 Мб	Chr 16: 38.74 - 38.77 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Бета-1,4-галактозилтрансфераза 4 является фермент что у людей кодируется B4GALT4 ген.^[5][6]

Этот ген является одним из семи бета-1,4-галактозилтрансфераза (beta4GalT) гены. Они кодируют тип II мембраносвязанный гликопротеины которые кажутся эксклюзивными специфичность для донора субстрат UDP-галактоза; все передают галактозу в бета1,4 связи с аналогичными акцепторными сахарами: GlcNAc, Glc, и Xyl. Каждый beta4GalT выполняет свою функцию в биосинтез разных гликоконъюгаты и сахарид конструкции. Как тип II мембранные белки, у них есть N-концевой гидрофобный сигнальная последовательность который направляет белок в аппарат Гольджи и который затем остается нерасщепленным, чтобы функционировать как трансмембранный якорь. К сходство последовательностей, beta4GalT образуют четыре группы: beta4GalT1 и beta4GalT2, beta4GalT3 и beta4GalT4, beta4GalT5 и beta4GalT6 и beta4GalT7. Фермент, кодируемый этим геном, в основном играет роль в гликолипид биосинтез. Два попеременно соединенных варианты расшифровки были обнаружены для этого гена.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000121578 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022793 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ло Н. В., Шейпер Дж. Х., Певснер Дж., Шейпер Н. Л. (август 1998 г.). «Расширяющееся семейство генов бета-4-галактозилтрансферазы: сообщения из банков данных». Гликобиология. 8 (5): 517–26. Дои:10,1093 / гликоб / 8.5.517. PMID  9597550.
6. «Ген Entrez: B4GALT4 UDP-Gal: betaGlcNAc beta 1,4-галактозилтрансфераза, полипептид 4».

внешняя ссылка

• Человек B4GALT4 расположение генома и B4GALT4 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Амадо М., Алмейда Р., Швентек Т., Клаузен Х (2000). «Идентификация и характеристика больших семейств генов галактозилтрансфераз: галактозилтрансферазы для всех функций». Биохим. Биофиз. Acta. 1473 (1): 35–53. Дои:10.1016 / S0304-4165 (99) 00168-3. PMID  10580128.
• Кальянараман В.С., Родригес В., Веронезе Ф. и др. (1990). «Характеристика секретируемых природных gp120 и gp160 вируса иммунодефицита человека типа 1». AIDS Res. Гм. Ретровирусы. 6 (3): 371–80. Дои:10.1089 / помощь.1990.6.371. PMID  2187500.
• Пал Р., Хок Г. М., Сарнгадхаран М. Г. (1989). «Роль олигосахаридов в процессинге и созревании гликопротеинов оболочки вируса иммунодефицита человека 1 типа». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 86 (9): 3384–8. Bibcode:1989ПНАС ... 86.3384П. Дои:10.1073 / пнас.86.9.3384. ЧВК  287137. PMID  2541446.
• Дьюар Р.Л., Васудевачари МБ, Натараджан В., Зальцман Н.П. (1989). «Биосинтез и процессинг гликопротеинов оболочки вируса иммунодефицита человека 1 типа: влияние монензина на гликозилирование и транспорт». Дж. Вирол. 63 (6): 2452–6. Дои:10.1128 / jvi.63.6.2452-2456.1989. ЧВК  250699. PMID  2542563.
• Козарский К., Пенман М., Басирипур Л. и др. (1989). «Гликозилирование и процессинг белка оболочки вируса иммунодефицита человека 1 типа». J. Acquir. Иммунодефицит. Syndr. 2 (2): 163–9. PMID  2649653.
• Робинсон В.Е., Монтефиори, округ Колумбия, Митчелл В.М. (1988). «Доказательства участия маннозильных остатков в патогенезе вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1)». AIDS Res. Гм. Ретровирусы. 3 (3): 265–82. Дои:10.1089 / помощь.1987.3.265. PMID  2829950.
• Швентек Т., Алмейда Р., Левери С.Б. и др. (1998). «Клонирование нового члена UDP-галактозы: бета-N-ацетилглюкозамин бета1,4-галактозилтрансферазы, beta4Gal-T4, участвующего в биосинтезе гликосфинголипидов». J. Biol. Chem. 273 (45): 29331–40. Дои:10.1074 / jbc.273.45.29331. PMID  9792633.
• Судзуки Ю., Цунода Т., Сесе Дж. И др. (2001). «Идентификация и характеристика потенциальных промоторных областей 1031 вида генов человека». Genome Res. 11 (5): 677–84. Дои:10.1101 / гр.гр-1640р. ЧВК  311086. PMID  11337467.
• Гуо С., Сато Т., Ширане К., Фурукава К. (2002). «Галактозилирование N-связанных олигосахаридов бета-1,4-галактозилтрансферазами человека I, II, III, IV, V и VI, экспрессируемых в клетках Sf-9». Гликобиология. 11 (10): 813–20. Дои:10.1093 / гликоб / 11.10.813. PMID  11588157.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабное усилие по идентификации новых секретируемых человеком и трансмембранных белков: оценка биоинформатики». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.