Артемида комплекс - Artemis complex

В Артемида комплекс это белковый комплекс что функционирует в V (D) J рекомбинация, то соматическая рекомбинация процесс, который порождает разнообразие в Т-клетка рецепторы и иммуноглобулины. Мутации в комплексе Artemis приводят к гиперчувствительности к агентам, вызывающим двухцепочечный разрыв ДНК, таким как радиация; и поэтому у людей с мутациями в комплексе Artemis может развиться тяжелый комбинированный иммунодефицит, связанный с радиочувствительностью (RS-SCID).

Механизм

Белок Artemis имеет одноцепочечную специфичность. От 5 футов до 3 футов экзонуклеазной активностью, но он также может образовывать комплекс с ДНК-зависимым 469 кДа протеинкиназа (ДНК-ПК_cs) для усиления эндонуклеазной активности на шпильках и 5 'и 3' выступах; ДНК-ПК_cs фосфорилирует Artemis, чтобы дать ему эту новую функцию.^[1]

Во время рекомбинации V (D) J Комплекс РАГ (состоит из РАГ-1 и RAG-2 в комплексе с HMG1 или HMG2) связывается с двумя сигнальные последовательности рекомбинации (RSS); комплекс связывается друг с другом, объединяя нити вместе, создавая петлю, которая содержит всю ДНК между двумя RSS. Затем часть этой ДНК удаляется, и комплекс RAG затем вызывает разрыв точно на 5'-конце гептамер. Это создает 3'-группу ОН, которая действует как нуклеофил в атаке переэтерификации на антипараллельную цепь, давая шпильку ДНК (две шпильки, поскольку димер комплекса RAG связывается с двумя цепями). В лимфоидных клетках рекомбинация может происходить только между 12-RSS и 23-RSS; это известно как правило 12/23.

Четыре конца ДНК (два закрученных кодирующих конца и два сигнальных конца) удерживаются вместе в комплексе после расщепления с помощью комплекса RAG. Артемида: ДНК-ПК_cs сложный, наряду с Ку и ДНК-лигаза Димер IV / XRCC4 может затем замкнуть сигнальные концы в «сигнальное соединение». Он также открывает шпильки кодирующих концов, и этот процесс считается опосредованным комплексом RAG (комплекс RAG может открывать свободные шпильки сам по себе, но это наблюдается только в буферах, содержащих марганец, но не в содержащих магний буферы). Нуклеотиды добавляются на открытых концах терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза (TdT). Это происходит до тех пор, пока не появятся комплементарные последовательности, после чего противоположные нити соединятся в пары. Затем экзонуклеазы удаляют неспаренные нуклеотиды, а лигазы заполняют пробелы. Это создает соединение между каждым соединенным сегментом, содержащим неопределенное количество добавленных нуклеотидов, фланкированное палиндромной последовательностью из 2 остатков.

Другое использование

Артемида: ДНК-ПК_cs также используется для обработки 5 'и 3' концов в негомологичных соединениях концов ДНК.

Рекомендации

1. Май; Pannicke, U; Шварц, К; Либер, MR (2002). «Раскрытие шпильки и процессинг выступа с помощью комплекса Artemis / ДНК-зависимой протеинкиназы при негомологичном соединении концов и рекомбинации V (D) J». Клетка. 108 (6): 781–94. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00671-2. PMID  11955432.