Археоптерикс (визуализация и анализ эволюционного дерева) - Archaeopteryx (evolutionary tree visualization and analysis)

Археоптерикс
Разработчики)Кристиан М. Змасек
Стабильный выпуск
0.972+ бета за 9 месяцев / 2012.08.08
Репозиторий
Отредактируйте это в Викиданных
Операционная системаWindows, Linux, Mac OS X
ТипБиоинформатика, филогеномика
ЛицензияLGPL
Интернет сайтhttps://sites.google.com/site/cmzmasek/home/software/archaeopteryx

Археоптерикс это интерактивный программное обеспечение программа, написанная на Ява, для просмотр, редактирование и анализ филогенетические деревья. Этот тип программы можно использовать для различных анализы из наборы молекулярных данных, но специально разработан для филогеномика. Помимо форматов описания деревьев с ограниченной выразительностью (таких как Newick / New Hamphshire, Nexus), он также реализует phyloXML[1] формат.Archaeopteryx является преемником программы Java Средство просмотра деревьев (Квадроцикл).[2]

использованная литература

  1. ^ Хан, Мира В .; Змасек, Кристиан М. (2009). "phyloXML: XML для эволюционной биологии и сравнительной геномики". BMC Bioinformatics. 10: 356. Дои:10.1186/1471-2105-10-356. ЧВК  2774328. PMID  19860910.
  2. ^ Zmasek, Christian M .; Эдди, Шон Р. (2001). «ATV: отображение аннотированных филогенетических деревьев и управление ими». Биоинформатика. 17 (4): 383–384. Дои:10.1093 / биоинформатика / 17.4.383. PMID  11301314.

внешние ссылки