Аннексин А7 - Annexin A7

ANXA7
Идентификаторы
Псевдонимы	ANXA7, ANX7, SNX, SYNEXIN, аннексин A7
Внешние идентификаторы	OMIM: 186360 MGI: 88031 ГомолоГен: 36149 Генные карты: ANXA7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q22.2 Начните 73,375,101 бп[1] Конец 73,414,076 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 A3 | 14 11,53 см Начните 20,455,260 бп[2] Конец 20,480,133 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • кальций-зависимое связывание с белками • связывание интегрина • GO: 0001948 связывание с белками • кальций-зависимое связывание фосфолипидов • Связывание РНК • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • везикул • цитозоль • ядерная оболочка • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • клеточная мембрана • мембрана хромаффинных гранул • внеклеточная экзосома • ядро клетки • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • гемостаз • дифференцировка эпителиальных клеток • реакция на органическое циклическое соединение • реакция на солевой стресс • клеточный гомеостаз ионов кальция • Липидный бислой слияния • отрицательная регуляция экспрессии генов • аутофагия • ответ на ион кальция • регулировка формы клеток • поведение социального организма • клеточный гомеостаз воды • клеточная пролиферация Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	310	11750
Ансамбль	ENSG00000138279	ENSMUSG00000021814
UniProt	P20073	Q07076
RefSeq (мРНК)	NM_001156 NM_004034 NM_001320879 NM_001320880	NM_001110794 NM_009674 NM_001374757
RefSeq (белок)	NP_001147 NP_001307808 NP_001307809 NP_004025	NP_001104264 NP_033804 NP_001361686
Расположение (UCSC)	Chr 10: 73,38 - 73,41 Мб	Chr 14: 20.46 - 20.48 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Аннексин А7 это белок что у людей кодируется ANXA7 ген.^[5][6]

Аннексин VII является членом семейства аннексинов кальций-зависимых фосфолипид-связывающих белков. Ген Аннексина VII содержит 14 экзоны и охватывает приблизительно 34 т.п.н. ДНК. An альтернативно сращенный экзон кассеты приводит к двум транскриптам мРНК размером 2,0 и 2,4 т.п.н., которые, как предполагается, будут генерировать два изоформы белка различаются своим N-концевым доменом. Альтернативное событие сплайсинга тканеспецифично, и мРНК, содержащая экзон кассеты, преобладает в головном мозге, сердце и скелетных мышцах. Транскрипты также различаются своими 3'-некодирующими областями за счет использования двух альтернативных сигналов поли (А). Выбор сигналов поли (А) не зависит от паттерна сплайсинга мРНК. ~ Аннексин VII кодирует белок с молекулярной массой приблизительно 51 кДа с уникальным высокогидрофобным N-концевым доменом из 167 аминокислот и консервативной С-концевой областью из 299 аминокислот. Последний домен состоит из чередующихся гидрофобных и гидрофильных сегментов. Структурный анализ белка предполагает, что Аннексин VII представляет собой мембранно-связывающий белок с различными свойствами, включая активность чувствительных к напряжению кальциевых каналов, ионную селективность и слияние мембран.^[6]

Взаимодействия

ANXA7 был показан взаимодействовать с участием ALG2^[7] и НИИ.^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000138279 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021814 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ширван А., Шривастава М., Ван М.Г., Cultraro C, Магендзо К., МакБрайд О.В., Поллард Х.Б., Бернс А.Л. (июль 1994 г.). «Дивергентная структура гена синексина человека (аннексина VII) и отнесение к хромосоме 10». Биохимия. 33 (22): 6888–901. Дои:10.1021 / bi00188a019. PMID  7515686.
6. "Entrez Gene: ANXA7, аннексин A7".
7. Сато, Хирокадзу; Накано Йошими; Сибата Хидеки; Маки Масатоши (ноябрь 2002 г.). «Пента-EF-домен ALG-2 взаимодействует с аминоконцевыми доменами как аннексина VII, так и аннексина XI Са2 + -зависимым образом». Биохим. Биофиз. Acta. Нидерланды. 1600 (1–2): 61–7. Дои:10.1016 / S1570-9639 (02) 00445-4. ISSN  0006-3002. PMID  12445460.
8. Браунауэлл, А. М.; Creutz C E (август 1997 г.). «Кальций-зависимое связывание сорцина с N-концевым доменом синексина (аннексина VII)». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 272 (35): 22182–90. Дои:10.1074 / jbc.272.35.22182. ISSN  0021-9258. PMID  9268363.

внешние ссылки

• Человек ANXA7 расположение генома и ANXA7 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Creutz CE, Moss S, Edwardson JM и др. (1992). «Дифференциальное распознавание секреторных пузырьков аннексинами. Курс Европейской организации молекулярной биологии» Расширенные методы изучения секрета"". Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 184 (1): 347–52. Дои:10.1016 / 0006-291X (92) 91199-Z. PMID  1533123.
• Magendzo K, Shirvan A, Cultraro C и др. (1991). «Альтернативный сплайсинг мРНК синексина человека в головном мозге, сердечной мышце и скелетных мышцах изменяет уникальный N-концевой домен». J. Biol. Chem. 266 (5): 3228–32. PMID  1825209.
• Бернс А.Л., Магендзо К., Ширван А. и др. (1989). «Активность кальциевых каналов очищенного синексина человека и структура гена синексина человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 86 (10): 3798–802. Bibcode:1989PNAS ... 86.3798B. Дои:10.1073 / pnas.86.10.3798. ЧВК  287228. PMID  2542947.
• Селберт С., Фишер П., Понграц Д. и др. (1995). «Экспрессия и локализация аннексина VII (синексина) в мышечных клетках». J. Cell Sci. 108 (1): 85–95. PMID  7738119.
• Zhang-Keck ZY, Srivastava M, Kozak CA, et al. (1994). «Геномная организация и хромосомная локализация гена синексина мыши». Biochem. J. 301 (Pt 3): 835–45. Дои:10.1042 / bj3010835. ЧВК  1137063. PMID  8053909.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Brownawell AM, Creutz CE (1997). «Кальций-зависимое связывание сорцина с N-концевым доменом синексина (аннексина VII)». J. Biol. Chem. 272 (35): 22182–90. Дои:10.1074 / jbc.272.35.22182. PMID  9268363.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Клемен К.С., Хофманн А., Зампарелли С., Ноегель А.А. (2000). «Экспрессия и локализация изоформ аннексина VII (синексина) в дифференцирующих миобластах». J. Muscle Res. Cell. Мотил. 20 (7): 669–79. Дои:10.1023 / А: 1005524623337. PMID  10672515. S2CID  20610226.
• Caohuy H, Pollard HB (2001). «Активация аннексина 7 протеинкиназой C in vitro и in vivo». J. Biol. Chem. 276 (16): 12813–21. Дои:10.1074 / jbc.M008482200. PMID  11278415.
• Шривастава М., Бубендорф Л., Срикантан В. и др. (2001). «ANX7, кандидатный ген-супрессор рака простаты». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (8): 4575–80. Bibcode:2001PNAS ... 98.4575S. Дои:10.1073 / pnas.071055798. ЧВК  31876. PMID  11287641.
• Клемен С.С., Герр С., Ли А.А. и др. (2001). «Аннексин VII: астроглиальный белок, проявляющий Ca2 + -зависимое субклеточное распределение». NeuroReport. 12 (6): 1139–44. Дои:10.1097/00001756-200105080-00018. PMID  11338180. S2CID  28417182.
• Ю Ф, Финли Р.Л., Раз А, Ким Х.Р. (2002). «Галектин-3 перемещается к перинуклеарным мембранам и ингибирует высвобождение цитохрома с из митохондрий. Роль синексина в транслокации галектина-3». J. Biol. Chem. 277 (18): 15819–27. Дои:10.1074 / jbc.M200154200. PMID  11839755.
• Caohuy H, Pollard HB (2002). «Протеинкиназа С и гуанозинтрифосфат усиливают кальций-зависимое слияние мембран, управляемое аннексином 7». J. Biol. Chem. 277 (28): 25217–25. Дои:10.1074 / jbc.M202452200. PMID  11994295.
• Сато Х., Накано Й., Сибата Х., Маки М (2002). «Пента-EF-домен ALG-2 взаимодействует с аминоконцевыми доменами как аннексина VII, так и аннексина XI Са2 + -зависимым образом». Биохим. Биофиз. Acta. 1600 (1–2): 61–7. Дои:10.1016 / S1570-9639 (02) 00445-4. PMID  12445460.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Castle J, Garrett-Engele P, Armor CD и др. (2004). «Оптимизация массивов олигонуклеотидов и протоколов амплификации РНК для анализа структуры транскриптов и альтернативного сплайсинга». Геном Биол. 4 (10): R66. Дои:10.1186 / gb-2003-4-10-r66. ЧВК  328455. PMID  14519201.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.