APLP1 - APLP1

APLP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 15:00, 3Q7G, 3Q7L, 3QMK, 4RD9, 4RDA
Идентификаторы
Псевдонимы	APLP1, APLP, предшественник бета-амилоида, такой как белок 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 104775 MGI: 88046 ГомолоГен: 68447 Генные карты: APLP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.12 Начните 35,867,899 бп[1] Конец 35,879,791 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 B1 | 7 18,32 см Начните 30,434,982 бп[2] Конец 30,445,535 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание с альфа-2С адренорецепторами • связывание гепарина • связывание альфа-2B адренергических рецепторов • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • связывание с альфа-2А адренорецепторами • идентичное связывание с белками • связывание ионов переходных металлов Сотовый компонент • цитоплазма • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • клеточная мембрана • базальная мембрана • перинуклеарная область цитоплазмы Биологический процесс • эндоцитоз • развитие нервной системы • клеточный ответ на стимул норадреналина • клеточная адгезия • морфогенез органов животных • апоптотический процесс • отрицательная регуляция сигнального пути рецептора, активирующего аденилатциклазу, G-белок Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	333	11803
Ансамбль	ENSG00000105290	ENSMUSG00000006651
UniProt	P51693	Q03157
RefSeq (мРНК)	NM_005166 NM_001024807	NM_007467
RefSeq (белок)	NP_001019978 NP_005157	NP_031493
Расположение (UCSC)	Chr 19: 35,87 - 35,88 Мб	Chr 7: 30.43 - 30.45 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Амилоидоподобный белок 1, также известен как APLP1, это белок что у людей кодируется APLP1 ген.^[5][6] APLP1 вместе с APLP2 являются важными модуляторами глюкоза и инсулин гомеостаз.^[7]

Функция

Этот ген кодирует член высококонсервативной белок-предшественник амилоида генная семья. Кодируемый белок представляет собой связанный с мембраной гликопротеин, который расщепляется секреты аналогично расщеплению белка-предшественника бета-амилоида A4. Это расщепление высвобождает внутриклеточный цитоплазматический фрагмент, который может действовать как активатор транскрипции. Кодируемый белок также может играть роль в созревании синапсов во время кортикального развития. Альтернативно сращивание Были описаны варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы.^[5]

APLP1 и APLP2 двойной нокаутные мыши дисплей гипогликемия и гиперинсулинемия что указывает на то, что эти два белка являются важными модуляторами гомеостаза глюкозы и инсулина.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105290 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000006651 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: белок-предшественник бета-амилоида APLP1 (A4) 1».
6. Wasco W., Brook JD, Tanzi RE (январь 1993 г.). «Ген амилоидного белка-предшественника (APLP) отображается в длинном плече хромосомы 19 человека». Геномика. 15 (1): 237–9. Дои:10.1006 / geno.1993.1047. PMID  8432545.
7. Needham BE, Wlodek ME, Ciccotosto GD, Fam BC, Masters CL, Proietto J, Andrikopoulos S, Cappai R (июнь 2008 г.). «Идентификация белка-предшественника амилоида (АРР) болезни Альцгеймера и его гомолога APLP2 в качестве основных модуляторов гомеостаза и роста глюкозы и инсулина». Дж. Патол. 215 (2): 155–63. Дои:10.1002 / путь.2343. PMID  18393365. S2CID  1064378.

внешние ссылки

• Человек APLP1 расположение генома и APLP1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Байер Т.А., Каппаи Р., Мастерс С.Л. и др. (2000). «Все вместе - семейство белков, связанных с APP, и болезнь Альцгеймера». Мол. Психиатрия. 4 (6): 524–8. Дои:10.1038 / sj.mp.4000552. PMID  10578233.
• Ким Т.В., Ву К., Сюй Дж.Л. и др. (1996). «Избирательная локализация амилоидного белка-предшественника 1 в постсинаптической плотности коры головного мозга». Brain Res. Мол. Brain Res. 32 (1): 36–44. Дои:10.1016 / 0169-328X (95) 00328-P. PMID  7494461.
• Буш А.И., Петтингелл У.Х., де Паради М. и др. (1994). «Предшественник амилоидного бета-белка и его гомологи у млекопитающих. Доказательства суперсемейства, связывающего гепарин с модулированным цинком». J. Biol. Chem. 269 (43): 26618–21. PMID  7929392.
• Wasco W., Brook JD, Tanzi RE (1993). «Ген амилоидного белка-предшественника (APLP) отображается в длинном плече хромосомы 19 человека». Геномика. 15 (1): 237–9. Дои:10.1006 / geno.1993.1047. PMID  8432545.
• Бресслер С.Л., Грей М.Д., Софер Б.Л. и др. (1997). «Клонирование кДНК и картирование хромосом гена Fe65 человека: взаимодействие консервативных цитоплазматических доменов белка-предшественника бета-амилоида человека и его гомологов с белком Fe65 мыши». Гм. Мол. Genet. 5 (10): 1589–98. Дои:10.1093 / hmg / 5.10.1589. PMID  8894693.
• Палига К., Пераус Г., Крегер С. и др. (1998). «Человеческий предшественник амилоидного белка 1 - клонирование кДНК, эктопическая экспрессия в клетках COS-7 и идентификация растворимых форм в спинномозговой жидкости». Евро. J. Biochem. 250 (2): 354–63. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1997.0354a.x. PMID  9428684.
• Lenkkeri U, Kestilä M, Lamerdin J, et al. (1998). «Структура гена человеческого белка-предшественника амилоида APLP1 на 19q13.1». Гм. Genet. 102 (2): 192–6. Дои:10.1007 / s004390050676. PMID  9521588. S2CID  709094.
• Макнамара MJ, Ruff CT, Wasco W. и др. (1998). «Иммуногистохимический анализ и анализ in situ экспрессии амилоидного предшественника-подобного белка-1 и амилоидного предшественника-подобного белка-2 при болезни Альцгеймера и пожилом контрольном мозге». Мозг Res. 804 (1): 45–51. Дои:10.1016 / S0006-8993 (98) 00653-2. PMID  9729270. S2CID  25127562.
• Томита С., Одзаки Т., Тару Х. и др. (1999). «Взаимодействие нейрон-специфического белка, содержащего PDZ-домены, с белком-предшественником амилоида болезни Альцгеймера». J. Biol. Chem. 274 (4): 2243–54. Дои:10.1074 / jbc.274.4.2243. PMID  9890987.
• Хомаюни Р., Райс Д.С., Шелдон М., Курран Т. (1999). «Disabled-1 связывается с цитоплазматическим доменом амилоидного белка-предшественника 1». J. Neurosci. 19 (17): 7507–15. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.19-17-07507.1999. ЧВК  6782519. PMID  10460257.
• Саймонс А., Рупперт Т., Шмидт С. и др. (2002). «Доказательства для медь-связывающего суперсемейства белка-предшественника амилоида». Биохимия. 41 (30): 9310–20. Дои:10.1021 / bi0258647. PMID  12135352.
• Шейнфельд М.Х., Герси Э., Лаки К. и др. (2003). «Обработка бета-амилоидных белков-предшественников-1 и -2 гамма-секретазой регулирует транскрипцию». J. Biol. Chem. 277 (46): 44195–201. Дои:10.1074 / jbc.M208110200. PMID  12228233.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Уолш Д.М., Фадеева Ю.В., ЛаВуа М.Дж. и др. (2003). «Расщепление гамма-секретазой и связывание с FE65 регулируют ядерную транслокацию внутриклеточного С-концевого домена (ICD) семейства белков APP». Биохимия. 42 (22): 6664–73. Дои:10.1021 / bi027375c. PMID  12779321.
• Ямаками М, Йошимори Т, Йокосава Х (2004). «Tom1, белок, содержащий домен VHS, взаимодействует с толлипом, убиквитином и клатрином». J. Biol. Chem. 278 (52): 52865–72. Дои:10.1074 / jbc.M306740200. PMID  14563850.
• Адлерз Л., Бекман М., Холбак С. и др. (2004). «Накопление белка APLP2, подобного предшественнику амилоида, и снижение APLP1 в дифференцированных ретиноевой кислотой клетках нейробластомы человека при индуцированном куркумином ретракции нейритов». Brain Res. Мол. Мозг Res. 119 (1): 62–72. Дои:10.1016 / j.molbrainres.2003.08.014. PMID  14597230.
• Ли Кью, Зюдхоф TC (2004). «Расщепление белка-предшественника амилоида-бета и белка-предшественника бета-амилоида с помощью BACE 1». J. Biol. Chem. 279 (11): 10542–50. Дои:10.1074 / jbc.M310001200. PMID  14699153.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Эггерт С., Палига К., Соба П. и др. (2004). «Протеолитический процессинг членов семейства генов белка-предшественника амилоида APLP-1 и APLP-2 включает альфа-, бета-, гамма- и эпсилон-подобные расщепления: модуляция процессинга APLP-1 за счет н-гликозилирования». J. Biol. Chem. 279 (18): 18146–56. Дои:10.1074 / jbc.M311601200. PMID  14970212.