Семейство AGCS - AGCS family

Аланин / глицин: белок семейства симпортеров катионов (AGCS)
Идентификаторы
СимволA3P053
PfamPF01235
ИнтерПроIPR001463
PROSITEPS00873

Члены Аланин или глицин: семейство симпортеров катионов (AGCS) (TC № 2.A.25 ) транспорт аланин и / или глицин в Симпорт с Na+ и или H+.

Структура и функции

Известные белки семейства AGCS имеют длину от 445 до 550 аминоацильных остатков и обладают от 8 до 12 предполагаемых трансмембранных α-спиральных гаечных ключей. Члены могут обладать 11 трансмембранными сегментами (TMS), что, по-видимому, верно для DagA (ТК № 2.A.25.1.1 ) и AgcS (ТК № 2.A.25.1.3 ), хотя Acp (ТК № 2.A.25.1.2 ) имеет только 8 TMS, возможно, результат усечения. По состоянию на начало 2016 года, похоже, нет никаких данных о трехмерной кристаллической структуре этих белков. Члены семейства AGCS были обнаружены у бактерий и архей, таких как экстремофильные галотолерантные цианобактерии. Aphanothece halophytica, и термофильные бактерии, Бациллы PS3.[1][2] По состоянию на 2015 год функционально охарактеризовано только три члена семьи. Эти белки демонстрируют ограниченное сходство последовательностей в семействе APC (TC № 2.A.3 ).[3] По состоянию на начало 2016 года, похоже, не было никаких кристаллических структур, доступных для членов семейства AGCS.

Транспортная реакция

Обобщенная транспортная реакция, катализируемая семейством AGCS:[3]

аланин или глицин (выход) + Na+ или H+ (выход) → аланин или глицин (вход) + Na+ или H+ (в).

Белки семейства AGCS

В настоящее время существует 10 белков, принадлежащих к семейству AGCS. Эти белки и их описания можно найти в База данных классификации транспортеров.

Рекомендации

  1. ^ Буалуанг А, Кагеяма Х, Танака Й, Инчароенсакди А, Такабе Т. (2015). «Функциональная характеристика члена семейства аланин или глицин: симпортер катионов в галотолерантной цианобактерии Aphanothece halophytica». Биология, биотехнология и биохимия. 79 (2): 230–5. Дои:10.1080/09168451.2014.968091. PMID  25421789. S2CID  205616830.
  2. ^ Канамори М., Камата Х., Ягисава Х., Хирата Х. (март 1999 г.). «Сверхэкспрессия гена белка-носителя аланина из термофильной бактерии PS3 в Escherichia coli». Журнал биохимии. 125 (3): 454–9. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022308. PMID  10050032.
  3. ^ а б Saier MH. "2.A.25 Семейство аланин или глицин: катионный симпортер (AGCS)". База данных классификации транспортеров. Группа компаний Saier Lab Bioinformatics / SDSC.

дальнейшее чтение

По состоянию на это редактирование, в этой статье используется контент из "2.A.25 Семейство аланин или глицин: катионный симпортер (AGCS)", который лицензирован таким образом, чтобы разрешить повторное использование в соответствии с Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Непортированная лицензия, но не под GFDL. Все соответствующие условия должны быть соблюдены.