ЛЕТУЧАЯ МЫШЬ - ABAT

ЛЕТУЧАЯ МЫШЬ
Идентификаторы
Псевдонимы	ЛЕТУЧАЯ МЫШЬ, Abat, 9630038C02Rik, AI255750, ENSMUSG00000051226, Gabaat, Gabat, Gm9851, I54, Laibat, X61497, GABA-AT, NPD009, 4-аминобутират аминотрансфераза
Внешние идентификаторы	OMIM: 137150 MGI: 2443582 ГомолоГен: 542 Генные карты: ЛЕТУЧАЯ МЫШЬ
Номер ЕС	2.6.1.22
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16p13.2 Начинать 8,674,596 бп[1] Конец 8,784,575 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 | 16 A1 Начинать 8,513,429 бп[2] Конец 8,621,568 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • 4-аминобутираттрансаминазная активность • активность гомодимеризации белков • активность трансаминаз • железо-серное кластерное связывание • связывание ионов металлов • связывание сукцинат-полуальдегиддегидрогеназы • каталитическая активность • (S) -3-амино-2-метилпропионаттрансаминазная активность • пиридоксальфосфатное связывание • 4-аминобутират: активность 2-оксоглутарат трансаминазы Сотовый компонент • 4-аминобутираттрансаминазный комплекс • митохондриальный матрикс • проекция нейрона • митохондрия Биологический процесс • положительная регуляция процесса метаболизма дофамина • положительное регулирование секреции аспартата • ответ на кокаин • процесс биосинтеза гамма-аминомасляной кислоты • ответ на гипоксию • двигательное поведение • поведенческая реакция на кокаин • отрицательное регулирование артериального давления • положительная регуляция тормозного постсинаптического потенциала • ответ на никотин • старение • метаболический процесс гамма-аминомасляной кислоты • отрицательная регуляция агрегации тромбоцитов • развитие мозжечка • совокупление • катаболический процесс нейротрансмиттера • ответ на ион железа • отрицательная регуляция секреции гамма-аминомасляной кислоты • исследовательское поведение • положительное регулирование выработки тепла • отрицательная регуляция секреции дофамина • реакция на этанол • ответ на наркотик • положительная регуляция сокращения гладких мышц матки • положительное регулирование секреции инсулина • положительная регуляция секреции пролактина • катаболический процесс гамма-аминомасляной кислоты Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	18	268860
Ансамбль	ENSG00000183044	ENSMUSG00000057880
UniProt	P80404	P61922
RefSeq (мРНК)	NM_000663 NM_001127448 NM_020686	NM_001170978 NM_172961
RefSeq (белок)	NP_000654 NP_001120920 NP_065737	NP_001164449 NP_766549
Расположение (UCSC)	Chr 16: 8.67 - 8.78 Мб	Chr 16: 8.51 - 8.62 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

4-аминобутират аминотрансфераза это белок что у человека кодируется ABAT ген.^[5] Этот ген расположен в хромосоме 16 в положении 13.2.^[6] Этот ген также имеет другое название, например ГАМК, ГАБАТ, 4-аминобутират трансаминаза, NPD009 и т. Д.^[6] Этот ген в основном и в большом количестве расположен в нейрональные ткани.^[7] 4-Аминобутират аминотрансфераза относится к группе пиридоксаль-5-фосфат-зависимых ферментов, которые активируют большую часть, давая реакцию на аминокислоты.^[8] ABAT состоит из двух мономеров ферментов, каждая субъединица которых имеет молекулярную массу 50 кДа.^[9] Установлено, что почти ряд синапсов человека имеет ГАМК.^[6] ГАМК это нейротрансмиттер который играет разные роли в разных областях центральной и периферической нервной системы. Его также можно найти в некоторых тканях, не имеющих нейронов.^[6] Кроме того, GAD и ГАМК-АТ несут ответственность за регулирование концентрации ГАМК.^[10]

Характеристика

Особенностью ГАМК является то, что он не флуоресцентный и не электроактивный, поэтому трудно определить реакцию ферментов, поскольку не было идентифицировано пероксидаза и дегидрогеназа.^[11] Одной из характеристик ГАМК является низкий уровень липофильности, что затрудняет преодоление гематоэнцефалического барьера. Многие исследователи пытались открыть молекулы, обладающие высокой липофильностью.^[10] Количественная оценка концентрации ГАМК во время клеточной активности должна иметь высокое пространственное и временное разрешение. Как и прежде, высокоэффективная жидкостная хроматография (ВЭЖХ ) был использован для количественного определения уровней концентрации ГАМК. В настоящее время анализируется ГАМК, измеряется в небольшом объеме за короткий период времени с использованием электрохемилюминесценции.^[11] ГАМК действует как тропический фактор, который затем влияет на некоторую активность клеток, такую ​​как быстрое размножение клеток, гибель и дифференцировка клеток. Внутриклеточная коммуникация также является одной из многих функций ГАМК вне нервной системы.^[11]

Функция

4-аминобутират аминотрансфераза (ABAT) отвечает за катаболизм из гамма-аминомасляная кислота (ГАМК), важный, в основном тормозящий нейротрансмиттер в Центральная нервная система, в янтарный полуальдегид. Активный фермент - это гомодимер субъединиц 50 кДа в комплексе с пиридоксаль-5-фосфат. Последовательность белка более чем на 95% аналогична белку свиньи. ABAT в печени и мозге контролируется двумя кодоминантными аллелями с частотой 0,56 и 0,44 в популяции европеоидной расы.^[5] ГАМК действует как тропический фактор, который затем влияет на некоторую активность клеток, такую ​​как быстрое размножение клеток, гибель и дифференцировка клеток. Внутриклеточная коммуникация также является одной из многих функций ГАМК вне нервной системы.^[11] Производство фермента ГАМК-трансаминазы осуществлялось под управлением гена ABAT. Основная функция ABAT - ингибирование (нейротрансмиттер), при котором он предотвращает перегрузку мозга из-за большого количества сигналов.^[6]

ABAT активирует начало ухудшения ГАМК. Точно так же подавление ABAT приводит к истощению временной релаксации нижнего сфинктера пищевода (TLESR) и активности кислотного рефлюкса. Лечение ГЭРБ - это возможное средство подавления физиологии ABAT.^[7]

ABAT Дефицит

Дефект ABAT - необычное заболевание. Признаки и симптомы этого дефицита наблюдались у голландской семьи, у двух братьев и сестер и у шестимесячного японского педиатра. У этих пациентов наблюдаются те же признаки и симптомы. Это включает низкий мышечный тонус или известный как синдром гибкого ребенка, чрезмерно отзывчивые рефлексы и задержка в развитии.^[12] Фенотип дефицита ABAT включает психомоторную отсталость, гипотония, гиперрефлексия, вялость, рефрактерность припадки, и ЭЭГ аномалии. Для этого гена было обнаружено множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, кодирующих одну и ту же изоформу белка.^[5] Аномальный ГАМК-трансаминаза Фермент приводит к энцефалопатии, которая наблюдается у педиатрических пациентов, и этот дефицит имеет ожидаемую продолжительность жизни менее 2 лет, а некоторые выживают дольше, чем данная ожидаемая продолжительность жизни. Аномальный белок, высвобождаемый из неконтролируемого количества ГАМК, будет влиять на рост человека (гормон роста).^[6]

Снижение уровня концентрации ГАМК вызывает судороги.^[13]

Лекарство

Вигабатрин это препарат, который непоправимо подавляет трансаминазу ГАМК, которая вызывает повышенное количество ГАМК в головном мозге.^[14]

Открытие

В недавнем исследовании было обнаружено, что увеличение количества ГАМК остановит последствия наркозависимости.^[15] Подавление ABAT, которое вызывает увеличение количества ГАМК, связано с детьми, страдающими двигательной инвалидностью.^[12] Этот ген также является одной из генетических причин ГЭРБ.^[7]

Было доказано, что ABAT важен для митохондриальных нуклеозидов.^[13]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000183044 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000057880 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: 4-аминобутират аминотрансфераза».
6. Ватанабе М., Маэмура К., Канбара К., Тамаяма Т., Хаясаки Х (2002). «ГАМК- и ГАМК-рецепторы в центральной нервной системе и других органах». Международный обзор цитологии. Эльзевир. 213: 1–47. Дои:10.1016 / s0074-7696 (02) 13011-7. ISBN  9780123646170. PMID  11837891.
7. Джирхольт Дж., Аслинг Б., Хаммонд П., Дэвидсон Дж., Кнутссон М., Валентинссон А., Йенсен Дж. М., Леманн А., Агреус Л., Лагерстрём-Фермер М. (апрель 2011 г.). «4-аминобутират аминотрансфераза (ABAT): генетические и фармакологические доказательства участия в гастроэзофагеальной рефлюксной болезни». PLOS ONE. 6 (4): e19095. Дои:10.1371 / journal.pone.0019095. ЧВК  3084265. PMID  21552517.
8. Маркова М., Пенефф С., Хьюлинс М.Дж., Ширмер Т., Джон Р.А. (октябрь 2005 г.). «Детерминанты субстратной специфичности омега-аминотрансфераз». Журнал биологической химии. 280 (43): 36409–16. Дои:10.1074 / jbc.m506977200. PMID  16096275.
9. Черчич JE (сентябрь 1982 г.). «4-Аминобутиратаминотрансфераза. Различная восприимчивость к ингибиторам, микроокружение сайта связывания кофактора и расстояние между каталитическими сайтами». Европейский журнал биохимии. 126 (3): 507–11. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1982.tb06809.x. PMID  7140743.
10. Товар-Гудиньо Э., Гевара-Салазар Дж. А., Бахена-Эррера Дж. Р., Трухильо-Феррара Дж. Г., Мартинес-Кампос З., Разо-Эрнандес Р. С., Сантьяго А., Пастор Н., Фернандес-Зертуче М. (май 2018 г.). «Pseudomonas fluorescens и In Silico Molecular Modeling». Молекулы. 23 (5): 1128. Дои:10.3390 / молекулы23051128. ЧВК  6099672. PMID  29747438.
11. Салазар-Санчес Дж. С., Моралес-Вильягран А., Лопес-Перес С. Дж., Пардо-Пенья К., Вильяльпандо-Варгас Ф, Медина-Сеха Л. (июнь 2018 г.). «Количественное определение γ-аминомасляной кислоты в биологических образцах небольшого объема посредством ферментативно индуцированной электрохемилюминесценции». Люминесценция. 33 (4): 722–730. Дои:10.1002 / bio.3469. PMID  29653023.
12. Nagappa M, Bindu PS, Chiplunkar S, Govindaraj P, Narayanappa G, Krishnan A, Bharath MM, Swaminathan A, Saini J, Arvinda HR, Sinha S, Mathuranath PS, Taly AB (февраль 2017 г.). «Гиперсонно-гиперкинетическое двигательное расстройство у ребенка с сложной гетерозиготной мутацией в гене 4-аминобутиратаминотрансферазы (ABAT)». Мозг и развитие. 39 (2): 161–165. Дои:10.1016 / j.braindev.2016.08.005. PMID  27596361. S2CID  6403837.
13. Рамирес А.К., Лайнс, доктор медицины, Шамси Ф., Сюэ Р., Ценг Й.Х., Кан Ч.Р., Касиф С., Дрейфус Дж. М. (декабрь 2017 г.). «Объединение измерений внеклеточного потока и моделирования в масштабе генома выявляет различия между коричневыми и белыми адипоцитами». Отчеты по ячейкам. 21 (11): 3040–3048. Дои:10.1016 / j.celrep.2017.11.065. ЧВК  5841536. PMID  29241534.
14. Брехт Э. Дж., Барс К., Гросс Б., Уолтон Дж. П. (август 2017 г.). «Увеличение ГАМК обращает вспять возрастные изменения в возбуждающих рецептивных полях и кодировании интенсивности слуховых нейронов среднего мозга у старых мышей». Нейробиология старения. 56: 87–99. Дои:10.1016 / j.neurobiolaging.2017.04.003. ЧВК  6347026. PMID  28532644.
15. Чой С., Сторичи П., Ширмер Т., Сильверман РБ (февраль 2002 г.). «Дизайн конформационно ограниченного аналога противоэпилептического препарата Вигабатрин, который управляет его механизмом инактивации аминотрансферазы гамма-аминомасляной кислоты». Журнал Американского химического общества. 124 (8): 1620–4. Дои:10.1021 / ja011968d. PMID  11853435.

внешняя ссылка

• Человек ЛЕТУЧАЯ МЫШЬ расположение генома и ЛЕТУЧАЯ МЫШЬ страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Медина-Кауве Л.К., Тобин А.Дж., Де Мейрлейр Л., Яекен Дж., Якобс К., Нихан В.Л., Гибсон К.М. (июнь 1999 г.). «Дефицит 4-амино-аминотрансферазы (ГАМК-трансаминазы)». Журнал наследственных метаболических заболеваний. 22 (4): 414–27. Дои:10.1023 / А: 1005500122231. PMID  10407778. S2CID  11874078.
• Иеремия С., Пови С. (июль 1981 г.). «Биохимическая генетика трансаминазы гамма-аминомасляной кислоты человека». Анналы генетики человека. 45 (3): 231–6. Дои:10.1111 / j.1469-1809.1981.tb00334.x. PMID  7305280. S2CID  84674735.
• Де Биасе Д., Барра Д., Симмако М., Джон Р.А., Босса Ф. (январь 1995 г.). «Первичная структура и тканевое распределение человеческой 4-аминобутират аминотрансферазы». Европейский журнал биохимии. 227 (1–2): 476–80. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1995.tb20412.x. PMID  7851425.
• Чакрабарти Б., Дадбридж Ф., Кент Л., Уилрайт С., Хилл-Коуторн Г., Эллисон С., Банерджи-Басу С., Барон-Коэн С. (июнь 2009 г.). «Гены, связанные с половыми стероидами, нервным ростом и социально-эмоциональным поведением, связаны с аутистическими чертами, эмпатией и синдромом Аспергера». Исследование аутизма. 2 (3): 157–77. Дои:10.1002 / авр.80. PMID  19598235. S2CID  18239947.
• Джирхольт Дж., Аслинг Б., Хаммонд П., Дэвидсон Дж., Кнутссон М., Валентинссон А., Йенсен Дж. М., Леманн А., Агреус Л., Лагерстрём-Фермер М. (апрель 2011 г.). «4-аминобутират аминотрансфераза (ABAT): генетические и фармакологические доказательства участия в гастроэзофагеальной рефлюксной болезни». PLOS ONE. 6 (4): e19095. Дои:10.1371 / journal.pone.0019095. ЧВК  3084265. PMID  21552517.
• Райнесало С., Сарансаари П., Пелтола Дж., Керанен Т. (март 2003 г.). «Поглощение ГАМК и активность ГАМК-трансаминазы в тромбоцитах от больных эпилепсией». Исследования эпилепсии. 53 (3): 233–9. Дои:10.1016 / s0920-1211 (03) 00030-5. PMID  12694932. S2CID  37556128.
• Jaeken J, Casaer P, de Cock P, Corbeel L, Eeckels R, Eggermont E, Schechter PJ, Brucher JM (август 1984). «Дефицит трансаминазы гамма-аминомасляной кислоты: недавно признанная врожденная ошибка метаболизма нейромедиаторов». Нейропедиатрия. 15 (3): 165–9. Дои:10.1055 / с-2008-1052362. PMID  6148708.
• Херл WG, Черчич JE (сентябрь 1984 г.). «Взаимодействие между 4-аминобутират аминотрансферазой и янтарной полуальдегиддегидрогеназой, двумя митохондриальными ферментами». Журнал биологической химии. 259 (18): 11459–63. PMID  6470007.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.