ZRF1 - ZRF1

DNAJC2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2М2Э
Идентификаторы
Псевдонимы	DNAJC2, MPHOSPH11, MPP11, ZRF1, ZUO1, член C2 семейства белков теплового шока DnaJ (Hsp40)
Внешние идентификаторы	OMIM: 605502 MGI: 99470 ГомолоГен: 31656 Генные карты: DNAJC2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7q22.1 Начинать 103,312,289 бп[1] Конец 103,344,830 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 A3 | 5 9,97 см Начинать 21,757,267 бп[2] Конец 21,785,251 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • Связывание с белком Hsp70 • связывание гистонов • связывание хроматина • Активность активатора АТФазы • Связывание РНК • связывание гистонов, зависящее от модификации убиквитина • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • не мембрана • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция клеточного ответа на тепло • Репликация ДНК • Котрансляционный фолдинг белка de novo • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция процесса биосинтеза ДНК • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция активности АТФазы • ковалентная модификация хроматина • организация хроматина • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	27000	22791
Ансамбль	ENSG00000105821	ENSMUSG00000029014
UniProt	Q99543	P54103
RefSeq (мРНК)	NM_001129887 NM_014377 NM_001362667 NM_001362668	NM_009584
RefSeq (белок)	NP_001123359 NP_055192 NP_001349596 NP_001349597	NP_033610
Расположение (UCSC)	Chr 7: 103.31 - 103.34 Мб	Chr 5: 21.76 - 21.79 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

DnaJ гомолог подсемейства C член 2 это белок что у людей кодируется DNAJC2 ген.^[5][6]

Этот ген является членом семейства фосфопротеинов M-фазы (MPP). Ген кодирует фосфопротеин с J-доменом и ДНК-связывающим доменом Myb, который локализуется как в ядро и цитозоль. Белок способен образовывать гетеродимерный комплекс, который связывается с рибосомы, действуя как молекулярный шаперон для возникающих полипептидных цепей, когда они покидают рибосому. Этот белок был идентифицирован как лейкемия -ассоциированный антиген и экспрессия гена повышается в лейкозных бластах. Также, хромосомные аберрации с участием этого гена связаны с первичными плоскоклеточными клетками головы и шеи. опухоли. Этот ген имеет псевдоген на хромосоме 6. Описаны альтернативно сплайсированные варианты, которые кодируют различные изоформы белка; однако не все варианты полностью охарактеризованы.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105821 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029014 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Мацумото-Таниура Н., Пиролле Ф., Монро Р., Джерас Л., Вестендорф Дж. М. (январь 1997 г.). «Идентификация новых фосфопротеинов M фазы путем клонирования экспрессии». Клетка Mol Biol. 7 (9): 1455–69. Дои:10.1091 / mbc.7.9.1455. ЧВК  275994. PMID  8885239.
6. «Ген энтреза: фактор 1, связанный с зуотином ZRF1».

дальнейшее чтение

• Resto VA, Caballero OL, Buta MR, et al. (2000). «Предполагаемая онкогенная роль MPP11 в плоскоклеточном раке головы и шеи». Рак Res. 60 (19): 5529–35. PMID  11034098.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Грейнер Дж., Рингхоффер М., Танигучи М. и др. (2003). «Характеристика нескольких лейкозно-ассоциированных антигенов, вызывающих гуморальные иммунные ответы при остром и хроническом миелоидном лейкозе». Int. J. Рак. 106 (2): 224–31. Дои:10.1002 / ijc.11200. PMID  12800198. S2CID  24284888.
• Грейнер Дж., Рингхоффер М., Танигучи М. и др. (2004). «Экспрессия мРНК лейкозно-ассоциированных антигенов у пациентов с острым миелоидным лейкозом для разработки специфических иммунотерапевтических методов». Int. J. Рак. 108 (5): 704–11. Дои:10.1002 / ijc.11623. PMID  14696097. S2CID  24565397.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Хандли HA, Уолтер W, Bairstow S, Крейг EA (2005). «Человеческий белок Mpp11 J: связанные с рибосомами молекулярные шапероны встречаются повсеместно». Наука. 308 (5724): 1032–4. Дои:10.1126 / science.1109247. PMID  15802566. S2CID  24164629.
• Отто Х., Конц С., Майер П. и др. (2005). «Шапероны MPP11 и Hsp70L1 образуют комплекс, связанный с рибосомами млекопитающих». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102 (29): 10064–9. Дои:10.1073 / pnas.0504400102. ЧВК  1177401. PMID  16002468.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.