ZNF837 - ZNF837

ZNF837 белок, который у человека кодируется геном ZNF837,[1] расположен по адресу 19q13.431 с отрицательной ориентацией нити.[2] Белок ZNF837 характеризуется как белок цинкового пальца C2H2-типа.[3]

Гомология и эволюция

Неукорененное филогенетическое дерево, основанное на выравнивании белковой последовательности гомологов ZNF837.

ZNF837 человека имеет гомологи, присутствующие у многих млекопитающих и наблюдаемые более отдаленно. Все гомологи хордовые. Все содержат домены COG5048 и Zf-C2H2_2. Области, где находятся эти области, имеют самые высокие показатели сохранения. У человека 5 двойных доменов Zf-H2C2[4] и 2 домена COG5048[5] присутствуют.

Последовательность белка среди этих гомологов быстро развивается.

Процентное сходство гомологов ZNF837 с человеческим белком показано на графике относительно даты его расхождения с Homo sapiens. Также на графике показаны цитохром С, медленно развивающийся белок, и фибриноген, быстро развивающийся белок, для определения скорости эволюции белка ZNF837.

ZNF837 имеет множество паралогов у людей, все из которых являются белками цинковых пальцев.

ZNF837 человека

У человека других псевдонимов нет, а соседние с ним гены - MIR4754, A1BG, и RPS5. МРНК ZNF837, превращенная в функциональный белок, содержит 1921 нуклеотид, из которых 222-1817 транслируются в белок, содержащий 3 экзона. Белок состоит из 531 аминокислоты.[6] массой 58078 Да с изоэлектрическая точка на 9,525.[7]

Варианты гена

Есть 2 варианта расшифровки. Вариант транскрипта 1, длина 2050 пар оснований, не кодирует из-за нонсенс-опосредованный распад мРНК.[8] Вариант транскрипта 2 превращается в функциональный белок благодаря альтернативному сайту сплайсинга[9]

Отправить перевод

Прогнозируется, что благодаря высокой консервации будет 4 сайта фосфорилирования.[10] в T386, T455, S460, Y503.[11] Внутренняя структура включает комбинацию альфа-спиралей, бета-листов и в основном случайных катушек.[12]

Структура части ZNF837, предсказанная Phyre2. Структура соответствует с достоверностью 99,9% 37% последовательности.

Выражение

ZNF837 наблюдается в поджелудочной железе, печени, матке и мышечных клетках. Во всех случаях концентрация низкая.[13] Тем не менее, экспрессия ZNF837, как видно, оказывает наибольшее влияние на нормальное и болезненное состояние. Это постоянное изменение, которое можно увидеть.

Рекомендации

  1. ^ Штраусберг, Р.Л .; Файнгольд, EA; Гроуз, LH; и другие. (Декабрь 2002 г.). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Труды Национальной академии наук. 99 (26): 16899–16903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
  2. ^ «ZNF837, белок цинкового пальца 837 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI».
  3. ^ Пилер, Т .; Беллефроид, Э. (1994). «Перспективы функции и эволюции белка цинкового пальца - обновленная информация». Отчеты по молекулярной биологии. 20 (1): 1–8. Дои:10.1007 / bf00999848. PMID  7531280.
  4. ^ Ючи, S (2001). «Три класса белков цинкового пальца C2H2». Клеточные и молекулярные науки о жизни. 58 (4): 625–635. Дои:10.1007 / pl00000885. PMID  11361095.
  5. ^ "Поиск сохраненного домена NCBI".
  6. ^ «Белок ZNF837 [Homo sapiens] - Белок - NCBI».
  7. ^ "ZNF837 (человек)".
  8. ^ Макват, Линн Э (2002). «Нонсенс-опосредованный распад мРНК». Текущая биология. 12 (6): R196 – R197. Дои:10.1016 / S0960-9822 (02) 00747-9. PMID  11909543.
  9. ^ «ZNF837 (человек)».
  10. ^ Блом, Николай; Гаммельтофт, Стин; Брунак, Сорен (1999). «Последовательность и предсказание на основе структуры сайтов фосфорилирования эукариотических белков 1». Журнал молекулярной биологии. 294 (5): 1351–1362. Дои:10.1006 / jmbi.1999.3310. PMID  10600390.
  11. ^ Го, Айлан и др. Сайты фосфорилирования серина, треонина и тирозина. Патент US20110045603 A1. 20 апреля 2010 г. Распечатать.
  12. ^ Келли, штат Луизиана; Штернберг, MJE (2009). «Прогнозирование структуры белка в Интернете: пример использования сервера Phyre». Протоколы природы. 4 (3): 363–371. Дои:10.1038 / nprot.2009.2. HDL:10044/1/18157. PMID  19247286.
  13. ^ «Профиль EST - Hs.222236».