YTHDF2 - YTHDF2

YTHDF2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4RDN, 4RDO, 4WQN
Идентификаторы
Псевдонимы	YTHDF2, HGRG8, NY-REN-2, CAHL, YTH, N6-метиладенозиновый РНК-связывающий белок 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 610640 MGI: 2444233 ГомолоГен: 32302 Генные карты: YTHDF2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п35.3 Начинать 28,736,621 бп[1] Конец 28,769,775 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 D2.3 Начинать 132,184,912 бп[2] Конец 132,212,303 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание N6-метиладенозин-содержащей РНК • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • цитозоль • П-боди • ядро клетки • цитоплазма • центр организации микротрубочек • цитоплазматическая гранула рибонуклеопротеина Биологический процесс • гуморальный иммунный ответ • положительное регулирование кэп-независимой инициации трансляции • регуляция стабильности мРНК • эмбриональный морфогенез • дестабилизация мРНК • созревание ооцитов • отрицательная регуляция сигнального пути Notch • эндотелиальный переход в гемопоэтический • регуляция дифференцировки гемопоэтических стволовых клеток • регуляция процесса мейотического клеточного цикла, участвующего в созревании ооцитов • дифференциация клеток • оогенез Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51441	213541
Ансамбль	ENSG00000198492	ENSMUSG00000040025
UniProt	Q9Y5A9	Q91YT7
RefSeq (мРНК)	NM_016258 NM_001172828 NM_001173128	NM_145393
RefSeq (белок)	NP_001166299 NP_001166599 NP_057342	NP_663368
Расположение (UCSC)	Chr 1: 28.74 - 28.77 Мб	Chr 4: 132,18 - 132,21 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

YTH N6-метиладенозиновый связывающий РНК белок 2 это белок что у человека кодируется YTHDF2 ген.^[5]

Функция

Этот ген кодирует член суперсемейства YTH (гомология YT521-B), содержащий домен YTH. Домен YTH типичен для эукариот и особенно распространен у растений. Домен YTH обычно расположен в середине белковой последовательности и может связываться с РНК. В дополнение к домену YTH, этот белок имеет богатую пролином область, которая может участвовать в передаче сигнала. В одном из интронов этого гена был идентифицирован Alu-богатый домен, который, как считается, связан с долголетием человека. Кроме того, у пациентов с острым миелоидным лейкозом наблюдались реципрокные транслокации между этим геном и геном Runx1 (AML1) на хромосоме 21. Первоначально этот ген был отображен на хромосоме 14, которая позже оказалась псевдогеном. В качестве альтернативы в этом гене были идентифицированы сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы. [предоставлено RefSeq, октябрь 2012 г.].

Смотрите также

N⁶-Метиладенозин

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198492 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040025 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: YTH N6-метиладенозиновый РНК-связывающий белок 2». Получено 2017-12-24.

дальнейшее чтение

• Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B., Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jäger D, Jäger E, Knuth A, Chen YT, Old LJ (1999). «Антигены, распознаваемые аутологичными антителами у пациентов с почечно-клеточной карциномой». Int. J. Рак. 83 (4): 456–64. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0215 ​​(19991112) 83: 4 <456 :: AID-IJC4> 3.0.CO; 2-5. PMID  10508479.
• Карделли М., Марчегиани Ф., Каваллоне Л., Оливьери Ф., Джовагнетти С., Мугианези Э., Мореси Р., Лиза Р., Франчески К. (2006). «Полиморфизм гена YTHDF2 (1p35), расположенный в Alu-богатом геномном домене, связан с долголетием человека». J. Gerontol. Биол. Sci. Med. Наука. 61 (6): 547–56. Дои:10.1093 / gerona / 61.6.547. PMID  16799135.
• Карделли М., Марчегиани Ф., Каваллоне Л., Оливьери Ф., Джовагнетти С., Мугианези Э., Мореси Р., Лиза Р., Франчески К. (2006). «Полиморфизм гена YTHDF2 (1p35), расположенный в Alu-богатом геномном домене, связан с долголетием человека». J. Gerontol. Биол. Sci. Med. Наука. 61 (6): 547–56. Дои:10.1093 / gerona / 61.6.547. PMID  16799135.
• Ван Х, Лу З., Гомес А., Хон ГК, Юэ И, Хан Д, Фу И, Паризиэн М, Дай Кью, Цзя Джи, Рен Би, Пан Т, Хе С (2014). «N6-метиладенозин-зависимая регуляция стабильности информационной РНК». Природа. 505 (7481): 117–20. Дои:10.1038 / природа12730. ЧВК  3877715. PMID  24284625.
• Ли Ф, Чжао Д., Ву Дж, Ши И (2014). «Структура домена YTH человеческого YTHDF2 в комплексе с мононуклеотидом m (6) A обнаруживает ароматическую клетку для распознавания m (6) A». Cell Res. 24 (12): 1490–2. Дои:10.1038 / кр.2014.153. ЧВК  4260351. PMID  25412658.
• Чжу Т., Раундтри И.А., Ван П, Ван Х, Ван Л., Сунь Ц., Тянь И, Ли Дж, Хе Ц, Сюй Y (2014). «Кристаллическая структура YTH-домена YTHDF2 раскрывает механизм распознавания N6-метиладенозина». Cell Res. 24 (12): 1493–6. Дои:10.1038 / кр.2014.152. ЧВК  4260350. PMID  25412661.
• Сюй Ц., Лю К., Ахмед Х, Лоппнау П., Шапира М., Мин Дж. (2015). "Структурная основа для дискриминационного распознавания N6-метиладенозиновой РНК семейством белков гомологического домена YT521-B человека". J. Biol. Chem. 290 (41): 24902–13. Дои:10.1074 / jbc.M115.680389. ЧВК  4598999. PMID  26318451.
• Тирумуру Н., Чжао Б.С., Лу В., Лу З., Хе С, Ву Л. (2016). «N (6) -метиладенозин РНК ВИЧ-1 регулирует вирусную инфекцию и экспрессию белка Gag ВИЧ-1». eLife. 5. Дои:10.7554 / eLife.15528. ЧВК  4961459. PMID  27371828.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.