WDR1 - WDR1

WDR1
Идентификаторы
Псевдонимы	WDR1, AIP1, HEL-S-52, NORI-1, домен повтора WD 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 604734 MGI: 1337100 ГомолоГен: 6628 Генные карты: WDR1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4п16.1 Начинать 10,074,339 бп[1] Конец 10,116,949 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 B3 | 5 20,63 см Начинать 38,526,813 бп[2] Конец 38,563,221 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание актина • связывание актиновой нити Сотовый компонент • внеклеточная область • миелин • подосомы • соединение клеток • проекция клетки • внеклеточная экзосома • цитоскелет • актиновая нить • межклеточное соединение • цитоплазма • цитозоль • кортикальный актиновый цитоскелет • клеточная мембрана Биологический процесс • дегрануляция тромбоцитов • чувственное восприятие звука • организация актинового цитоскелета • регуляция реполяризации клеточных мембран желудочков сердечной мышцы • регуляция дифференцировки олигодендроцитов • поддержание апикальной / базальной полярности эпителиальных клеток • сборка апикального соединения • регуляция деполимеризации актиновых филаментов • нейтрофильный иммунитет • регулировка формы клеток • фрагментация актиновых филаментов • образование тромбоцитов • положительная регуляция деполимеризации актиновых филаментов • организация коркового цитоскелета • движение • установление планарной полярности фолликулярного эпителия • саркомерная организация • миграция нейтрофилов • деполимеризация актиновых филаментов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9948	22388
Ансамбль	ENSG00000071127	ENSMUSG00000005103
UniProt	O75083	O88342
RefSeq (мРНК)	NM_005112 NM_017491	NM_011715
RefSeq (белок)	NP_005103 NP_059830	NP_035845
Расположение (UCSC)	Chr 4: 10.07 - 10.12 Мб	Chr 5: 38,53 - 38,56 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок 1, содержащий повторы WD это белок что у людей кодируется WDR1 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует белок, содержащий 9 повторов WD. Количество повторов WD составляет примерно 30-40 раз.аминокислота домены, содержащие несколько консервативных остатков, в основном включая trp-asp на C-терминал конец. Домены WD участвуют во взаимодействиях белок-белок. Закодированный белок может помочь вызвать разборку актин нити. Два варианта транскрипции, кодирующие разные изоформы были обнаружены для этого гена.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000071127 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005103 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Адлер Х.Дж., Винницки Р.С., Гонг Т.В., Ломакс Мичиган (май 1999 г.). «Ген, активированный в акустически поврежденном базилярном сосочке цыпленка, кодирует новый белок с повторами WD40». Геномика. 56 (1): 59–69. Дои:10.1006 / geno.1998.5672. PMID  10036186.
6. «Ген Entrez: домен 1 повтора WD WDR1».

дальнейшее чтение

• Доусон SJ, Белый LA (1992). «Лечение эндокардита Haemophilus aphrophilus ципрофлоксацином». J. Infect. 24 (3): 317–20. Дои:10.1016 / S0163-4453 (05) 80037-4. PMID  1602151.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Родал А.А., Тетро Дж. В., Лаппалайнен П. и др. (1999). «Aip1p взаимодействует с кофилином, разрушая актиновые нити». J. Cell Biol. 145 (6): 1251–64. Дои:10.1083 / jcb.145.6.1251. ЧВК  2133144. PMID  10366597.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Геваерт К., Гетальс М., Мартенс Л. и др. (2004). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Биотехнология. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
• Ленер Б, Сандерсон CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res. 14 (7): 1315–23. Дои:10.1101 / gr.2122004. ЧВК  442147. PMID  15231747.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Fujibuchi T, Abe Y, Takeuchi T. и др. (2005). «AIP1 / WDR1 поддерживает округление митотических клеток». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 327 (1): 268–75. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.11.156. PMID  15629458.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.