Несогласованный-119 (Unc-119) - Uncoordinated-119 (Unc-119)

UNC119
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3GQQ, 3RBQ, 4GOJ, 4ГОК
Идентификаторы
Псевдонимы	UNC119, HRG4, IMD13, POC7, POC7A, белок гомолог unc-119, шаперон связывания липидов unc-119
Внешние идентификаторы	MGI: 1328357 ГомолоГен: 3778 Генные карты: UNC119
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q11.2 Начните 28,546,708 бп[1] Конец 28,552,631 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 B5 | 11 46,74 см Начните 78,343,482 бп[2] Конец 78,349,164 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание липидов • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • центросома • полюс шпинделя • шпиндель • центр организации микротрубочек • межклеточный мостик • средняя зона шпинделя • цитоскелет Биологический процесс • эндоцитоз • ответ на стимул • положительная регуляция активности протеинтирозинкиназы • транспорт белка • визуальное восприятие • фототрансдукция • химическая синаптическая передача • дифференциация нейронов • транспорт липопротеинов • отрицательная регуляция клатрин-зависимого эндоцитоза • отрицательная регуляция кавеолин-опосредованного эндоцитоза • митотический цитокинез • развитие нервной системы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9094	22248
Ансамбль	ENSG00000109103	ENSMUSG00000002058
UniProt	Q13432	Q9Z2R6
RefSeq (мРНК)	NM_005148 NM_054035 NM_001330166	NM_011676 NM_001313985 NM_001313986 NM_001313987 NM_001313988
RefSeq (белок)	NP_001317095 NP_005139 NP_473376	NP_001300914 NP_001300915 NP_001300916 NP_001300917 NP_035806
Расположение (UCSC)	Chr 17: 28,55 - 28,55 Мб	Chr 11: 78.34 - 78.35 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Несогласованный-119 (Unc-119) белок, который был идентифицирован в C. elegans, люди, мыши, рыбки данио, кролики, свинья, теленок, обезьяна и простейшие.^[5] Они были отнесены к надсемейству дельта-фосфодиэстеразы GMP.^[6] Белки Unc-119 относятся к их собственному семейству, но, как было показано, они предков связаны с PrBP (пренил связывающий белок) и rhoGDI. Ему дано много разных названий: Retinal Protein 4, HRG4, POC7 Centriolar Protein Homolog A, IMD13, POC7A и RG4.

Структура и функции

Unc-119 в C. elegans примерно 240 аминокислот^[7] и имеет массу ~ 26 кДа.^[8] С помощью рентгеновская кристаллография протеин Кристальная структура наблюдалось и было установлено, что разрешение 1,95 Å.^[9] Имеет иммуноглобулин -любить β-бутерброд складывающаяся структура, в результате чего получается узкий гидрофобный карман.^[10] Этот карман имеет способность связываться с лауроилом (C12) и миристоил (C14) ацилтрансфераза боковые цепи в качестве переносчика или липид-связывающего шаперона.^[9] Unc-119 помогает с подвижностью ресничек. Он необходим ресничкам для поддержания формирования и функционирования. Это сохраненная ответственность животных перед простейшими.

Роль в клетках

UNC-119 участвует в синаптических функциях, преобразование сигнала, рециклинг эндосом, поглощение бактерий и эндоцитоз, торговля белком, липид-связывающий шаперон и медиатор на Киназа семейства Src сигналы.^[11][12]

Белок UNC-119 играет ключевую роль в движении и питании C. elegans, потому что это важно для развития и функционирования их нервной системы. Одна наблюдаемая мутация была в паттернах экспрессии, когда мутант сливается с lacZ.^[10] Когда этот белок мутируется или удаляется, C. elegans были обнаружены проблемы с передвижением, вплоть до полного паралича. Было также высказано предположение, что мутация может вызвать C. elegans потерять способность узнавать свою еду. Было показано, что когда организм обладает мутировавшим UNC-119, он испытывает нескоординированное движение, дефект, вызывающий слабую кладку яиц и неспособность формировать Дауэр личинки.^[12]

В Х. сапиенс, Unc-119 был идентифицирован на хромосоме 17 и обнаруживается преимущественно в сетчатке (HRG4). Он был локализован на фоторецептор синапсы в внешний плексиформный слой сетчатки и предположил, что он играет роль в механизме высвобождения фоторецепторного нейромедиатора через цикл синаптических пузырьков. Для этого гена описаны два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. Закодированный продукт имеет сильные гомология с C. elegans unc119 и он может функционально дополнять мутацию unc119 C. elegans.

Unc-119 также был обнаружен в других областях человека, таких как печень, почки, мозг и фибробласты.^[10] Было также установлено, что он играет важную роль в Рецептор Т-клеток функция^[8] и рецептор интерлейкина-5 (IL-5R) Unc-119 является важным активатором обоих Lck и Fyn взаимодействуя со своими SH2 - и SH3 -связывание доменов. Было обнаружено, что мутация гена Unc-119 серьезно нарушает путь Т-клеточного рецептора. Было высказано предположение, что причиной иммунодефицит расстройство, известное как идиопатический CD4 лимфопения (ICL) из-за снижения стимуляции Т-лимфоцитов.^[9]

Взаимодействия

Было показано, что гомолог белка unc-119 взаимодействовать с:

• ARL2^[13]
• ARL3^[14][15]
• CD247^[8]
• CD4^[8]
• FYN^[8]
• IL5RA^[16]
• LYN^[16]
• Lck^[8]
• РИБАЙ^[17]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000109103 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000002058 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Swanson DA, Chang JT, Campochiaro PA, Zack DJ, Valle D (октябрь 1998 г.). «Ортологи млекопитающих C. elegans unc-119 высоко экспрессируются в фоторецепторах». Исследовательская офтальмология и визуализация. 39 (11): 2085–94. PMID  9761287.
6. Fansa EK, Wittinghofer A (октябрь 2016 г.). «Сортировка липидированных грузов по системе Arl2 / Arl3». Малые GTPases. 7 (4): 222–230. Дои:10.1080/21541248.2016.1224454. ЧВК  5129900. PMID  27806215.
7. Мадуро М., Пилигрим Д. (ноябрь 1995 г.). «Идентификация и клонирование unc-119, гена, экспрессируемого в нервной системе Caenorhabditis elegans». Генетика. 141 (3): 977–88. ЧВК  1206859. PMID  8582641.
8. Горска М.М., Стаффорд С.Дж., Сен О, Сур С., Алам Р. (февраль 2004 г.). «Unc119, новый активатор Lck / Fyn, необходим для активации Т-клеток». Журнал экспериментальной медицины. 199 (3): 369–79. Дои:10.1084 / jem.20030589. ЧВК  2211793. PMID  14757743.
9. Константин Р., Чжан Х., Герстнер С.Д., Фредерик Дж. М., Бэр В. (декабрь 2012 г.). «Несогласованный (UNC) 119: координация движения миристоилированных белков». Исследование зрения. 75: 26–32. Дои:10.1016 / j.visres.2012.08.012. ЧВК  3514684. PMID  23000199.
10. Жан Ф, Пилигрим Д. (октябрь 2017 г.). «Координация несогласованного: торговля ресничками UNC119». Европейский журнал клеточной биологии. 96 (7): 643–652. Дои:10.1016 / j.ejcb.2017.09.001. PMID  28935136.
11. Ли Й, Чунг С., Пэк И.К., Ли Т.Х., Пайк С.И., Ли Дж. (Апрель 2013 г.). «UNC119a соединяет передачу сигналов Fyn к Rab11, что приводит к завершению цитокинеза». Клеточный цикл. 12 (8): 1303–1315. Дои:10.4161 / cc.24404. ЧВК  3674094. PMID  23535298.
12. Мадуро М.Ф., Гордон М., Джейкобс Р., Пилигрим Д.Б. (январь 2000 г.). «Семейство нейральных белков UNC-119 функционально консервативно у людей, дрозофилы и C. elegans». Журнал нейрогенетики. 13 (4): 191–212. Дои:10.3109/01677060009084494. PMID  10858820. S2CID  36103225.
13. Кобаяши А., Кубота С., Мори Н., Макларен М.Дж., Инана Г. (январь 2003 г.). «Фоторецепторный синаптический белок HRG4 (UNC119) взаимодействует с ARL2 через предполагаемый консервативный домен». Письма FEBS. 534 (1–3): 26–32. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03766-3. PMID  12527357. S2CID  22603052.
14. Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (сентябрь 2005 г.). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Ячейка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070. S2CID  8235923.
15. Ван Валкенбург Х., Шерн Дж. Ф., Акционер Дж. Д., Чжу Х, Кан Р. А. (июнь 2001 г.). «Факторы ADP-рибозилирования (ARF) и ARF-подобные 1 (ARL1) имеют как специфические, так и общие эффекторы: характерные для ARL1-связывающих белков». Журнал биологической химии. 276 (25): 22826–37. Дои:10.1074 / jbc.M102359200. PMID  11303027.
16. Цен О., Горска М.М., Стаффорд С.Дж., Сур С., Алам Р. (март 2003 г.). «Идентификация UNC119 как нового активатора тирозинкиназ SRC-типа». Журнал биологической химии. 278 (10): 8837–45. Дои:10.1074 / jbc.M208261200. PMID  12496276.
17. Альпади К., Магупалли В.Г., Каппель С., Кеблиц Л., Шварц К., Зайгель Г.М., Сунг С.Х., Шмитц Ф. (сентябрь 2008 г.). «RIBEYE привлекает Munc119, ортолога млекопитающих Caenorhabditis elegans белка unc119, на синаптические ленты синапсов фоторецепторов». Журнал биологической химии. 283 (39): 26461–7. Дои:10.1074 / jbc.M801625200. ЧВК  3258921. PMID  18664567.

дальнейшее чтение

• Цен О., Горска М.М., Стаффорд С.Дж., Сур С., Алам Р. (март 2003 г.). «Идентификация UNC119 как нового активатора тирозинкиназ SRC-типа». Журнал биологической химии. 278 (10): 8837–45. Дои:10.1074 / jbc.M208261200. PMID  12496276.
• Хигашиде Т., Инана Г. (май 1999 г.). «Характеристика гена HRG4 (UNC119), нового фоторецепторного синаптического белка, гомологичного unc-119». Геномика. 57 (3): 446–50. Дои:10.1006 / geno.1999.5791. PMID  10329014.
• Кобаяши А., Кубота С., Мори Н., Макларен М.Дж., Инана Г. (январь 2003 г.). «Фоторецепторный синаптический белок HRG4 (UNC119) взаимодействует с ARL2 через предполагаемый консервативный домен». Письма FEBS. 534 (1–3): 26–32. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03766-3. PMID  12527357. S2CID  22603052.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (сентябрь 2005 г.). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Ячейка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070. S2CID  8235923.
• Swanson DA, Chang JT, Campochiaro PA, Zack DJ, Valle D (октябрь 1998 г.). «Ортологи млекопитающих C. elegans unc-119 высоко экспрессируются в фоторецепторах». Исследовательская офтальмология и визуализация. 39 (11): 2085–94. PMID  9761287.
• Ван Валкенбург Х., Шерн Дж. Ф., Акционер Дж. Д., Чжу Х, Кан Р. А. (июнь 2001 г.). «Факторы ADP-рибозилирования (ARF) и ARF-подобные 1 (ARL1) имеют как специфические, так и общие эффекторы: характерные для ARL1-связывающих белков». Журнал биологической химии. 276 (25): 22826–37. Дои:10.1074 / jbc.M102359200. PMID  11303027.
• Вепачеду Р., Горска М.М., Сингхания Н., Косгроув Г.П., Браун К.К., Алам Р. (июль 2007 г.). «Unc119 регулирует дифференцировку миофибробластов посредством активации Fyn и пути p38 MAPK». Журнал иммунологии. 179 (1): 682–90. Дои:10.4049 / jimmunol.179.1.682. PMID  17579091.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q13432 (Белок unc-119 гомолог A) на PDBe-KB.