Мотив РНК термит-flg - Termite-flg RNA motif

Termite-flg РНК
Termite-flg-RNA.svg
Консенсусная вторичная структура Termite-flg РНК
Идентификаторы
СимволTermite-flg
Альт. Символыtg-flg
РфамRF01729
Прочие данные
РНК типСНГ-регулирующий элемент
Домен (ы)Метагеном кишечника термитов
PDB структурыPDBe

В Термитflg Мотив РНК (также называемый tg-flg) является сохраняющимся РНК структура идентифицирована биоинформатика.[1][2] Геномный последовательности, соответствующие Termite-flg РНК идентифицированы только в некультивируемых бактерии присутствует в термит задняя кишка. По состоянию на 2010 год не обнаружен в ДНК любого культивируемого вида и, таким образом, является примером РНК, присутствующие в образцах окружающей среды.

Термитflg РНК постоянно располагаются в том, что считается 5 'непереведенные регионы из гены что кодирует белки чьи функции относятся к жгутики. Предполагается, что РНК регулируют эти гены по неизвестному механизму.

Рекомендации

  1. ^ Вайнберг З., Перро Дж., Мейер М.М., Брейкер Р.Р. (декабрь 2009 г.). «Исключительные структурированные некодирующие РНК, выявленные с помощью анализа бактериального метагенома». Природа. 462 (7273): 656–659. Дои:10.1038 / природа08586. ЧВК  4140389. PMID  19956260.
  2. ^ Вайнберг З., Ван Дж. Х, Бог Дж. И др. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика обнаруживает 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Геном Биол. 11 (3): R31. Дои:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. ЧВК  2864571. PMID  20230605.

внешняя ссылка