TRAPPC4 - TRAPPC4

TRAPPC4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2J3T, 2JSN, 2ZMV
Идентификаторы
Псевдонимы	TRAPPC4, HSPC172, PTD009, SBDN, SYNBINDIN, TRS23, CGI-104, комплекс частиц транспортирующего белка 4, NEDESBA
Внешние идентификаторы	OMIM: 610971 MGI: 1926211 ГомолоГен: 105453 Генные карты: TRAPPC4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q23.3 Начинать 119,018,763 бп[1] Конец 119,025,454 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 A5.2 Начинать 44,403,698 бп[2] Конец 44,407,600 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Раб гуанил-нуклеотидный фактор обмена активность Сотовый компонент • цитозоль • аппарат Гольджи • синаптический пузырек • синапс • дендрит • эндоплазматический ретикулум • Стек Гольджи • Мембрана Гольджи • Комплекс TRAPP Биологический процесс • развитие дендритов • Покрытие везикул COPII • везикулярный транспорт • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51399	60409
Ансамбль	ENSG00000280495 ENSG00000196655	ENSMUSG00000032112
UniProt	Q9Y296	Q9ES56
RefSeq (мРНК)	NM_016146 NM_001318486 NM_001318488 NM_001318489 NM_001318490 NM_001318492 NM_001318494	NM_021789
RefSeq (белок)	NP_001305415 NP_001305417 NP_001305418 NP_001305419 NP_001305421 NP_001305423 NP_057230	NP_068561
Расположение (UCSC)	Chr 11: 119.02 - 119.03 Мб	Chr 9: 44,4 - 44,41 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица 4 комплекса белковых частиц это белок что у людей кодируется TRAPPC4 ген.^[5][6]

Рекомендации

1. ENSG00000196655 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000280495, ENSG00000196655 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032112 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лай Ч., Чжоу Ц.Й., Чан ЛЙ, Лю Ц.С., Лин В. (август 2000 г.). «Идентификация новых эволюционно консервативных генов человека у Caenorhabditis elegans с помощью сравнительной протеомики». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК  310876. PMID  10810093.
6. "Ген Entrez: TRAPPC4, транспортный комплекс белковых частиц 4".

дальнейшее чтение

• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Гэвин А.С., Бёше М., Краузе Р. и др. (2002). «Функциональная организация протеома дрожжей путем систематического анализа белковых комплексов». Природа. 415 (6868): 141–7. Дои:10.1038 / 415141a. PMID  11805826. S2CID  4425555.
• Чжан К.Х., Е М., Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гемопоэтических стволовых / клетках-предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Этель И.М., Хагихара К., Миура И. и др. (2000). «Синбиндин, новый белок, связывающий синдекан-2, в нейрональных дендритных шипах». J. Cell Biol. 151 (1): 53–68. Дои:10.1083 / jcb.151.1.53. ЧВК  2189810. PMID  11018053.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.