TRA2A - TRA2A

TRA2A
Идентификаторы
Псевдонимы	TRA2A, AWMS1, HSU53209, гомолог трансформатора 2 альфа
Внешние идентификаторы	OMIM: 602718 MGI: 1933972 ГомолоГен: 40866 Генные карты: TRA2A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7п15.3 Начинать 23,504,780 бп[1] Конец 23,532,041 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 B2.3 Начинать 49,243,924 бп[2] Конец 49,264,033 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК Сотовый компонент • ядрышко • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • ядро клетки • рибонуклеопротеин Биологический процесс • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • обработка мРНК • Сплайсинг РНК • положительное регулирование сплайсинга мРНК через сплайсосомы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	29896	101214
Ансамбль	ENSG00000164548	ENSMUSG00000029817
UniProt	Q13595	Q6PFR5
RefSeq (мРНК)	NM_001282757 NM_001282758 NM_001282759 NM_013293 NM_001362759 NM_001362760 NM_001362761	NM_198102 NM_001347209 NM_001362188
RefSeq (белок)	NP_001269686 NP_001269687 NP_001269688 NP_037425 NP_001349688 NP_001349689 NP_001349690	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 7: 23,5 - 23,53 Мб	Chr 6: 49,24 - 49,26 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Трансформатор-2 гомолог белка альфа это белок что у людей кодируется TRA2A ген.^[5][6][7]

Этот ген является членом семейства гомологов трансформера 2 и кодирует белок с двумя доменами RS и доменом RRM (мотив распознавания РНК). Этот фосфорилированный ядерный белок связывается со специфическими последовательностями РНК и играет роль в регуляция сплайсинга пре-мРНК. Описано несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов этого гена; однако полнометражный характер некоторых из этих вариантов не установлен.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164548 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029817 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Даувальдер Б., Амая-Мансанарес Ф, Маттокс В. (октябрь 1996 г.). «Человеческий гомолог трансформера-2 фактора детерминации пола дрозофилы имеет консервативные регуляторные функции сплайсинга». Proc Natl Acad Sci U S A. 93 (17): 9004–9. Дои:10.1073 / пнас.93.17.9004. ЧВК  38585. PMID  8799144.
6. Tacke R, Tohyama M, Ogawa S, Manley JL (май 1998 г.). «Белки Tra2 человека являются активаторами сплайсинга пре-мРНК». Клетка. 93 (1): 139–48. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81153-8. PMID  9546399. S2CID  15384749.
7. «Entrez Gene: TRA2A трансформатор-2 альфа».

дальнейшее чтение

• Центр Сангера, The; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета, The (1999). «К полной последовательности человеческого генома». Genome Res. 8 (11): 1097–108. Дои:10.1101 / гр. 8.11.1097. PMID  9847074.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Мацуда А, Сузуки У, Хонда Дж и др. (2003). «Крупномасштабная идентификация и характеристика человеческих генов, активирующих сигнальные пути NF-kappaB и MAPK». Онкоген. 22 (21): 3307–18. Дои:10.1038 / sj.onc.1206406. PMID  12761501.
• Шин С., Фэн Й, Мэнли Дж. Л. (2004). «Дефосфорилированный SRp38 действует как репрессор сплайсинга в ответ на тепловой шок». Природа. 427 (6974): 553–8. Дои:10.1038 / природа02288. PMID  14765198. S2CID  4423246.
• Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID  15324660. S2CID  2371325.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Геваерт К., Стаес А., Ван Дамм Дж. И др. (2006). «Глобальный анализ фосфопротеома гепатоцитов человека HepG2 с использованием обращенно-фазовой диагональной ЖК». Протеомика. 5 (14): 3589–99. Дои:10.1002 / pmic.200401217. PMID  16097034. S2CID  895879.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.