TOM1 - TOM1

TOM1
Протеин TOM1 PDB 1elk.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTOM1, мишень мембранного транспортного белка myb1
Внешние идентификаторыOMIM: 604700 MGI: 1338026 ГомолоГен: 88453 Генные карты: TOM1
Расположение гена (человек)
Хромосома 22 (человек)
Chr.Хромосома 22 (человек)[1]
Хромосома 22 (человек)
Геномное расположение TOM1
Геномное расположение TOM1
Группа22q12.3Начинать35,299,275 бп[1]
Конец35,347,992 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TOM1 202807 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001135729
NM_001135730
NM_001135732
NM_005488

NM_001136259
NM_011622

RefSeq (белок)

NP_001129201
NP_001129202
NP_001129204
NP_005479

NP_001129731
NP_035752

Расположение (UCSC)Chr 22: 35,3 - 35,35 МбChr 8: 75.03 - 75.07 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Мишень белка Myb 1 это белок что у людей кодируется TOM1 ген.[5][6][7]

Специфическая функция этого гена еще не определена, но она может включать транслокацию рецепторных комплексов фактора роста в лизосому для деградации. Этот ген локализован в 22q13.1, причем HMOX1 и MCM5 расположены дистально, а HMG2L1 - проксимально.[7]

Взаимодействия

TOM1 был показан взаимодействовать с TOLLIP[8] и ZFYVE16.[9]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100284 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042870 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Серусси Э., Кедра Д., Кост-Алимова М., Сандберг-Нордквист А.С., Франссон И., Якобс Дж.Ф., Фу Й., Pan HQ, Роу Б.А., Имре С., Думански Д.П. (август 1999 г.). «Гены TOM1 отображаются на хромосоме 22q13.1 человека и хромосоме 8C1 мыши и кодируют белки, аналогичные эндосомным белкам HGS и STAM». Геномика. 57 (3): 380–8. Дои:10.1006 / geno.1998.5739. PMID  10329004.
  6. ^ Като Й, Шиба Й, Мицухаси Х, Янагида Й, Такацу Х, Накаяма К. (май 2004 г.). «Tollip и Tom1 образуют комплекс и привлекают убиквитин-конъюгированные белки на ранние эндосомы». J Biol Chem. 279 (23): 24435–43. Дои:10.1074 / jbc.M400059200. PMID  15047686.
  7. ^ а б «Энтрез Ген: мишень TOM1 для myb1 (курица)».
  8. ^ Ямаками, Мэгуми; Йошимори Тамоцу; Йокосава Хидэёси (декабрь 2003 г.). «Tom1, белок, содержащий домен VHS, взаимодействует с толлипом, убиквитином и клатрином». J. Biol. Chem. 278 (52): 52865–72. Дои:10.1074 / jbc.M306740200. ISSN  0021-9258. PMID  14563850.
  9. ^ Сит, Ли-Фонг; Лю Ниншэн; Хэнсон Брендон Дж; Хун Ваньцзинь (февраль 2004 г.). "Endofin привлекает TOM1 к эндосомам". J. Biol. Chem. 279 (6): 4670–9. Дои:10.1074 / jbc.M311228200. ISSN  0021-9258. PMID  14613930.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка