TH1L - TH1L

NELFCD
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5L3X
Идентификаторы
Псевдонимы	NELFCD, NELF-C, NELF-D, TH1, TH1L, HSPC130, член комплекса отрицательного фактора удлинения C / D
Внешние идентификаторы	OMIM: 605297 MGI: 1926424 ГомолоГен: 9496 Генные карты: NELFCD
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q13.32 Начните 58,981,208 бп[1] Конец 58,995,133 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 H4 Начните 174,415,804 бп[2] Конец 174,427,502 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • мембрана • NELF комплекс • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция вирусной транскрипции • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция элонгации транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	51497	57314
Ансамбль	ENSG00000101158	ENSMUSG00000016253
UniProt	Q8IXH7	Q922L6
RefSeq (мРНК)	NM_016397 NM_198976	NM_020580
RefSeq (белок)	NP_945327	NP_065605
Расположение (UCSC)	Chr 20: 58.98 - 59 Мб	Chr 2: 174.42 - 174.43 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Отрицательный коэффициент удлинения C / D это белок что у людей кодируется TH1L ген.^[5][6][7]

Функция

Комплекс белков NELF взаимодействует с комплексом белков DSIF, подавляя удлинение транскрипции с помощью РНК-полимеразы II. Белок, кодируемый этим геном, является важной частью комплекса NELF. Использование альтернативного сайта инициации трансляции приводит к образованию двух изоформ с разными N-концами.^[7]

Взаимодействия

TH1L был показан взаимодействовать с участием:

• ARAF,^[8][9]
• Кофактор BRCA1,^[10][11] и
• RDBP.^[10][11]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101158 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000016253 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Bonthron DT, Hayward BE, Moran V, Strain L (август 2000 г.). «Характеристика TH1 и CTSZ, двух не импринтированных генов ниже GNAS1 в хромосоме 20q13». Генетика человека. 107 (2): 165–75. Дои:10.1007 / s004390000344. PMID  11030415. S2CID  25570066.
6. Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Геномные исследования. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
7. "Entrez Gene: TH1L TH1-подобный (Drosophila)".
8. Юрьев А., Венногле LP (февраль 2003 г.). «Новые белок-белковые взаимодействия киназы raf, обнаруженные исчерпывающим двухгибридным анализом дрожжей». Геномика. 81 (2): 112–25. Дои:10.1016 / s0888-7543 (02) 00008-3. PMID  12620389.
9. Инь XL, Чен С., Гу Дж.С. (февраль 2002 г.). «Идентификация TH1 как партнера по взаимодействию киназы A-Raf». Молекулярная и клеточная биохимия. 231 (1–2): 69–74. Дои:10.1023 / А: 1014437024129. PMID  11952167. S2CID  19362635.
10. Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3: 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
11. Нарита Т., Ямагути Ю., Яно К., Сугимото С., Чанарат С., Вада Т., Ким Д. К., Хасэгава Дж., Омори М., Инукай Н., Эндох М., Ямада Т., Ханда Х (март 2003 г.). «Фактор элонгации транскрипции человека NELF: идентификация новых субъединиц и воссоздание функционально активного комплекса». Молекулярная и клеточная биология. 23 (6): 1863–73. Дои:10.1128 / mcb.23.6.1863-1873.2003. ЧВК  149481. PMID  12612062.

дальнейшее чтение

• Стивенс М., Де Клерк Э., Бальзарини Дж. (Сентябрь 2006 г.). «Регуляция транскрипции ВИЧ-1: молекулярные мишени для химиотерапевтического вмешательства». Обзоры медицинских исследований. 26 (5): 595–625. Дои:10.1002 / med.20081. ЧВК  7168390. PMID  16838299.
• Боналду М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Ямагути Ю., Такаги Т., Вада Т., Яно К., Фуруя А., Сугимото С., Хасегава Дж., Ханда Х (апрель 1999 г.). «NELF, мультисубъединичный комплекс, содержащий RD, взаимодействует с DSIF для подавления элонгации РНК-полимеразы II». Ячейка. 97 (1): 41–51. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80713-8. PMID  10199401. S2CID  16855257.
• Ping YH, Rana TM (апрель 2001 г.). «DSIF ​​и NELF взаимодействуют с комплексом элонгации РНК-полимеразы II, а Tat ВИЧ-1 стимулирует P-TEFb-опосредованное фосфорилирование РНК-полимеразы II и DSIF во время элонгации транскрипции». Журнал биологической химии. 276 (16): 12951–8. Дои:10.1074 / jbc.M006130200. PMID  11112772.
• Инь XL, Чэнь С., Гу Джи X (февраль 2002 г.). «Идентификация TH1 как партнера по взаимодействию киназы A-Raf». Молекулярная и клеточная биохимия. 231 (1–2): 69–74. Дои:10.1023 / А: 1014437024129. PMID  11952167. S2CID  19362635.
• Нарита Т., Ямагути Ю., Яно К., Сугимото С., Чанарат С., Вада Т., Ким Д. К., Хасэгава Дж., Омори М., Инукай Н., Эндох М., Ямада Т., Ханда Х (март 2003 г.). «Фактор элонгации транскрипции человека NELF: идентификация новых субъединиц и воссоздание функционально активного комплекса». Молекулярная и клеточная биология. 23 (6): 1863–73. Дои:10.1128 / MCB.23.6.1863-1873.2003. ЧВК  149481. PMID  12612062.
• Юрьев А, Венногле LP (февраль 2003 г.). «Новые белок-белковые взаимодействия киназы raf, обнаруженные исчерпывающим двухгибридным анализом дрожжей». Геномика. 81 (2): 112–25. Дои:10.1016 / S0888-7543 (02) 00008-3. PMID  12620389.
• Лю В., Шен X, Ян Y, Инь X, Се Дж., Ян Дж., Цзян Дж., Лю В., Ван Х, Сунь М., Чжэн И, Гу Дж (март 2004 г.). «Тригидрофобин 1 - новый негативный регулятор киназы A-Raf». Журнал биологической химии. 279 (11): 10167–75. Дои:10.1074 / jbc.M307994200. PMID  14684750.
• Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Грозело С., Гамбург А., Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (июль 2004 г.). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Геномные исследования. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Ячейка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070. S2CID  8235923.
• Ян Й, Лю В., Цзоу В., Ван Х, Цзун Х, Цзян Дж, Ван Й, Гу Дж (май 2007 г.). «Убиквитин-зависимый протеолиз тригидрофобина 1 (TH1) белком, связанным с вирусом папилломы человека E6 (E6-AP)». Журнал клеточной биохимии. 101 (1): 167–80. Дои:10.1002 / jcb.21164. PMID  17131388. S2CID  23675528.