ТГМ3 - TGM3

ТГМ3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1L9M, 1L9N, 1 НУД, 1NUF, 1 НУГ
Идентификаторы
Псевдонимы	ТГМ3, TGE, трансглутаминаза 3, UHS2
Внешние идентификаторы	OMIM: 600238 MGI: 98732 ГомолоГен: 20690 Генные карты: ТГМ3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20p13 Начинать 2,296,001 бп[1] Конец 2,341,079 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 F1 Начинать 130,012,349 бп[2] Конец 130,050,399 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • связывание ионов кальция • каталитическая активность • белок-глутамин-гамма-глутамилтрансфераза активность • трансферазная активность • трансферазная активность, перенос ацильных групп Сотовый компонент • внешний компонент цитоплазматической стороны плазматической мембраны • внеклеточная экзосома • цитоплазма Биологический процесс • ороговение • тетрамеризация белков • морфогенез волосяного фолликула • организация клеточной оболочки • сшивание пептидов • процесс модификации клеточного белка • дифференцировка кератиноцитов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7053	21818
Ансамбль	ENSG00000125780	ENSMUSG00000027401
UniProt	Q08188	Q08189
RefSeq (мРНК)	NM_003245	NM_009374
RefSeq (белок)	NP_003236	NP_033400
Расположение (UCSC)	Chr 20: 2.3 - 2.34 Мб	Chr 2: 130.01 - 130.05 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Для игры в тетрис см. Тетрис: Великий Мастер.

Белок-глутамин гамма-глутамилтрансфераза E является фермент что у людей кодируется ТГМ3 ген.^[5][6][7]

Трансглутаминазы представляют собой ферменты, которые катализируют сшивание белков эпсилон-гамма-изопептидными связями глутамиллизина. Хотя первичная структура трансглутаминаз не консервативна, все они имеют одинаковую аминокислотную последовательность в своих активных сайтах, и их активность зависит от кальция. Белок, кодируемый этим геном, состоит из двух полипептидных цепей, активируемых протеолизом из одного белка-предшественника. Кодируемый белок участвует на более поздних стадиях формирования клеточной оболочки эпидермиса и волосяного фолликула.^[7]

Смотрите также

• Проксимальный промотор

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000125780 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027401 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ван М., Ким И.Г., Штайнерт П.М., МакБрайд О.В. (март 1995 г.). «Присвоение генов трансглутаминазы 2 (TGM2) и трансглутаминазы 3 (TGM3) человека хромосоме 20q11.2». Геномика. 23 (3): 721–2. Дои:10.1006 / geno.1994.1571. PMID  7851911.
6. Эшлиманн Д., Келлер М.К., Аллен-Хоффманн Б.Л., Мошер Д.Ф. (март 1998 г.). «Выделение кДНК, кодирующей новый член семейства генов трансглутаминаз, из кератиноцитов человека. Обнаружение и идентификация продуктов генов трансглутаминазы на основе полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией с вырожденными праймерами». J Biol Chem. 273 (6): 3452–60. Дои:10.1074 / jbc.273.6.3452. PMID  9452468.
7. «Ген Entrez: трансглутаминаза 3 TGM3 (полипептид E, протеин-глутамин-гамма-глутамилтрансфераза)».

дальнейшее чтение

• Ахвази Б., Бошанс К.М., Растинежад Ф. (2005). «Новое понимание структуры трансглутаминазы 3». J. Struct. Биол. 147 (2): 200–7. Дои:10.1016 / j.jsb.2004.03.009. PMID  15193648.
• Райс Р.Х., Грин Х. (1978). «Связь синтеза белка и активности трансглутаминазы с образованием поперечно-сшитой оболочки во время терминальной дифференцировки культивируемых эпидермальных кератиноцитов человека». J. Cell Biol. 76 (3): 705–11. Дои:10.1083 / jcb.76.3.705. ЧВК  2110014. PMID  24643.
• Стек Т.Л. (1972). «Сшивание основных белков изолированной мембраны эритроцита». J. Mol. Биол. 66 (2): 295–305. Дои:10.1016/0022-2836(72)90481-0. PMID  5038456.
• Мариниелло Л., Эспозито С., Ди Пьерро П. и др. (1993). «Трансмембранный гликопротеин gp41 вируса иммунодефицита человека является аминоакцептором и донорным субстратом для трансглутаминазы in vitro». Евро. J. Biochem. 215 (1): 99–104. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1993.tb18011.x. PMID  7688299.
• Амендола А., Ломбарди Г., Оливерио С. и др. (1994). «ВИЧ-1 gp120-зависимая индукция апоптоза в антиген-специфичных клонах Т-клеток человека характеризуется экспрессией« тканевой »трансглутаминазы и предотвращается циклоспорином А». FEBS Lett. 339 (3): 258–64. Дои:10.1016/0014-5793(94)80427-3. PMID  7906657. S2CID  39872629.
• Ким И.Г., Ли С.К., Ли Дж. Х. и др. (1994). «Структура и организация гена трансглутаминазы 3 человека: эволюционная связь с семейством трансглутаминаз». J. Invest. Дерматол. 103 (2): 137–42. Дои:10.1111 / 1523-1747.ep12392470. PMID  7913719.
• Ким И.Г., Горман Дж.Дж., Парк С.К. и др. (1993). «Выведенная последовательность новой протрансглутаминазы E (TGase3) человека и мыши». J. Biol. Chem. 268 (17): 12682–90. PMID  8099584.
• Ли Дж. Х., Джанг С. И., Ян Дж. М. и др. (1996). «Проксимальный промотор гена трансглутаминазы 3 человека. Экспрессия, специфичная для многослойного плоского эпителия в культивируемых клетках, опосредуется связыванием факторов транскрипции Sp1 и ets с проксимальным элементом промотора». J. Biol. Chem. 271 (8): 4561–8. Дои:10.1074 / jbc.271.8.4561. PMID  8626812.
• Хиллер Л.Д., Леннон Г., Беккер М. и др. (1997). «Создание и анализ 280 000 тегов последовательности, экспрессируемых человеком». Genome Res. 6 (9): 807–28. Дои:10.1101 / гр.6.9.807. PMID  8889549.
• Ким С.И., Грант П., Ли Дж. Х. и др. (1999). «Дифференциальная экспрессия нескольких трансглутаминаз в головном мозге человека. Повышенная экспрессия и перекрестное связывание трансглютаминазами 1 и 2 при болезни Альцгеймера». J. Biol. Chem. 274 (43): 30715–21. Дои:10.1074 / jbc.274.43.30715. PMID  10521460.
• Мехул Б., Бернар Д., Симонетти Л. и др. (2000). «Идентификация и клонирование нового кальмодулиноподобного белка из эпидермиса человека». J. Biol. Chem. 275 (17): 12841–7. Дои:10.1074 / jbc.275.17.12841. PMID  10777582.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Сарди М., Карпати С., Меркл Б. и др. (2002). «Эпидермальная трансглутаминаза (TGase 3) является аутоантигеном герпетиформного дерматита». J. Exp. Med. 195 (6): 747–57. Дои:10.1084 / jem.20011299. ЧВК  2193738. PMID  11901200.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ахвази Б., Бошанс К.М., Идлер В. и др. (2003). «Роль ионов кальция в активации и активности фермента трансглутаминазы 3». J. Biol. Chem. 278 (26): 23834–41. Дои:10.1074 / jbc.M301162200. PMID  12679341.
• Хитоми К., Пресланд РБ, Накаяма Т. и др. (2004). «Анализ трансглутаминазы эпидермального типа (трансглутаминазы 3) в стратифицированном эпителии человека и культивируемых кератиноцитах с использованием моноклональных антител». J. Dermatol. Наука. 32 (2): 95–103. Дои:10.1016 / S0923-1811 (03) 00091-4. PMID  12850301.
• Gonzalez HE, Gujrati M, Frederick M, et al. (2003). «Идентификация 9 генов, дифференциально экспрессируемых в плоскоклеточной карциноме головы и шеи». Arch. Отоларингол. Хирургия головы и шеи. 129 (7): 754–9. Дои:10.1001 / archotol.129.7.754. PMID  12874078.
• Ахвази Б., Бошанс К.М., Идлер В. и др. (2004). «Структурная основа координированной регуляции трансглутаминазы 3 с помощью гуаниновых нуклеотидов и кальция / магния». J. Biol. Chem. 279 (8): 7180–92. Дои:10.1074 / jbc.M312310200. PMID  14645372.