TFIP11 - TFIP11

TFIP11
Идентификаторы
Псевдонимы	TFIP11, NTR1, Spp382, TIP39, bK445C9.6, hNtr1, белок, взаимодействующий с туфтелином 11, STIP, STIP-1
Внешние идентификаторы	OMIM: 612747 MGI: 1930075 ГомолоГен: 40813 Генные карты: TFIP11
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q12.1 Начните 26,491,225 бп[1] Конец 26,512,505 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 F Начните 112,326,358 бп[2] Конец 112,338,073 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты Сотовый компонент • цитоплазма • ядерное пятнышко • каталитическая стадия 2 сплайсосомы • Сплайсосомный комплекс пост-мРНК высвобождения U2-типа • ядрышко • сплайсосомальный комплекс • ядерная хромосома, теломерная область • ядро клетки • нуклеоплазма • внеклеточный матрикс Биологический процесс • Обработка РНК • защита от негомологичного сращивания концов на теломерах • отрицательная регуляция сборки белкового комплекса • развитие биоминеральной ткани • обработка мРНК • разборка сплайсосомального комплекса • отрицательная регуляция связывания белков • отрицательное регулирование репарации двухцепочечных разрывов за счет негомологичного соединения концов • Сплайсинг РНК • отрицательная регуляция активности ДНК-лигазы • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	24144	54723
Ансамбль	ENSG00000100109	ENSMUSG00000029345
UniProt	Q9UBB9	Q9ERA6
RefSeq (мРНК)	NM_001008697 NM_001346857 NM_001346858 NM_001346859 NM_001346861 NM_001346862 NM_012143	NM_018783
RefSeq (белок)	NP_001008697 NP_001333786 NP_001333787 NP_001333788 NP_001333790 NP_001333791 NP_036275	NP_061253
Расположение (UCSC)	Chr 22: 26.49 - 26.51 Мб	Chr 5: 112.33 - 112.34 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, взаимодействующий с туфтелином 11 это белок что у людей кодируется TFIP11 ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

TFIP11 был показан взаимодействовать с Туфтелин.^[5]{

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100109 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029345 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Пейн CT, Пейн ML, Луо В., Okamoto CT, Lyngstadaas SP, Snead ML (август 2000 г.). «Белок, взаимодействующий с туфтелином (TIP39), находится на апикальном секреторном полюсе амелобластов мыши». J Biol Chem. 275 (29): 22284–92. Дои:10.1074 / jbc.M000118200. PMID  10806191.
6. Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Bocher M, Blocker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Dusterhoft A, Beyer A, Kohrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwalder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
7. "Ген Entrez: TFIP11, взаимодействующий с туфтелином белок 11".

дальнейшее чтение

• Данэм И., Шимицу Н., Роу Б.А. и др. (1999). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Дои:10.1038/990031. PMID  10591208.
• Чжан К.Х., Е М., Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Юрица М.С., Ликлидер Л.Дж., Гиги С.Р. и др. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, пригодных для трехмерного структурного анализа». РНК. 8 (4): 426–39. Дои:10.1017 / S1355838202021088. ЧВК  1370266. PMID  11991638.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Коллинз Дж. Э., Говард М. Е., Коул К. Г. и др. (2003). «Переоценка аннотации человеческого гена: анализ второго поколения хромосомы 22». Genome Res. 13 (1): 27–36. Дои:10.1101 / гр.695703. ЧВК  430954. PMID  12529303.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Вэнь X, Лей Ю.П., Чжоу Ю.Л. и др. (2005). «Структурная организация и клеточная локализация белка, взаимодействующего с туфтелином 11 (TFIP11)». Cell. Мол. Life Sci. 62 (9): 1038–46. Дои:10.1007 / s00018-005-4547-z. PMID  15868102.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983.