TCEA1 - TCEA1

TCEA1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1TFI, 3NDQ, 5IY7, 5IYA, 5IY6, 5IYB, 5IY8, 5IYC
Идентификаторы
Псевдонимы	TCEA1, GTF2S, SII, TCEA, TF2S, TFIIS, фактор элонгации транскрипции A1
Внешние идентификаторы	OMIM: 601425 MGI: 1196624 ГомолоГен: 55984 Генные карты: TCEA1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q11.23 Начинать 53,966,552 бп[1] Конец 54,022,456 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 A1 Начинать 4,857,814 бп[2] Конец 4,897,909 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание ионов цинка • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • связывание нуклеиновой кислоты Сотовый компонент • ядрышко • ядро клетки • нуклеоплазма • комплекс фактора транскрипции TFIID Биологический процесс • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипционно-связанная эксцизионная репарация нуклеотидов • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция активности экзорибонуклеазы • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6917	21399
Ансамбль	ENSG00000187735	ENSMUSG00000033813
UniProt	P23193	P10711
RefSeq (мРНК)	NM_006756 NM_201437	NM_001159750 NM_001159751 NM_011541
RefSeq (белок)	NP_006747 NP_958845	NP_001153222 NP_001153223 NP_035671
Расположение (UCSC)	Chr 8: 53.97 - 54.02 Мб	Chr 1: 4.86 - 4.9 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор элонгации транскрипции А белок 1 это белок что у людей кодируется TCEA1 ген.^[5][6][7]

У других организмов этот ген более известен как фактор элонгации транскрипции II S (TFIIS). Это в основном помогает разрешить обратные комплексы удлинения, вызывая разрез в активном сайте RNAP, так что реакция снова становится возможной. Он также содержится в эукариотических комплекс преинициации транскрипции.^[8] Гомолог у архей выполняет ту же основную задачу, в то время как бактерии используют негомологичный Gre.^[9]

Взаимодействия

TCEA1 был показан взаимодействовать с GTF2H1^[10][11] и POLR2A.^[10][11][12]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000187735 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033813 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. ДиМарко С.П., Гловер Т.В., Миллер Д.Е., Рейнес Д., Уоррен С.Т. (август 1996 г.). «Фактор элонгации транскрипции SII (TCEA) отображается на хромосоме 3p22 -> p21.3 человека». Геномика. 36 (1): 185–8. Дои:10.1006 / geno.1996.0443. PMID  8812434.
6. Пак Х, Пэк К., Чон С., Агарвал К., Ю О (февраль 1994 г.). «Характеристика гена, кодирующего фактор удлинения транскрипции человека TFIIS». Ген. 139 (2): 263–7. Дои:10.1016/0378-1119(94)90767-6. PMID  8112616.
7. «Ген Entrez: фактор элонгации транскрипции TCEA1 A (SII), 1».
8. Ким Б., Несвижский А.И., Рани П.Г., Хан С., Эберсолд Р., Раниш Дж. А. (октябрь 2007 г.). «Фактор элонгации транскрипции TFIIS является компонентом преинициативных комплексов РНК-полимеразы II». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 104 (41): 16068–73. Дои:10.1073 / pnas.0704573104. ЧВК  2042163. PMID  17913884.
9. Робинсон, Николас П .; Фуко, Томас; Бломбах, Фабиан; Cackett, Гвенни; Карти, Алиса Э .; Matelska, Dorota M .; Офер, Сапир; Пилотто, Симона; Фунг, Дуй Ханх; Вернер, Финн (14 декабря 2018 г.). «Передний край архейной транскрипции». Новые темы наук о жизни. 2 (4): 517–533. Дои:10.1042 / ETLS20180014.
10. Аршамбо Дж., Пан Дж., Дахмус Г.К., Картье М., Маршалл Н., Чжан С. и др. (Октябрь 1998 г.). «FCP1, RAP74-взаимодействующая субъединица протеинфосфатазы человека, которая дефосфорилирует карбоксиконцевой домен РНК-полимеразы IIO». Журнал биологической химии. 273 (42): 27593–601. Дои:10.1074 / jbc.273.42.27593. PMID  9765293.
11. Пан Дж., Асо Т., Гринблатт Дж. (Сентябрь 1997 г.). «Взаимодействие факторов элонгации TFIIS и элонгина А с холоферментом РНК-полимеразы II человека, способным к промотор-специфической инициации и реагирующим на активаторы транскрипции». Журнал биологической химии. 272 (39): 24563–71. Дои:10.1074 / jbc.272.39.24563. PMID  9305922.
12. Кеттенбергер Х, Армаш К.Дж., Крамер П. (август 2003 г.). «Архитектура комплекса РНК-полимераза II-TFIIS и последствия для расщепления мРНК». Клетка. 114 (3): 347–57. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00598-1. HDL:11858 / 00-001M-0000-0015-8647-8. PMID  12914699. S2CID  17184533.

дальнейшее чтение

• Чен ХК, Англия Л., Кейн С.М. (июль 1992 г.). «Характеристика клона кДНК HeLa, кодирующего человеческий белок SII, фактор элонгации для РНК-полимеразы II». Ген. 116 (2): 253–8. Дои:10.1016 / 0378-1119 (92) 90522-Q. PMID  1378807.
• Като Х., Сумимото Х., Погнонек П., Чен Ч., Розен К. А., Рёдер Р. Г. (апрель 1992 г.). «ВИЧ-1 Tat действует как фактор процессивности in vitro в сочетании с факторами клеточного удлинения». Гены и развитие. 6 (4): 655–66. Дои:10.1101 / gad.6.4.655. PMID  1559613.
• Ю О.Дж., Юн Х.С., Пэк К.Х., Чон СиДжей, Миямото К., Уэно А., Агарвал К. (март 1991 г.). «Клонирование, экспрессия и характеристика фактора элонгации транскрипции человека, TFIIS». Исследования нуклеиновых кислот. 19 (5): 1073–9. Дои:10.1093 / nar / 19.5.1073. ЧВК  333783. PMID  1708494.
• Рейнес Д., Чемберлин М.Дж., Кейн С.М. (июнь 1989 г.). «Фактор элонгации транскрипции SII (TFIIS) позволяет РНК-полимеразе II удлиняться посредством блокирования транскрипции в гене человека in vitro». Журнал биологической химии. 264 (18): 10799–809. PMID  2471707.
• Цянь X, Чон С., Юн Х, Агарвал К., Вайс М.А. (сентябрь 1993 г.). «Структура нового мотива, связывающего нуклеиновую кислоту в эукариотическом факторе элонгации транскрипции TFIIS». Природа. 365 (6443): 277–9. Дои:10.1038 / 365277a0. PMID  7626141. S2CID  4367997.
• Yeh CH, Shatkin AJ (июнь 1994 г.). «Кодируемый клетками HeLa p21 гомологичен фактору элонгации транскрипции SII». Ген. 143 (2): 285–7. Дои:10.1016/0378-1119(94)90112-0. PMID  8206389.
• Умехара Т., Кида С., Ямамото Т., Хорикоши М. (декабрь 1995 г.). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей новый тип фактора элонгации транскрипции S-II». Ген. 167 (1–2): 297–302. Дои:10.1016/0378-1119(95)00634-6. PMID  8566795.
• Пауэлл В., Бартоломью Б., Рейнес Д. (сентябрь 1996 г.). «Фактор элонгации SII контактирует с 3'-концом РНК в комплексе элонгации РНК-полимеразы II». Журнал биологической химии. 271 (37): 22301–4. Дои:10.1074 / jbc.271.37.22301. ЧВК  3371613. PMID  8798387.
• Пан Дж., Асо Т., Гринблатт Дж. (Сентябрь 1997 г.). «Взаимодействие факторов элонгации TFIIS и элонгина А с холоферментом РНК-полимеразы II человека, способным к промотор-специфической инициации и реагирующим на активаторы транскрипции». Журнал биологической химии. 272 (39): 24563–71. Дои:10.1074 / jbc.272.39.24563. PMID  9305922.
• Ли XY, Грин М.Р. (октябрь 1998 г.). «Клеточный коактиватор Tat ВИЧ-1 Tat-SF1 представляет собой общий фактор элонгации транскрипции». Гены и развитие. 12 (19): 2992–6. Дои:10.1101 / gad.12.19.2992. ЧВК  317190. PMID  9765201.
• Аршамбо Дж., Пан Дж., Дахмус Г.К., Картье М., Маршалл Н., Чжан С. и др. (Октябрь 1998 г.). «FCP1, RAP74-взаимодействующая субъединица протеинфосфатазы человека, которая дефосфорилирует карбоксиконцевой домен РНК-полимеразы IIO». Журнал биологической химии. 273 (42): 27593–601. Дои:10.1074 / jbc.273.42.27593. PMID  9765293.
• Судзуки Х., Фукуниси Ю., Кагава И., Сайто Р., Ода Х, Эндо Т. и др. (Октябрь 2001 г.). «Панель белок-белкового взаимодействия с использованием полноразмерных кДНК мыши». Геномные исследования. 11 (10): 1758–65. Дои:10.1101 / гр.180101. ЧВК  311163. PMID  11591653.
• Сасо К., Ито Т., Натори С., Сэкимидзу К. (апрель 2003 г.). «Идентификация нового тканеспецифического активатора транскрипции FESTA как белка, который взаимодействует с фактором элонгации транскрипции S-II». Журнал биохимии. 133 (4): 493–500. Дои:10.1093 / jb / mvg065. PMID  12761297.
• Имабаяси Х., Мори Т., Годзё С., Киёно Т., Сугияма Т., Ирие Р. и др. (Август 2003 г.). «Повторная дифференцировка дедифференцированных хондроцитов и хондрогенез стромальных клеток костного мозга человека посредством образования хондросфер с профилированием экспрессии с помощью крупномасштабного анализа кДНК». Экспериментальные исследования клеток. 288 (1): 35–50. Дои:10.1016 / S0014-4827 (03) 00130-7. PMID  12878157.
• Кеттенбергер Х, Армаш К.Дж., Крамер П. (август 2003 г.). «Архитектура комплекса РНК-полимераза II-TFIIS и последствия для расщепления мРНК». Клетка. 114 (3): 347–57. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00598-1. HDL:11858 / 00-001M-0000-0015-8647-8. PMID  12914699. S2CID  17184533.
• Тамура К., Мията К., Сугахара К., Ониши С., Шуин Т., Асо Т. (сентябрь 2003 г.). «Идентификация EloA-BP1, нового связывающего элонгина А белка с доменом гомологии экзонуклеазы». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 309 (1): 189–95. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 01556-0. PMID  12943681.
• Чжан Ц., Ян Х, Бертон Ц.Ф. (декабрь 2003 г.). «Комбинаторный контроль паузы в человеческой РНК-полимеразе II (РНКП II) и расщепления транскрипта фактором транскрипции IIF, дельта-антигеном гепатита и стимулирующим фактором II». Журнал биологической химии. 278 (50): 50101–11. Дои:10.1074 / jbc.M307590200. PMID  14506279.