TAF5L - TAF5L

TAF5L
Идентификаторы
Псевдонимы	TAF5L, PAF65B, фактор 5, связанный с ТАТА-бокс-связывающим белком, например
Внешние идентификаторы	MGI: 1919039 ГомолоГен: 8676 Генные карты: TAF5L
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q42.13 Начните 229,593,111 бп[1] Конец 229,626,047 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 E2 Начните 123,996,318 бп[2] Конец 124,021,397 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • активность гистонацетилтрансферазы Сотовый компонент • ядерное пятнышко • ядро клетки • цитоплазматическая гранула рибонуклеопротеина • СТАГА комплекс • комплекс фактора транскрипции TFTC Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • ацетилирование гистона H3 • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, основанной на нуклеиновых кислотах Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	27097	102162
Ансамбль	ENSG00000135801	ENSMUSG00000038697
UniProt	O75529	Q91WQ5
RefSeq (мРНК)	NM_001025247 NM_014409	NM_133966 NM_001357315
RefSeq (белок)	NP_001020418 NP_055224	NP_598727 NP_001344244
Расположение (UCSC)	Chr 1: 229.59 - 229.63 Мб	Chr 8: 124 - 124,02 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

TAF5-подобная РНК-полимераза II p300 / CBP-ассоциированный фактор 65 кДа субъединица 5L является фермент что у людей кодируется TAF5L ген.^[5][6][7]

Функция

Продукт этого гена принадлежит к семейству белков TAF5 с WD-повторами. Этот ген кодирует белок, который является компонентом гистонацетилазного комплекса PCAF. Комплекс гистонацетилазы PCAF, состоящий из более чем 20 полипептидов, некоторые из которых являются TAF, необходим для миогенной транскрипции и дифференцировки. TAF могут участвовать в базовой транскрипции, служить коактиваторами, участвовать в распознавании промотора или изменять общие факторы транскрипции для облегчения сборки комплекса и инициации транскрипции. Кодируемый белок структурно подобен одному из гистоноподобных TAF, TAF5. Альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы, были идентифицированы для этого гена.^[7]

Взаимодействия

TAF5L показал себя взаимодействовать с TAF9^[8] и Гомолог белка инициации транскрипции SPT3.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000135801 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038697 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Огрызко В.В., Котани Т., Чжан Х, Шильц Р.Л., Ховард Т., Ян XJ, Ховард Б.Х., Цинь Дж., Накатани Ю. (август 1998 г.). «Гистоноподобные TAF в гистонацетилазном комплексе PCAF». Клетка. 94 (1): 35–44. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81219-2. PMID  9674425.
6. Stanchi F, Bertocco E, Toppo S, Dioguardi R, Simionati B, Cannata N, Zimbello R, Lanfranchi G, Valle G (январь 2001 г.). «Характеристика 16 новых генов человека, показывающих высокое сходство с последовательностями дрожжей». Дрожжи. 18 (1): 69–80. Дои:10.1002 / 1097-0061 (200101) 18: 1 <69 :: AID-YEA647> 3.0.CO; 2-H. PMID  11124703.
7. «Ген Entrez: TAF5L TAF5-подобная РНК-полимераза II, фактор, связанный с p300 / CBP-ассоциированным фактором (PCAF), 65 кДа».
8. Мартинес Э., Палхан В.Б., Тьернберг А., Лимар Э.С., Гампер А.М., Кунду Т.К., Чайт Б.Т., Рёдер Р.Г. (октябрь 2001 г.). «Комплекс STAGA человека представляет собой коактиватор транскрипции, ацетилирующий хроматин, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и факторами связывания повреждений ДНК in vivo». Мол. Клетка. Биол. 21 (20): 6782–95. Дои:10.1128 / MCB.21.20.6782-6795.2001. ЧВК  99856. PMID  11564863.

дальнейшее чтение

• Struhl K, Moqtaderi Z (1998). «TAF в шляпе». Клетка. 94 (1): 1–4. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81213-1. PMID  9674419.
• Бренд М, Ямамото К., Стауб А, Тора Л. (1999). «Идентификация субъединиц комплекса, не содержащего TATA-связывающего белка, содержащего TAFII, предполагает их роль в ацетилировании нуклеосом и передаче сигнала». J. Biol. Chem. 274 (26): 18285–9. Дои:10.1074 / jbc.274.26.18285. PMID  10373431.
• Бренд М., Моггс Дж. Г., Улад-Абдельгани М., Лежен Ф., Дилворт Ф. Дж., Стивенин Дж., Альмоузни Дж., Тора Л. (2001). «Поврежденный УФ излучением ДНК-связывающий белок в комплексе TFTC связывает распознавание повреждений ДНК с ацетилированием нуклеосом». EMBO J. 20 (12): 3187–96. Дои:10.1093 / emboj / 20.12.3187. ЧВК  150203. PMID  11406595.
• Мартинес Э., Палхан В.Б., Тьернберг А., Лимар Э.С., Гампер А.М., Кунду Т.К., Чайт Б.Т., Рёдер Р.Г. (2001). «Комплекс STAGA человека представляет собой коактиватор транскрипции, ацетилирующий хроматин, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и факторами связывания повреждений ДНК in vivo». Мол. Клетка. Биол. 21 (20): 6782–95. Дои:10.1128 / MCB.21.20.6782-6795.2001. ЧВК  99856. PMID  11564863.
• Cavusoglu N, Brand M, Tora L, Van Dorsselaer A (2003). «Новые субъединицы TATA-связывающего белка, не содержащего TAFII-содержащего транскрипционного комплекса, идентифицированного с помощью матричной лазерной десорбции / ионизации-времяпролетной масс-спектрометрии после одномерного гель-электрофореза». Протеомика. 3 (2): 217–23. Дои:10.1002 / pmic.200390030. PMID  12601814.
• Чжан К., Файола Ф, Мартинес Э. (2005). «Шесть остатков лизина на c-Myc являются прямыми субстратами для ацетилирования с помощью p300». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 336 (1): 274–80. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.08.075. PMID  16126174.
• Чистяков Д.А., Чернышева А., Савостьанов К.В., Туракулов Р.И., Кураева Т.Л., Дедов И.И., Носиков В.В. (2005). «Ген TAF5L на хромосоме 1q42 связан с диабетом 1 типа у российских больных». Аутоиммунитет. 38 (4): 283–93. Дои:10.1080/08916930500128594. PMID  16206511.
• Кунингер Д., Райт А., Ротвейн П. (2006). «Выживание мышечных клеток, опосредованное коактиваторами транскрипции p300 и PCAF, предъявляет различные требования к активности ацетилтрансферазы». Являюсь. J. Physiol., Cell Physiol.. 291 (4): C699-709. Дои:10.1152 / ajpcell.00056.2006. PMID  16672693.
• Окумура К., Мендоза М., Бачу Р.М., ДеПиньо Р.А., Кавени В.К., Фурнари Ф.Б. (2006). «PCAF модулирует активность PTEN». J. Biol. Chem. 281 (36): 26562–8. Дои:10.1074 / jbc.M605391200. PMID  16829519.
• Ravnskjaer K, Kester H, Liu Y, Zhang X, Lee D, Yates JR, Montminy M (2007). «Кооперативные взаимодействия между CBP и TORC2 придают селективность экспрессии целевого гена CREB». EMBO J. 26 (12): 2880–9. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601715. ЧВК  1894761. PMID  17476304.