TAF1A - TAF1A

TAF1A
Идентификаторы
Псевдонимы	TAF1A, MGC: 17061, RAFI48, SL1, TAFI48, фактор, связанный с ТАТА-бокс-связывающим белком, субъединица А РНК-полимеразы I.
Внешние идентификаторы	OMIM: 604903 MGI: 109578 ГомолоГен: 4155 Генные карты: TAF1A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q41 Начинать 222,557,902 бп[1] Конец 222,589,933 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоскелет микротрубочек • Комплекс факторов транскрипции РНК-полимеразы I • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы I • транскрипция с промотора РНК-полимеразы I • прекращение транскрипции РНК-полимеразы I • положительная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы I Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9015	21339
Ансамбль	ENSG00000143498	ENSMUSG00000072258
UniProt	Q15573 Q5JRA7	P97357
RefSeq (мРНК)	NM_001201536 NM_005681 NM_139352	NM_001277957 NM_001277958 NM_001277959 NM_021466
RefSeq (белок)	NP_001188465 NP_005672 NP_647603	NP_001264886 NP_001264887 NP_001264888 NP_067441
Расположение (UCSC)	Chr 1: 222,56 - 222,59 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ТАТА-бокс-связывающий белок-ассоциированный фактор РНК-полимераза I субъединица А является фермент что у людей кодируется TAF1A ген.^[4][5]

Функция

Инициация транскрипции РНК-полимеразой I требует образования комплекса, состоящего из ТАТА-связывающего белка (ТВР) и трех ТВР-ассоциированных факторов (TAF), специфичных для РНК-полимеразы I. Этот комплекс, известный как селективный фактор 1 (SL1), связывается с коровым промотором генов рибосомной РНК для правильного позиционирования полимеразы и действует как канал для регуляторных сигналов. Этот ген кодирует наименьший SL1-специфический TAF. Идентифицированы два транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[5]

Взаимодействия

TAF1A показал себя взаимодействовать с Кислый богатый лейцином ядерный фосфопротеин 32 член семейства A^[6] и Белковый НАБОР.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000143498 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Comai L, Zomerdijk JC, Beckmann H, Zhou S, Admon A, Tjian R (декабрь 1994 г.). «Восстановление транскрипционного фактора SL1: исключительное связывание TBP субъединицами SL1 или TFIID». Наука. 266 (5193): 1966–72. Дои:10.1126 / science.7801123. PMID  7801123.
5. «Ген Entrez: фактор, ассоциированный с TAF1A с ТАТА-бокс-связывающим белком (ТВР), РНК-полимераза I, A, 48 кДа».
6. Со С.Б., Макнамара П., Хео С., Тернер А., Лейн В.С., Чакраварти Д. (январь 2001 г.). «Регулирование ацетилирования и транскрипции гистонов с помощью INHAT, человеческого клеточного комплекса, содержащего набор онкопротеинов». Клетка. 104 (1): 119–30. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00196-9. PMID  11163245.

дальнейшее чтение

• Рудлофф У., Эберхард Д., Тора Л., Штунненберг Х., Груммт I (1994). «TBP-ассоциированные факторы взаимодействуют с ДНК и регулируют видоспецифичность транскрипции РНК-полимеразы I.». EMBO J. 13 (11): 2611–6. ЧВК  395135. PMID  8013460.
• Ди Пьетро С., Раписарда А., Амико В., Бонайуто К., Виола А., Скалия М., Мотта С., Амато А., Энгель Н., Мессина А., Сичел Г., Гжешик К., Пуррелло М. (2000). «Геномная локализация человеческих генов TAF1A, TAF1B и TAF1C, кодирующих субъединицы TAF (I) 48, TAF (I) 63 и TAF (I) 110 общего фактора инициации транскрипции SL1 класса I.». Cytogenet. Cell Genet. 89 (1–2): 133–6. Дои:10.1159/000015592. PMID  10894955.
• Чжай В., Комай Л. (2000). «Репрессия транскрипции РНК-полимеразы I опухолевым супрессором p53». Мол. Клетка. Биол. 20 (16): 5930–8. Дои:10.1128 / MCB.20.16.5930-5938.2000. ЧВК  86070. PMID  10913176.
• Seo SB, McNamara P, Heo S, Turner A, Lane WS, Chakravarti D (2001). «Регулирование ацетилирования и транскрипции гистонов с помощью INHAT, человеческого клеточного комплекса, содержащего набор онкопротеинов». Клетка. 104 (1): 119–30. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00196-9. PMID  11163245.
• Миллер Г., Панов К.И., Фридрих Дж. К., Тринкл-Малкахи Л., Ламонд А. И., Зомердейк Дж. К. (2001). «hRRN3 играет важную роль в SL1-опосредованном привлечении РНК-полимеразы I к промоторам гена рРНК». EMBO J. 20 (6): 1373–82. Дои:10.1093 / emboj / 20.6.1373. ЧВК  145519. PMID  11250903.
• Дайнс Дж. Л., Сюй С., Ботнер С., Лахти Дж. М., Хори Р. Т. (2004). «Карбоксильный конец направляет TAF (I) 48 к ядру и ядрышку и связывается с множественными ядерными рецепторами импорта». J. Biochem. 135 (3): 429–38. Дои:10.1093 / jb / mvh051. PMID  15113842.
• Ямамото К., Ямамото М., Ханада К., Ноги Ю., Мацуяма Т., Мурамацу М. (2004). «Множественные белок-белковые взаимодействия фактора PAF49, связанного с РНК-полимеразой I, и роль PAF49 в транскрипции рРНК». Мол. Клетка. Биол. 24 (14): 6338–49. Дои:10.1128 / MCB.24.14.6338-6349.2004. ЧВК  434256. PMID  15226435.
• Грандори С., Гомес-Роман Н., Фелтон-Эдкинс З.А., Нгоуэне С., Галлоуэй Д.А., Эйзенман Р.Н., Белый Р.Дж. (2005). «c-Myc связывается с рибосомной ДНК человека и стимулирует транскрипцию генов рРНК с помощью РНК-полимеразы I». Nat. Cell Biol. 7 (3): 311–8. Дои:10.1038 / ncb1224. PMID  15723054.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.