Звездная активность - Star activity

Звездная активность ослабление или изменение специфичности рестрикционный фермент опосредованное расщепление ДНК это может происходить в условиях реакции, которые значительно отличаются от оптимальных для фермента. В результате обычно происходит расщеплениеканонический распознавание сайтов, а иногда и полная потеря специфичности.

Различия, которые могут привести к звездочке, включают низкую ионная сила, высоко pH, и высокий (> 5% об.) глицерин концентрации.^[1] Последнее условие представляет особый практический интерес, поскольку коммерческие рестрикционные ферменты обычно поставляются в буфер содержат значительное количество глицерина (обычно 50% об. / об.), что означает, что недостаточное разбавление раствора фермента может вызвать звездообразную активность; эта проблема чаще всего возникает при двойном или множественном переваривании. Звездная активность может происходить из-за присутствия Mg²⁺, как видно на HindIII, Например.

Термин «звездная активность» был введен Майером.^[2] кто охарактеризовал измененную активность в EcoRI.

внешняя ссылка

• Звездная активность - Биолаборатории Новой Англии
• Звездная активность (ослабление специфичности) - Ферментас
• Звездная активность рестрикционных ферментов - подробный список от TaKaRa
• Wei, H; Therrien, C; Бланшар, А; Гуань, S; Чжу, З (2008). «Индекс верности обеспечивает систематическое количественное определение звездной активности эндонуклеаз рестрикции ДНК». Исследования нуклеиновых кислот. 36 (9): e50. Дои:10.1093 / nar / gkn182. ЧВК  2396408. PMID  18413342.

Рекомендации

1. Робинсон, CR; Слайгер, С.Г. (1993). «Молекулярное распознавание, опосредованное связанной водой: механизм звездообразной активности рестрикционной эндонуклеазы EcoRI». Журнал молекулярной биологии. 234 (2): 302–306. Дои:10.1006 / jmbi.1993.1586. PMID  8230215.
2. Майер, Хуберт (1978). «Оптимизация EcoRI * -активности эндонуклеазы EcoRI». FEBS Lett. 90 (2): 341–44. Дои:10.1016/0014-5793(78)80400-1.