STARD5 - STARD5

STARD5
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSTARD5, Связанный с StAR домен переноса липидов, содержащий 5
Внешние идентификаторыOMIM: 607050 MGI: 2156765 ГомолоГен: 11346 Генные карты: STARD5
Расположение гена (человек)
Хромосома 15 (человек)
Chr.Хромосома 15 (человек)[1]
Хромосома 15 (человек)
Геномное расположение STARD5
Геномное расположение STARD5
Группа15q25.1Начинать81,309,053 бп[1]
Конец81,324,183 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE STARD5 213820 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_030574
NM_181900

NM_023377

RefSeq (белок)

NP_871629

NP_075866

Расположение (UCSC)Chr 15: 81.31 - 81.32 МбChr 7: 83.63 - 83.65 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Связанный со StAR белок-переносчик липидов 5 это белок что у людей кодируется STARD5 ген.[5][6] Белок 213 аминокислоты длинный, почти полностью состоящий из Перенос, связанный со StAR (START) домен. Он также является частью подсемейства белков START домена StarD4, разделяя 34% идентичности последовательности с STARD4.

Функция

Белок наиболее распространен в почках и печени, где он находится в Клетки Купфера.[5][7] STARD5 связывает холестерин и 25-гидроксихолестерин и, по-видимому, выполняет функцию перераспределения холестерина в эндоплазматический ретикулум с которым связывается белок и / или плазматическая мембрана.[5][8][9] Повышенный уровень StarD5 увеличивает свободный холестерин в клетке.[8]

Гомеостаз холестерина регулируется, по крайней мере частично, белками, связывающими регуляторный элемент стерола (SRE) (например, SREBP1 ) и Х-рецепторы печени (например., LXRA ). После истощения стеролов LXR неактивны, а SREBP расщепляются, после чего они связывают промоторные SRE и активируют гены, участвующие в биосинтезе и захвате холестерина. Транспорт стерола опосредуется везикулами или растворимыми белками-носителями, такими как стероидогенный белок острой регуляции (ЗВЕЗДА ). STAR гомологичен семейству белков, содержащих STAR-связанный домен переноса липидов (START) из 200–210 аминокислот, включая STARD5.[5][6]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции STARD5. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Звездный5tm1a (КОМП) Wtsi[15][16] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[17][18][19]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[13][20] Было проведено 24 испытания на гомозиготный мутант мышей, и наблюдалась одна значительная аномалия: аномальный позвоночный поперечные отростки.[13]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000172345 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000046027 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c d Soccio RE, Адамс RM, Романовски MJ, Sehayek E, Burley SK, Breslow JL (май 2002 г.). «Регулируемый холестерином ген StarD4 кодирует StAR-связанный белок-переносчик липидов с двумя близкородственными гомологами, StarD5 и StarD6». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (10): 6943–8. Дои:10.1073 / pnas.052143799. ЧВК  124508. PMID  12011452.
  6. ^ а б "Entrez Gene: STARD5 START домен, содержащий 5".
  7. ^ Родригес-Агудо Д., Рен С., Хилемон П.Б., Монтаньес Р., Редфорд К., Натараджан Р., Медина М.А., Гил Дж., Пандак В.М. (июнь 2006 г.). «Локализация холестерин-связывающего белка StarD5». Журнал липидных исследований. 47 (6): 1168–75. Дои:10.1194 / мл. M500447-JLR200. PMID  16534142.
  8. ^ а б Родригес-Агудо Д., Рен С., Хайлемон П. Б., Редфорд К., Натараджан Р., Дель Кастильо А., Гил Дж., Пандак В. М. (август 2005 г.). "Human StarD5, липид-связывающий белок, связанный с цитозольным StAR". Журнал липидных исследований. 46 (8): 1615–23. Дои:10.1194 / мл. M400501-JLR200. PMID  15897605.
  9. ^ Чен Ю.С., Мейер Р.К., Чжэн С., Кхундмири С.Дж., Ценг М.Т., Ледерер Э.Д., Эпштейн П.Н., Кларк Б.Дж. (август 2009 г.). «Стероидогенный острый регуляторный регулирующий домен белка 5, локализация и регуляция в почечных канальцах». Американский журнал физиологии. Почечная физиология. 297 (2): F380-8. Дои:10.1152 / ajprenal.90433.2008. ЧВК  2724253. PMID  19474188.
  10. ^ «Данные рентгенографии для Stard5». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  11. ^ "Сальмонелла данные о заражении для Stard5 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  12. ^ "Citrobacter данные о заражении для Stard5 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  13. ^ а б c Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
  14. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  15. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
  16. ^ "Информатика генома мыши".
  17. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт А.Ф., Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  18. ^ Долгин Е. (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  19. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247.
  20. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геномная биология. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.

дальнейшее чтение