SSR1 - SSR1

SSR1
Идентификаторы
Псевдонимы	SSR1, TRAPA, субъединица рецептора сигнальной последовательности 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 600868 MGI: 105082 ГомолоГен: 2368 Генные карты: SSR1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п24.3 Начните 7,268,306 бп[1] Конец 7,347,446 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 A3.3 Начните 37,966,605 бп[2] Конец 37,994,217 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • эндоплазматический ретикулум Биологический процесс • IRE1-опосредованный ответ развернутого белка • котрансляционный белок, направленный на мембрану • положительное регулирование пролиферации клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	6745	107513
Ансамбль	ENSG00000124783	ENSMUSG00000021427
UniProt	P43307	Q9CY50
RefSeq (мРНК)	NM_001292008 NM_003144	NM_025965 NM_001360842
RefSeq (белок)	NP_001278937 NP_003135	NP_080241 NP_001347771
Расположение (UCSC)	Chr 6: 7.27 - 7.35 Мб	Chr 13: 37.97 - 37.99 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Транслокон-ассоциированная белковая субъединица альфа это белок что у людей кодируется SSR1 ген.^[5]

Рецептор сигнальной последовательности (SSR) представляет собой гликозилированный эндоплазматический ретикулум (ER) мембранный рецептор связан с транслокация белков через мембрану ER. SSR состоит из 2 субъединиц, 34 кДа. гликопротеин кодируется этим геном и гликопротеином массой 22 кДа. Это порождает несколько мРНК виды в результате сложной альтернативы полиаденилирование. Этот ген необычен тем, что он использует массивы сигнальных последовательностей полиА, которые не являются каноническими.^[5]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000124783 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021427 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: рецептор сигнальной последовательности SSR1, альфа (транслокон-ассоциированный белок альфа)».

дальнейшее чтение

• Вэй М.Л., Крессвелл П. (1992). «Молекулы HLA-A2 в мутантной клетке, обрабатывающей антиген, содержат пептиды, производные от сигнальной последовательности». Природа. 356 (6368): 443–6. Bibcode:1992 Натур.356..443Вт. Дои:10.1038 / 356443a0. PMID  1557127. S2CID  4310708.
• Фогель Ф., Хартманн Э., Герлих Д., Рапопорт Т.А. (1991). «Сегрегация белка рецептора сигнальной последовательности в грубой мембране эндоплазматического ретикулума». Евро. J. Cell Biol. 53 (2): 197–202. PMID  1964414.
• Хартманн Э., Гёрлих Д., Костка С. и др. (1993). «Тетрамерный комплекс мембранных белков в эндоплазматическом ретикулуме» (PDF). Евро. J. Biochem. 214 (2): 375–81. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1993.tb17933.x. HDL:11858 / 00-001M-0000-0015-3BD2-F. PMID  7916687.
• Хартманн Э., Прен С (1994). «N-концевая область альфа-субъединицы комплекса TRAP имеет консервативный кластер отрицательных зарядов». FEBS Lett. 349 (3): 324–6. Дои:10.1016/0014-5793(94)00693-8. PMID  8050590. S2CID  42968119.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Ху Т, Гуань Т, Джерас Л. (1996). «Молекулярная и функциональная характеристика комплекса p62, сборки гликопротеинов комплекса ядерных пор». J. Cell Biol. 134 (3): 589–601. Дои:10.1083 / jcb.134.3.589. ЧВК  2120945. PMID  8707840.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Хирама Т., Миллер К.В., Кёффлер Л.П. (1999). «Транскрипты альфа-ассоциированного с транслоконом белка индуцируются колониестимулирующим фактором гранулоцитов-макрофагов и проявляют сложное альтернативное полиаденилирование». FEBS Lett. 455 (3): 223–7. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00885-6. PMID  10437777. S2CID  9426244.
• Ван Л., Добберштейн Б. (1999). «Олигомерные комплексы, участвующие в транслокации белков через мембрану эндоплазматического ретикулума». FEBS Lett. 457 (3): 316–22. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01075-3. PMID  10471800. S2CID  22341517.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чжан Х., Ли XJ, Мартин Д.Б., Эберсолд Р. (2003). «Идентификация и количественное определение N-связанных гликопротеинов с использованием химии гидразидов, метки стабильных изотопов и масс-спектрометрии». Nat. Биотехнология. 21 (6): 660–6. Дои:10.1038 / nbt827. PMID  12754519. S2CID  581283.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Ячейка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070. S2CID  8235923.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.