SSBP1 - SSBP1

SSBP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1S3O, 2DUD, 3ULL
Идентификаторы
Псевдонимы	SSBP1, Mt-SSB, SOSS-B1, SSBP, mtSSB, одноцепочечный ДНК-связывающий белок 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 600439 MGI: 1920040 ГомолоГен: 74462 Генные карты: SSBP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7q34 Начинать 141,738,334 бп[1] Конец 141,787,922 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 B1 Начинать 40,471,352 бп[2] Конец 40,484,700 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание одноцепочечной ДНК • связывание хроматина • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • митохондриальный матрикс • митохондриальный нуклеоид • внеклеточная экзосома • митохондрия • ядро клетки • нуклеоид Биологический процесс • Репликация ДНК • митохондриальная организация • морфогенез митохондрий • положительная регуляция активности геликазы • репликация митохондриальной ДНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6742	381760
Ансамбль	ENSG00000262771 ENSG00000106028	ENSMUSG00000029911
UniProt	Q04837	Q9CYR0
RefSeq (мРНК)	NM_001256510 NM_001256511 NM_001256512 NM_001256513 NM_003143	NM_001286663 NM_028358 NM_212468 NM_001364578
RefSeq (белок)	NP_001243439 NP_001243440 NP_001243441 NP_001243442 NP_003134	NP_001273592 NP_082634 NP_997633 NP_001351507
Расположение (UCSC)	Chr 7: 141.74 - 141.79 Мб	Chr 6: 40,47 - 40,48 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Одноцепочечный ДНК-связывающий белок, митохондриальный это белок что у людей кодируется SSBP1 ген.^[5][6]

Функция

SSBP 1 - это ген домашнего хозяйства, участвующий в митохондриальном биогенезе (Tiranti et al., 1995). [Предоставлено OMIM]^[6]

Смотрите также

• SSBP4

Рекомендации

1. ENSG00000106028 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000262771, ENSG00000106028 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029911 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Тиранти В., Росси Е., Руис-Каррильо А., Росси Дж., Рокки М., ДиДонато С., Зуффарди О., Зевиани М. (январь 1995 г.). «Хромосомная локализация митохондриального фактора транскрипции A (TCF6), одноцепочечного ДНК-связывающего белка (SSBP) и эндонуклеазы G (ENDOG), трех генов домашнего хозяйства человека, участвующих в митохондриальном биогенезе». Геномика. 25 (2): 559–64. Дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80058-Т. PMID  7789991.
6. «Ген Entrez: одноцепочечный ДНК-связывающий белок 1 SSBP1».

дальнейшее чтение

• Тиранти В., Рокки М., ДиДонато С., Зевиани М. (апрель 1993 г.). «Клонирование кДНК человека и крысы, кодирующих митохондриальный одноцепочечный ДНК-связывающий белок (SSB)». Ген. 126 (2): 219–25. Дои:10.1016 / 0378-1119 (93) 90370-I. PMID  8482537.
• Ян Ц., Курт У., Урбанке Ц., Кан Ц. (февраль 1997 г.). «Кристаллическая структура митохондриального одноцепочечного ДНК-связывающего белка с разрешением 2,4 А». Структурная биология природы. 4 (2): 153–7. Дои:10.1038 / nsb0297-153. PMID  9033597. S2CID  32634194.
• Шульц Р.А., Своп С.Дж., МакДэниел Л.Д., Чжан Б., Кун Э.С., Гарри Д.Д., Ли К., Уильямс Р.С. (февраль 1998 г.). «Дифференциальная экспрессия факторов репликации митохондриальной ДНК в тканях млекопитающих». Журнал биологической химии. 273 (6): 3447–51. Дои:10.1074 / jbc.273.6.3447. PMID  9452467.
• Спелбринк Дж. Н., Тойвонен Дж. М., Хаккаарт Г. А., Куркела Дж. М., Купер Н. М., Лехтинен С. К., Лекренье Н., Бэк Дж. В., Шпейер Д., Фори Ф., Якобс Х. Т. (август 2000 г.). «Функциональный анализ in vivo митохондриальной ДНК-полимеразы человека POLG, экспрессируемой в культивируемых клетках человека». Журнал биологической химии. 275 (32): 24818–28. Дои:10.1074 / jbc.M000559200. PMID  10827171.
• Мюллер-Хёкер Дж., Шефер С., Ли К. (сентябрь 2001 г.). «Иммуноцитохимическая локализация митохондриального одноцепочечного ДНК-связывающего белка в богатых митохондриями клетках нормальной и неопластической ткани человека». Прикладная иммуногистохимия и молекулярная морфология. 9 (3): 276–80. Дои:10.1097/00022744-200109000-00013. PMID  11556757.
• Такамацу К., Умеда С., Осато Т., Оно Т., Абэ Й., Фукуо А., Шинагава Х., Хамасаки Н., Кан Д. (май 2002 г.). «Регулирование митохондриальных D-петель с помощью фактора транскрипции А и одноцепочечного ДНК-связывающего белка». Отчеты EMBO. 3 (5): 451–6. Дои:10.1093 / embo-reports / kvf099. ЧВК  1084112. PMID  11964388.
• Чен Л., Сегал Д., Хукриеде Н.А., Подтелейников А.В., Баярсайхан Д., Кеннисон Дж. А., Огрызко В.В., Давид И.Б., Вестфаль Х. (октябрь 2002 г.). «Белки Ssdp взаимодействуют с LIM-домен-связывающим белком Ldb1, чтобы регулировать развитие». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (22): 14320–5. Дои:10.1073 / pnas.212532399. ЧВК  137882. PMID  12381786.
• Diez-Tascón C, Dodds KG, Crawford AM (декабрь 2002 г.). «Картирование связывания одноцепочечного ДНК-связывающего белка 1 овцы (SSBP1) с использованием микросателлитного маркера OARCDT7». Генетика животных. 33 (6): 468. Дои:10.1046 / j.1365-2052.2002.00938_1.x. PMID  12464025.
• Баярсайхан Д. (сентябрь 2002 г.). «Ген SSDP1 кодирует белок с консервативным N-концевым доменом FORWARD». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Белки и протеомика. 1599 (1–2): 152–5. Дои:10.1016 / с1570-9639 (02) 00376-х. PMID  12479417.
• Pocernich CB, Poon HF, Boyd-Kimball D, Lynn BC, Nath A, Klein JB, Butterfield DA (февраль 2005 г.). «Протеомный анализ окислительно модифицированных белков, индуцированных митохондриальным токсином 3-нитропропионовой кислотой в человеческих астроцитах, экспрессирующих белок tat ВИЧ». Исследование мозга. Молекулярные исследования мозга. 133 (2): 299–306. Дои:10.1016 / j.molbrainres.2004.10.024. PMID  15710247.