SRGAP3 - SRGAP3

SRGAP3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1AM4, 1ГРН, 1OW3, 1RGP, 1TX4, 2NGR
Идентификаторы
Псевдонимы	SRGAP3, ARHGAP14, MEGAP, SRGAP2, WRP, SLIT-ROBO Rho GTPase, активирующий белок 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 606525 MGI: 2152938 ГомолоГен: 56686 Генные карты: SRGAP3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3п25.3 Начинать 8,980,591 бп[1] Конец 9,363,053 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 E3 Начинать 112,717,971 бп[2] Конец 112,947,266 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание Rac GTPase • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • отрицательное регулирование миграции клеток • регуляция передачи сигнала, опосредованного малой GTPase • преобразование сигнала • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9901	259302
Ансамбль	ENSG00000196220	ENSMUSG00000030257
UniProt	O43295	Q812A2
RefSeq (мРНК)	NM_001033116 NM_001033117 NM_014850	NM_080448 NM_153070
RefSeq (белок)	NP_001028289 NP_055665	NP_536696
Расположение (UCSC)	Chr 3: 8.98 - 9.36 Мб	Chr 6: 112,72 - 112,95 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

SLIT-ROBO Rho GTPase-активирующий белок 3 является фермент что у людей кодируется SRGAP3 ген.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196220 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030257 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Эндрис В., Вогацкий Б., Леймер Ю., Бартч Д., Затыка М., Латиф Ф., Махер Э. Р., Таривердиан Г., Кирш С., Карч Д., Раппольд Г. А. (сентябрь 2002 г.). «Новый ген, активирующий Rho-GTPase MEGAP / srGAP3, предположительно играет роль в тяжелой умственной отсталости». Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (18): 11754–9. Дои:10.1073 / pnas.162241099. ЧВК  129341. PMID  12195014.
6. «Ген Entrez: SRGAP3 SLIT-ROBO Rho GTPase, активирующий белок 3».

дальнейшее чтение

• Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Н. и др. (2003). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Res. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID  12168954.
• Исикава К., Нагасе Т., Накадзима Д. и др. (1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VIII. 78 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 4 (5): 307–13. Дои:10.1093 / днарес / 4.5.307. PMID  9455477.
• Хиросава М., Нагасе Т., Исикава К. и др. (2000). «Характеристика клонов кДНК, выбранных с помощью анализа GeneMark из фракционированных по размеру библиотек кДНК головного мозга человека». ДНК Res. 6 (5): 329–36. Дои:10.1093 / днарес / 6.5.329. PMID  10574461.
• Вонг К., Рен XR, Хуанг YZ и др. (2001). «Сигнальная трансдукция в миграции нейронов: роли белков, активирующих GTPase, и малой GTPase Cdc42 в пути Slit-Robo». Клетка. 107 (2): 209–21. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00530-X. PMID  11672528. S2CID  2458943.
• Olave I, Wang W, Xue Y и др. (2002). «Идентификация полиморфного нейрон-специфического ремоделирующего комплекса хроматина». Genes Dev. 16 (19): 2509–17. Дои:10.1101 / gad.992102. ЧВК  187451. PMID  12368262.
• Содерлинг С.Х., Биннс К.Л., Уэйман Г.А. и др. (2003). «Компонент WRP комплекса WAVE-1 ослабляет передачу сигналов, опосредованную Rac». Nat. Cell Biol. 4 (12): 970–5. Дои:10.1038 / ncb886. PMID  12447388. S2CID  1423222.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Като М, Като М (2004). «Ген FNBP2 на хромосоме 1q32.1 человека кодирует белок семейства ARHGAP с доменами FCH, FBH, RhoGAP и SH3». Int. J. Mol. Med. 11 (6): 791–7. Дои:10.3892 / ijmm.11.6.791. PMID  12736724.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Ян Й., Марчелло М., Эндрис В. и др. (2006). «MEGAP препятствует миграции клеток, регулируя динамику актина и микротрубочек, а также образование фокальных комплексов». Exp. Cell Res. 312 (12): 2379–93. Дои:10.1016 / j.yexcr.2006.04.001. PMID  16730001.