SRGAP2 - SRGAP2

SRGAP2
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSRGAP2, ARHGAP34, FNBP2, SRGAP2A, SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase, активирующий белок 2
Внешние идентификаторыOMIM: 606524 MGI: 109605 ГомолоГен: 52683 Генные карты: SRGAP2
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение для SRGAP2
Геномное расположение для SRGAP2
Группа1q32.1Начинать206,203,345 бп[1]
Конец206,464,443 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

23380

14270

Ансамбль

ENSG00000266028

ENSMUSG00000026425

UniProt

O75044

Q91Z67

RefSeq (мРНК)

NM_001081011
NM_019520

RefSeq (белок)

NP_001074480

Расположение (UCSC)Chr 1: 206,2 - 206,46 МбChr 1: 131.29 - 131.53 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

SLIT-ROBO Rho GTPase-активирующий белок 2 (srGAP2), также известный как формин-связывающий белок 2 (FNBP2), это млекопитающее белок что у людей кодируется SRGAP2 ген.[5][6] Он участвует в миграция нейронов и дифференциация[7] и играет важную роль в синаптическое развитие,[8] масса мозга и количество корковый нейроны.[9] Подавление srGAP2 ингибирует межклеточное отталкивание и увеличивает продолжительность межклеточного контакта.

SRGAP2 димеризуется через его F-BAR домен.[10] SRGAP2C, сокращенная версия, найденная в ранних гоминины а люди, у которых есть только домен F-BAR, противодействуют его действию. Он замедляет созревание некоторых нейронов и увеличивает плотность нейронального шипа.[10]

Эволюция

SRGAP2 один из 23 генов, которые, как известно, дублируются у людей, но не другие приматы.[11] SRGAP2 был дублирован трижды в человеческий геном в последние 3,4 миллиона лет: одно повторение 3,4 миллиона лет назад (млн лет назад), называемое SRGAP2B, а затем два, которые скопировали SRGAP2B 2,4 млн лет назад в SRGAP2C и ~ 1 млн лет назад в SRGAP2D. Все три дубликата также присутствуют в Денисовцы и Неандертальцы.[12] Их укорачивают таким же образом, сохраняя F-бокс домен, но отказавшись от RhoGAP и SH3 домены.[13] Все люди обладают SRGAP2C.[14] SRGAP2C подавляет функцию предковой копии, SRGAP2A, путем гетеродимеризации и обеспечивает более быструю миграцию нейронов, вмешиваясь в филоподия производство, а также замедление скорости созревания синапсов и увеличение плотности синапсов в кора головного мозга.[8] SRGAP2B экспрессируется на очень низких уровнях, а SRGAP2D является псевдоген. Не у всех людей есть SRGAP2B или SRGAP2D.[13]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000266028 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026425 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Мадура Т., Ямасита Т., Кубо Т., Цудзи Л., Хосокава К., Тохьяма М. (апрель 2004 г.). «Изменения мРНК Slit-Robo GTPase-активирующего белка 2 после перерезки лицевого нерва». Исследование мозга. Молекулярное исследование мозга. 123 (1–2): 76–80. Дои:10.1016 / j.molbrainres.2004.01.002. PMID  15046868.
  6. ^ Wong K, Ren XR, Huang YZ, Xie Y, Liu G, Saito H, Tang H, Wen L, Brady-Kalnay SM, Mei L, Wu JY, Xiong WC, Rao Y (октябрь 2001 г.). «Сигнальная трансдукция в миграции нейронов: роли белков, активирующих GTPase, и малой GTPase Cdc42 в пути Slit-Robo». Клетка. 107 (2): 209–21. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00530-X. PMID  11672528.
  7. ^ Guerrier S, Coutinho-Budd J, Sassa T, Gresset A, Jordan NV, Chen K, Jin WL, Frost A, Polleux F (сентябрь 2009 г.). «Домен F-BAR srGAP2 индуцирует выступы мембраны, необходимые для миграции нейронов и морфогенеза». Клетка. 138 (5): 990–1004. Дои:10.1016 / j.cell.2009.06.047. ЧВК  2797480. PMID  19737524.
  8. ^ а б Charrier C, Joshi K, Coutinho-Budd J, Kim JE, Lambert N, de Marchena J, Jin WL, Vanderhaeghen P, Ghosh A, Sassa T, Polleux F (май 2012 г.). «Ингибирование функции SRGAP2 его паралогами, специфичными для человека, вызывает неотению во время созревания позвоночника». Клетка. 149 (4): 923–35. Дои:10.1016 / j.cell.2012.03.034. ЧВК  3357949. PMID  22559944.
  9. ^ Тивари, Б.К. (2016). «Эволюция гена SRGAP2 связана с интеллектом у млекопитающих». Центр биомедицины. Каргер. 1 (1). Дои:10.1159/000443947.
  10. ^ а б Чанг, Синь-Ю. "Что за обезьяна". Блог InterPro. Получено 27 марта 2019.
  11. ^ Судмант PH, Кицман Дж.О., Антоначчи Ф., Алкан С., Малиг М., Цаленко А., Сампас Н., Брун Л., Шендуре Дж, Эйхлер Э. (октябрь 2010 г.). «Разнообразие вариаций числа копий человека и многокопийность генов». Наука. 330 (6004): 641–6. Bibcode:2010Sci ... 330..641S. Дои:10.1126 / science.1197005. ЧВК  3020103. PMID  21030649.
  12. ^ Мартинс, Педро Тьяго; Мари, Матиес; Бёкс, Седрик (01.01.2018). «SRGAP2 и постепенная эволюция факультета современного человеческого языка». Журнал эволюции языка. 3 (1): 67–78. Дои:10.1093 / jole / lzx020. ISSN  2058-4571.
  13. ^ а б Sporny, M; Guez-Haddad, J; Kreusch, A; Шакарци, С; Незнанский, А; Крест, А; Исупов, М.Н. Qualmann, B; Кессельс, ММ; Опатовский Ю. (1 июня 2017 г.). «Структурная история человеческих белков SRGAP2». Молекулярная биология и эволюция. 34 (6): 1463–1478. Дои:10.1093 / molbev / msx094. ЧВК  5435084. PMID  28333212.
  14. ^ Dennis MY, Nuttle X, Sudmant PH, Antonacci F, Graves TA, Nefedov M, Rosenfeld JA, Sajjadian S, Malig M, Kotkiewicz H, Curry CJ, Shafer S, Shaffer LG, de Jong PJ, Wilson RK, Eichler EE (май 2012). «Эволюция человеческих нейральных генов SRGAP2 путем неполной сегментарной дупликации». Клетка. 149 (4): 912–22. Дои:10.1016 / j.cell.2012.03.033. ЧВК  3365555. PMID  22559943. Сложить резюме – sciencenews.org.

внешняя ссылка