SPOCK2 - SPOCK2

SPOCK2
Идентификаторы
Псевдонимы	SPOCK2, testican-2, sparc / остеонектин, cwcv и kazal-подобные домены, протеогликан (testican) 2, SPARC / остеонектин, cwcv и kazal-подобные домены, протеогликан 2, SPARC (остеонектин), cwcv и kazal-подобные домены протеогликана 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 607988 MGI: 1891351 ГомолоГен: 8854 Генные карты: SPOCK2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q22.1 Начинать 72,059,034 бп[1] Конец 72,089,032 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 B4 Начинать 60,106,219 бп[2] Конец 60,135,198 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • связывание гликозаминогликанов • связывание внеклеточного матрикса • активность ингибитора металлоэндопептидазы • связывание коллагена Сотовый компонент • внеклеточная область • внеклеточный матрикс • внеклеточный Биологический процесс • регулирование дифференцировки клеток • сборка синапсов • сшивание пептида через хондроитин-4-сульфат гликозаминогликан • организация внеклеточного матрикса • преобразование сигнала • положительное регулирование адгезии клетки к субстрату • отрицательная регуляция активности эндопептидазы • положительная регуляция подвижности клеток • клеточный ответ на фактор ингибирования лейкемии Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9806	94214
Ансамбль	ENSG00000107742	ENSMUSG00000058297
UniProt	Q92563	Q9ER58
RefSeq (мРНК)	NM_001134434 NM_001244950 NM_014767	NM_052994
RefSeq (белок)	NP_001127906 NP_001231879 NP_055582	NP_443720
Расположение (UCSC)	Chr 10: 72.06 - 72.09 Мб	Chr 10: 60.11 - 60.14 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Тестикан-2 это белок что у людей кодируется SPOCK2 ген.^[5][6]

Функция

Протеогликаны, которые состоят из основного белка и ковалентно связанных гликозаминогликанов, являются компонентами внеклеточного матрикса. SPOCK2 кодирует члена нового семейства Ca (2 +) - связывающих протеогликанов. [Поставляется OMIM]^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000107742 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058297 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Vannahme C, Schübel S, Herud M, Gösling S, Hülsmann H, Paulsson M, Hartmann U, Maurer P (июль 1999 г.). «Молекулярное клонирование тестикана-2: определение нового семейства кальций-связывающих протеогликанов, экспрессируемых в головном мозге». Журнал нейрохимии. 73 (1): 12–20. Дои:10.1046 / j.1471-4159.1999.0730012.x. PMID  10386950. S2CID  21955542.
6. «Ген Entrez: SPOCK2 sparc / остеонектин, cwcv и kazal-подобные домены, протеогликан (тестикан) 2».

дальнейшее чтение

• Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Охира М., Каварабаяси И., Охара О, Танака А., Котани Х., Миядзима Н., Номура Н. (октябрь 1996 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VI. Кодирующие последовательности 80 новых генов (KIAA0201-KIAA0280), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток KG-1 и мозга». ДНК исследования. 3 (5): 321–9, 341–54. Дои:10.1093 / днарес / 3.5.321. PMID  9039502.
• Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (ноябрь 2002 г.). «Белковые взаимодействия между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК». Геномные исследования. 12 (11): 1773–84. Дои:10.1101 / гр. 406902. ЧВК  187542. PMID  12421765.
• Накада М., Миямори Х., Ямасита Дж., Сато Х. (июнь 2003 г.). «Testican 2 отменяет ингибирование матричных металлопротеиназ мембранного типа другими белками семейства тестиканов». Исследования рака. 63 (12): 3364–9. PMID  12810672.
• Кларк Х.Ф., Гурни А.Л., Абая Э., Бейкер К., Болдуин Д., Кисть Дж., Чен Дж., Чоу Б., Чуи С., Кроули С., Керрелл Б., Деуэл Б., Дауд П., Итон Д., Фостер Дж., Гримальди К., Гу Q , Hass PE, Heldens S, Huang A, Kim HS, Klimowski L, Jin Y, Johnson S, Lee J, Lewis L, Liao D, Mark M, Robbie E, Sanchez C, Schoenfeld J, Seshagiri S, Simmons L, Singh Дж., Смит В., Стинсон Дж., Вагтс А., Вандлен Р., Ватанабе С., Вианд Д., Вудс К., Се М. Х., Янсура Д., Йи С, Ю Дж, Юань Дж, Чжан М, Чжан З, Годдард А., Вуд В. И., Годовски П., Грей А. (октябрь 2003 г.). «Инициатива по открытию секретируемого белка (SPDI), широкомасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: биоинформатическая оценка». Геномные исследования. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Zhang Z, Henzel WJ (октябрь 2004 г.). «Прогнозирование сигнального пептида на основе анализа экспериментально подтвержденных сайтов расщепления». Белковая наука. 13 (10): 2819–24. Дои:10.1110 / пс. 04682504. ЧВК  2286551. PMID  15340161.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.