SPOCK1 - SPOCK1

SPOCK1
Идентификаторы
Псевдонимы	SPOCK1, SPOCK, TESTICAN, TIC1, sparc / остеонектин, cwcv и kazal-подобные домены, протеогликан (testican) 1, SPARC / остеонектин, cwcv и kazal-подобные домены, протеогликан 1, SPARC (остеонектин), cwcv и kazal-подобные домены, протеогликан
Внешние идентификаторы	OMIM: 602264 MGI: 105371 ГомолоГен: 80193 Генные карты: SPOCK1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q31.2 Начинать 136,975,298 бп[1] Конец 137,598,379 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 B1 Начинать 57,421,195 бп[2] Конец 57,908,332 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • активность ингибитора эндопептидазы цистеинового типа • активность ингибитора металлоэндопептидазы • активность ингибитора эндопептидазы серинового типа • связывание коллагена • связывание внеклеточного матрикса Сотовый компонент • цитоплазма • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • нервномышечное соединение • узел Ранвье • внеклеточная область • саркоплазма • внеклеточный Биологический процесс • отрицательная регуляция адгезии клетки к субстрату • нейрогенез • негативная регуляция развития проекции нейронов • миграция нейронов • развитие нервной системы • клеточная адгезия • регулирование роста клеток • дифференциация нейронов центральной нервной системы • преобразование сигнала • отрицательная регуляция активности эндопептидазы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6695	20745
Ансамбль	ENSG00000152377	ENSMUSG00000056222
UniProt	Q08629	Q62288
RefSeq (мРНК)	NM_004598	NM_001166463 NM_001166464 NM_001166465 NM_001166466 NM_009262
RefSeq (белок)	NP_004589	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 5: 136.98 - 137.6 Мб	Chr 13: 57.42 - 57.91 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Тестикан-1 это белок что у людей кодируется SPOCK1 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует белковое ядро ​​семенной плазмы. протеогликан содержащие хондроитин- и гепарансульфатные цепи. Функция белка изучается, хотя он принадлежит к тому же семейству гликопротеинов, что и SPARC. Считается, что он похож на цистеин тиреопинового типа. ингибиторы протеазы предполагает, что его функция может быть связана с ингибированием протеазы.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000152377 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056222 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Шарбонье Ф., Перин Дж. П., Маттей М.Г., Камузат А., Бонне Ф., Грессен Л., Аллиэль П.М. (июнь 1998 г.). «Геномная организация человеческого гена SPOCK и его хромосомная локализация в 5q31». Геномика. 48 (3): 377–80. Дои:10.1006 / geno.1997.5199. PMID  9545645.
6. «Ген Entrez: SPOCK1 sparc / остеонектин, cwcv и kazal-подобные домены, протеогликан (тестикан) 1».

дальнейшее чтение

• Перин Дж. П., Аллиель П. М., Жолл П., Бонне Ф (1994). «Протеогликаны мужского репродуктивного тракта». EXS. 70: 191–7. Дои:10.1007/978-3-0348-7545-5_11. ISBN  978-3-0348-7547-9. PMID  7507743.
• Шарбонье Ф., Перин Дж. П., Руссель Г. и др. (1997). «[Клонирование яичек / SPOCK у человека и мыши. Перспективы нервно-мышечной экспрессии в патологии]». C. R. Séances Soc. Биол. Fil. 191 (1): 127–33. PMID  9181134.
• Alliel PM, Perin JP, Jollès P, Bonnet FJ (1993). «Тестикан, многодоменный протеогликан яичек, напоминающий модуляторы социального поведения клеток». Евро. J. Biochem. 214 (1): 347–50. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1993.tb17930.x. PMID  8389704.
• Бонне Ф, Перин Дж. П., Шарбонье Ф. и др. (1996). «Структура и клеточное распределение яичек мозга мыши. Ассоциация с постсинаптической зоной пирамидных клеток гиппокампа». J. Biol. Chem. 271 (8): 4373–80. Дои:10.1074 / jbc.271.8.4373. PMID  8626787.
• Marr HS, Basalamah MA, Edgell CJ (1998). «Экспрессия мРНК яичек в эндотелиальных клетках». Эндотелий. 5 (3): 209–19. Дои:10.3109/10623329709053399. PMID  9272383.
• Kohfeldt E, Maurer P, Vannahme C, Timpl R (1997). «Свойства модуля связывания внеклеточного кальция протеогликана тестикана». FEBS Lett. 414 (3): 557–61. Дои:10.1016 / S0014-5793 (97) 01070-3. PMID  9323035. S2CID  25552375.
• Марр Х.С., Базалама М.А., Боулдин Т.В. и др. (2001). «Распределение экспрессии яичек в мозге человека». Клеточная ткань Res. 302 (2): 139–44. Дои:10.1007 / s004410000277. PMID  11131125. S2CID  9937680.
• BaSalamah MA, Marr HS, Duncan AW, Edgell CJ (2001). «Тестикан в крови человека». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 283 (5): 1083–90. Дои:10.1006 / bbrc.2001.4900. PMID  11355883.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Накада М, Миямори Х, Ямасита Дж, Сато Х (2003). «Testican 2 отменяет ингибирование матричных металлопротеиназ мембранного типа другими белками семейства тестиканов». Рак Res. 63 (12): 3364–9. PMID  12810672.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Шмутц Дж., Мартин Дж., Терри А. и др. (2004). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 5 человека». Природа. 431 (7006): 268–74. Дои:10.1038 / природа02919. PMID  15372022.
• Prenzel KL, Warnecke-Eberz U, Xi H, et al. (2006). «Значительная сверхэкспрессия мРНК SPARC / остеонектина при раке поджелудочной железы по сравнению с раком сосочка Фатера». Онкол. Представитель. 15 (5): 1397–401. Дои:10.3892 / или 15.5.1397. PMID  16596217.