SMU1 - SMU1

SMU1
Идентификаторы
Псевдонимы	SMU1, BWD, SMU-1, fSAP57, супрессор smu-1 гомолога mec-8 и unc-52 (C. elegans), регулятор репликации ДНК и сплайсосомный фактор, регулятор репликации ДНК и сплайсосомный фактор, регулятор репликации ДНК SMU1 и сплайсосомальный фактор
Внешние идентификаторы	OMIM: 617811 MGI: 1915546 ГомолоГен: 10079 Генные карты: SMU1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9п21.1 Начинать 33,041,765 бп[1] Конец 33,076,674 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • ядерное пятнышко • ядро клетки • Предкаталитическая сплайсосома типа U2 Биологический процесс • регуляция альтернативного сплайсинга мРНК через сплайсосомы • обработка мРНК • Сплайсинг РНК • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55234	74255
Ансамбль	ENSG00000122692	ENSMUSG00000028409
UniProt	Q2TAY7	Q3UKJ7
RefSeq (мРНК)	NM_018225	NM_021535
RefSeq (белок)	NP_060695 NP_060695.2	NP_067510
Расположение (UCSC)	Chr 9: 33.04 - 33.08 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, содержащий повтор WD40, SMU1 это белок что у людей кодируется SMU1 ген.^[4][5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000122692 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Spike CA, Shaw JE, Herman RK (июль 2001 г.). «Анализ smu-1, гена, который регулирует альтернативный сплайсинг пре-мРНК unc-52 у Caenorhabditis elegans». Mol Cell Biol. 21 (15): 4985–95. Дои:10.1128 / MCB.21.15.4985-4995.2001. ЧВК  87225. PMID  11438655.
5. Ди Бенедетто А.Дж., Клик Стоддард Дж., Главан Б.Дж. (июнь 2001 г.). «Клонирование и молекулярная характеристика нового гена, кодирующего белок WD-повтора, экспрессируемый в ограниченных областях мозга взрослых крыс». Ген. 271 (1): 21–31. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00483-8. PMID  11410362.
6. "Entrez Gene: SMU1 smu-1 супрессор mec-8 и гомолог unc-52 (C. elegans)".

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Хамфрей С.Дж., Оливер К., Хант А.Р. и др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 9 человека». Природа. 429 (6990): 369–74. Дои:10.1038 / природа02465. ЧВК  2734081. PMID  15164053.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Фикарро С.Б., Саломон А.Р., Брилл Л.М. и др. (2005). «Автоматическая аффинная хроматография с иммобилизованным металлом / наножидкостная хроматография / масс-спектрометрическая платформа с ионизацией электрораспылением для профилирования сайтов фосфорилирования белков». Rapid Commun. Масс-спектрометрия. 19 (1): 57–71. Дои:10.1002 / RCM.1746. PMID  15570572.
• Хига Л.А., Ву М., Е Т. и др. (2006). «Убиквитинлигаза CUL4-DDB1 взаимодействует с множеством белков WD40-повторов и регулирует метилирование гистонов». Nat. Cell Biol. 8 (11): 1277–83. Дои:10.1038 / ncb1490. HDL:10397/34293. PMID  17041588. S2CID  22180568.